Zmall Pharma

Новиопы и захохлы пишут огромные статьи в педивикии про "вторжение России на Украину", но ни одна проблядь даже не упомянула, что бактериофаг ΦX174, являющийся модельным объектом в молекулярной биологии, открыл великий русский учёный - Николай Афанасьевич Булгаков, брат великого русского писателя Михаила Булгакова.

#Фотожаб блотов в статьях это дело, конечно понятное. Но на сайте, собственно, производителя антител? Термо, ты офигел.

Нашел Sholto David

Сегодня я стал ещё больше ненавидеть фудкорты в ТЦ.
Значит прихожу я, солидный русский гигачад, поесть блинчиков со сметаной в Теремок, и понимаю - а сесть-то мне некуда!
И ладно бы там, если бы всё было обсажено малолетками (воскресенье всё-таки), так нет же - какие-то толпы замоташек с пустыми столами, тупо пиздят в видеозвонкам.
Сегодня заметил ещё почти краснокнижный вид долбоёбов - занимашек. Это такие дебичи, которые "занимают" стол, ставя туда сумку или безделушку. В клинических случаях оставляют мобильник. И упёздывают куда-то по своим делам, возможно превращаясь на это время в жуёб, которые начинают, с бесконечными бее-мее-эээ выбирать еду только тогда, когда их очередь на кассу уже подошла.

Эксперименты в эпоху фоллаута

Когда уляжется пыль от ядерных грибов или ветер рассеет аэрозоли с вирусными частицами в лабу-то все равно придется идти. Конец света - не повод не капать!

Вот подборка методов, которые будут полезны в постапокалипсисе:

Электрофорез
1. Чем заменить SDS при гель-электрофорезе в денатурирующих условиях. Ссылка.
2. Электрофорез в крахмале - доступная среда для разделения белков и нуклеиновых кислот. Ссылка.
3. Электрофорез в холодце - когда закончились агароза, акриламид и крахмал. Ссылка.
4. Документирование полосок на геле на лавсановой пленке. Ссылка.
5. Повторное использование отмывочного раствора. Ссылка.
6. Форезница из контейнера для еды. Ссылка.
7. Форезница из полиэтиленового пакета. Ссылка.

Хроматография
1. Как приготовить агарозный сорбент. Ссылка.
2. Самодельные колонки. Ссылка, и еще ссылка и еще одна

ПЦР и ДНК
1. Амплификатор из лампочки - поможет пережить утрату биорадовских термоциклеров. Ссылка.
2. Амплификатор из микротермисторов и коробки из-под дискет. Ссылка.
3. Как регенерировать и повторно использовать колонки для выделения плазмид. Ссылка.
4. Генная пушка с настоящими патронами. Ссылка.

Рутинные лабораторные штуки
1. Дозирование микрообъемов без пипеток с помощью хитрой спиральки. Ссылка.
2. Как изготовить колбу из лампочки. Ссылка.
3. Культивирование на среде без автоклавирования. Ссылка.
4. Диализ на сосисочных оболочках. Ссылка.
5. Как охладить растворы без холодильника. Ссылка.
6. Как откручивать без центрифуги. Ссылка.
7. Культивирование суспензионных клеток в многоразовой посуде. Ссылка.
8. Простой гомогенизатор для зерна. Ссылка.
9. Штатив без 3Д принтера. Ссылка.
10. Исследование иммунных реакций без ИФА. Ссылка.

Разное-интересное
1. Биопластик из молока. Ссылка.
2. Пуговицы из крови. Ссылка
3. Доступный источник протеаз. Ссылка.
4.Простой способ получения гликогена. Ссылка.
5. Как из сбербанковского слитка получить хлорид золота (III) для синтеза наночастиц. Ссылка.

Энжойте!

Если смотреть лекцию про дифференцирование задом наперёд то научишься интегрировать

Постите ваших котиков в комменты :3

Эти короткие ORFs – это возможно, именно то, что эволюционные биологи называют «ранними стадиями рождения белков». Они нестабильны, функционально ещё «не уверены», но уже попали в поле естественного отбора.

Наука в очередной раз выяснила - в Жизни всё сложно

Если спросить простого советского биолога: сколько белков закодировано в геноме человека? то он начнёт уверенно отвечать: около двадцати тысяч кодирующих генов... учитываем сплайсинг, альтернативные промоторы, пост-трансляционные модификации, вотэтовсё...

...но масштабное исследование, только что опубликованное в Nature ⬅️ показывает: даже прежняя картина была слишком простой, чтобы оказаться правдой 🤓

В геноме нашли тысячи коротких участков, которые раньше не считались полноценными генами, но всё же могут считываться рибосомой и собираться в аминокислотные последовательности. Это не обязательно "белки" в привычном смысле (как стабильные молекулярные машины с понятной функцией) - но реальные продукты трансляции, которые клетка может производить, разрушать, использовать в каких-то особых состояниях. Самое сильное - не сенсационный заход "британские учёные нашли тысячи новых генов". Напротив, авторы очень аккуратны: они предлагают новые промежуточные категории microproteins и peptideins, это такие продукты трансляции, которые уже нельзя игнорировать как шум (но и рано объявлять полноценными белками).

В работе проверили более 7 тысяч (!) неканонических ORFs (Open Reading Frames, коротких рамок считывания) за пределами устоявшейся аннотации - и оказалось:
🔹четверть из них оставляют заметный след в протеомных данных - их фрагменты можно увидеть среди массы пептидов, которые наполняют клетки, а значит они активно участвуют в биохимических и сигнальных реакциях,
🔹многие "предъявляются" на HLA-молекулах - т.е. они доходят до уровня, на котором иммунная система может их заметить; это очень важно для практического биомеда и конкретно для онко-иммунологии - если опухоль "показывает" такие пептиды на HLA, они могут подсказать новые мишени для антител, вакцин, клеточной терапии,
🔹далее, это интереснейший материал для фундаментальной биологии; возможно, в лице таких фрагментов мы видим ранние стадии рождения белков - в т.ч. с новыми структурами и функциями - ещё "не уверенных", но уже попавших в поле эволюции.

Новые инсайды для важнейших вопросов Науки: устройства иммунитета, развития рака, эволюции генов - и в целом понимания того, где проходит граница между и "черновиками" и "чистовиками" в книге Жизни 🧬

Настоящими словами являются только те, которые произнесены или написаны на территории Словакии или Словении, все остальные просто игристые лексемы.

Новый релиз FragalyseQt - 0.5.2

Что это такое:

свободный (AGPLv3) и кроссплатформенный (Linux, macOS, *BSD, Windows - x86, ARM, RISC-V, работает всё) софт для неизвазивного (исходные файлы НЕ ИЗМЕНЯЮТСЯ) анализа данных капиллярного электрофореза, способный обрабатывать результаты, независимо от того, на каком оборудовании они было получены (поддерживаются даже древние и недокументированные версии ABIF), а также корректировать базовую линию, подавлять шумы, проодить сайзколлинг фрагментов, бинирование аллелей, фильтрацию статтеров, поддерживая панели GeneMapper, GeneMarker и NCBI OSIRIS.

В этом релизе:
- интеграция SOAP API для возможности интеграции с LIMS, автоматизации и использования с веб-инструментами,
- пакетная обработка и экспорт данных,
- сохранение и переоткрытие сессий с использованием SQLite DB (append-only, в следующей версии - PostgreSQL & ImmuDB).

Репозиторий: github.com/Dorif/fragalyseqt
Релиз: github.com/Dorif/fragalyseqt/releases/tag/southern_soap_db

P.S.: отдельные благодарности коллегам из @webhostmost и моей семье.
____

What's this:

free (AGPLv3)and crossplatform (Linux, macOS, *BSD, Windows, x86, ARM, RISC-V - proven to work) soft for non-invasive capillary electrophoresis data analysis, capable f handling CE data inependently from machine they were obtained at (even extremely old and undocumented versions of ABIF are supported), corresct baseline, denoise signal, sizecall fragments, bin alleles, filter stutters and supports panel definitions from GeneMapper, GeneMarker and NCBI OSIRIS.

In this release:

- batch processing and export,
- SOAP API for integration with LIMS, automation and web based tools,
- SQLite DB integration for session storage and restore (append-only, PostgreSQL and ImmuDB coming in next release).

Repo: github.com/Dorif/fragalyseqt
Release: github.com/Dorif/fragalyseqt/releases/tag/southern_soap_db

P.S.: special thanks to my colleagues from @webhostmost and my family

#foss #fragalyseqt

Патология спины | Нейрохирург Василий Королишин

В этом выпуске подкаста Медача мы обсудим боль в спине и патологию спины с точки зрения нейрохирургии.
Правда ли что мы расплачиваемся болью за прямохождение? У всех ли с болью в пояснице есть грыжа диска? Как отличить мышечный спазм от корешкового синдрома? Когда нужно делать МРТ? Какие непрофильные симптомы должны насторожить терапевта, кардиолога или абдоминального хирурга?

Поговорим мы также про дегенеративные заболевания позвоночника, сколиоз и нарушения осанки. Не обойдем стороной и нестабильность шейных позвонков, фораминальный стеноз и нейрогенную боль, а также узнаем про методы лечения, в том числе эндоскопическую и микрохирургическую декомпрессию, эндопротезирование межпозвонкового диска, спинальную и эпидуральную анестезию.

Гость — к.м.н. врач-нейрохирург Василий Александрович Королишин. Ведущий — Сергей Ткачев, основатель проекта Медач.

Смотрите и слушайте на всех доступных платформах 🎙

• YouTube

• VK Video

• Apple Podcasts

• Yandex Музыка

• Mave (прямо в Telegram)

• Castbox

#medach_podcast #медицина #нейрохирургия #спина

С возрастом в клетках организма происходит множество изменений, одно из которых — снижение уровня важного кофермента никотинамидадениндинуклеотида (NAD+). Этот кофермент критически важен для энергетического обмена в митохондриях — "энергетических станциях" клетки. Исследователи задались вопросом: может ли искусственное поддержание высокого соотношения NAD+/NADH в митохондриях замедлить старение и продлить жизнь?

Команда ученых опубликовала в журнале Aging & Disease результаты исследования, в котором они использовали генетические методы для изменения окислительно-восстановительного баланса в митохондриях. В качестве модельного организма была выбрана фруктовая мушка Drosophila melanogaster (дрозофила). Ученые внедрили в ее митохондрии дрожжевой фермент NDI1, который способен окислять NADH обратно в NAD+, минуя стандартный комплекс дыхательной цепи, что приводит к повышению соотношения NAD+/NADH.

Экспрессия фермента NDI1 привела к значительному увеличению продолжительности жизни мушек — как средней, так и максимальной. У генетически модифицированных насекомых наблюдалось улучшение двигательной активности в пожилом возрасте по сравнению с контрольной группой. Отмечено снижение уровня возрастного окислительного стресса и повреждения тканей. Вмешательство помогло сохранить целостность митохондриальной сети и улучшить энергетический статус клеток стареющего организма.

Интересно, что положительные эффекты зависели от того, в каких именно тканях экспрессировался фермент. Наиболее выраженное влияние на продолжительность жизни и маркеры старения наблюдалось при активации NDI1 в нейронах и клетках кишечника — тканях, которые играют ключевую роль в системной регуляции старения . При этом чрезмерная экспрессия фермента во всем теле могла приводить к негативным последствиям, что подчеркивает важность тонкой настройки метаболических вмешательств.

Данная работа подтверждает гипотезу о том, что поддержание митохондриального пула NAD+ является критически важным для долголетия. Хотя эксперименты проводились на дрозофилах, фундаментальные механизмы клеточного дыхания и старения консервативны в ходе эволюции. Это открывает новые перспективы для разработки терапевтических стратегий, направленных на повышение уровня NAD+ в митохондриях млекопитающих и человека, с целью замедления возрастных изменений и борьбы с нейродегенеративными заболеваниями.

А так уж ли это плохо?

Когда человек в десятый раз натыкаетесь на текст, который написан гладко, но содержит фактические ошибки в первых же предложениях, он начинает уже более тщательно выискивать ошибки, проверять источники, искать признаки генерации, пытаться выйти на автора.

Это бесплатный курс критического мышления, который проходят миллионы людей, даже если они на него не подписывались.

И да, это может привести к обществу, где ничему не верят на слово. А это, в свою очередь, значительно усложняет традиционную пропаганду.

ИИ-слоп учит людей не верить красиво поданной информации. И это хорошо.

«Коммунисты убили моего деда»

Герр немецкий мистер-лох, пока мигрант насилует его жену, сидя в соседней комнате жалуется всем о форменном русском беспределе.

Эта фрау на фото - Лора Бауэр, она служила во вспомогательном батальоне Вермахта, её избили чешские партизаны, на том участке фронта, где находились американцы, а советский войск там не было.

Мистер герр лох настолько отупел от налогов на дождь и ножевых ранений от мигрантов, что после того как немецкие электрики напали на СССР, получили простой советской пизды и убежали до самого Берлина подписывать капитуляцию, называет бойцов РККА - оккупантами.

Нет говорит предела чекистской подлости, а нас то защо warum?

Да не знаю, как-то так получилось неловко, закрутилось всё, завертелось, и вот мы уже - в Берлине, стоя на танке поём про Синий платочек.

Что ж, ну что нам остаётся?

Только от чистого сердца поздравить герра немца с великим праздником - Днём Победы Красной армии и советского народа над нацистской Германией в Великой Отечественной Войне и пожелать ему терпения.

Русский императив

Всех причастных с праздником, остальным - соболезнования.

С Днём Победы!

Русский императив

В продолжение темы прогреводинамики гоев: что стоит считать фазовым переходом при прогреве/охлаждении гоев?

Оппа, а термодинамика прогрева гоев оказывается не бьётся с термодинамикой как таковой. При расширении объёма проскроленной ленты температура гоя увеличивается!
А при понижении объёма проскроленной ленты - гой охлаждается.
ВТФ?!