Новый релиз FragalyseQt - 0.5.2
Что это такое:
свободный (AGPLv3) и кроссплатформенный (Linux, macOS, *BSD, Windows - x86, ARM, RISC-V, работает всё) софт для неизвазивного (исходные файлы НЕ ИЗМЕНЯЮТСЯ) анализа данных капиллярного электрофореза, способный обрабатывать результаты, независимо от того, на каком оборудовании они было получены (поддерживаются даже древние и недокументированные версии ABIF), а также корректировать базовую линию, подавлять шумы, проодить сайзколлинг фрагментов, бинирование аллелей, фильтрацию статтеров, поддерживая панели GeneMapper, GeneMarker и NCBI OSIRIS.
В этом релизе:
- интеграция SOAP API для возможности интеграции с LIMS, автоматизации и использования с веб-инструментами,
- пакетная обработка и экспорт данных,
- сохранение и переоткрытие сессий с использованием SQLite DB (append-only, в следующей версии - PostgreSQL & ImmuDB).
Репозиторий: github.com/Dorif/fragalyseqt
Релиз: github.com/Dorif/fragalyseqt/releases/tag/southern_soap_db
P.S.: отдельные благодарности коллегам из @webhostmost и моей семье.
____
What's this:
free (AGPLv3)and crossplatform (Linux, macOS, *BSD, Windows, x86, ARM, RISC-V - proven to work) soft for non-invasive capillary electrophoresis data analysis, capable f handling CE data inependently from machine they were obtained at (even extremely old and undocumented versions of ABIF are supported), corresct baseline, denoise signal, sizecall fragments, bin alleles, filter stutters and supports panel definitions from GeneMapper, GeneMarker and NCBI OSIRIS.
In this release:
- batch processing and export,
- SOAP API for integration with LIMS, automation and web based tools,
- SQLite DB integration for session storage and restore (append-only, PostgreSQL and ImmuDB coming in next release).
Repo: github.com/Dorif/fragalyseqt
Release: github.com/Dorif/fragalyseqt/releases/tag/southern_soap_db
P.S.: special thanks to my colleagues from @webhostmost and my family
#foss #fragalyseqt
Post #5826
834
