GeneticsToday

📌درمان ALS با داروی QALSODY

سازمان غذا و دارو (FDA) تزریق داروی Tofersen با نام تجاری QALSODY™ تولید شده توسط Biogen و Ionis برای درمان اسکلروز جانبی آمیوتروفیک (ALS) در بزرگسالانی که دارای جهش در ژن سوپراکسید دیسموتاز 1 (SOD1) هستند را به صورت اضطراری تایید کرد. QALSODY اولین و تنها درمان تایید شده برای هدف قرار دادن ALS با علت ژنتیکی است.

بیماری ALS یک بیماری عصبی نادر، پیشرونده و کشنده است و منجر به از دست دادن نورون های حرکتی در مغز و نخاع می شود که مسئول کنترل حرکت ارادی عضلات هستند. افراد مبتلا به ALS ضعف و آتروفی عضلانی را تجربه می‌کنند که باعث می‌شود به طور پیوسته توانایی حرکت، صحبت کردن، غذا خوردن و در نهایت نفس کشیدن را از دست می‌دهند. میانگین امید به زندگی برای افراد مبتلا به ALS سه تا پنج سال از زمان شروع علائم است.

ژن های متعددی در ALS نقش دارند.. SOD1-ALS تقریباً در 2٪ از کل موارد ALS تشخیص داده می‌شود. در حالی که داروهای تایید شده زیادی برای ALS وجود دارد، تاکنون هیچ درمانی جهش ژنتیکی مرتبط با ALS را هدف قرار نداده‌است. جهش در ژن SOD1 آنها باعث می‌شود که بدن آنها یک فرم سمی از پروتئین SOD1 ایجاد کند. این پروتئین سمی باعث ضعیف شدن نورون های حرکتی می شود که منجر به تحلیل عضله، از دست دادن عملکرد و در نهایت مرگ می شود.

داروی QALSODY یک الیگونوکلئوتید آنتی سنس (ASO) است که برای اتصال به mRNA SOD1 برای کاهش تولید پروتئین SOD1 طراحی شده است. براساس شواهد حاکی از کاهش زنجیره سبک نوروفیلامنت پلاسما (NfL) در بیماران تحت درمان با QALSODY، این دارو به صورت اضطراری تاییدیه سازمان غذا و داروی امریکا را دریافت کرده است. نوروفیلامنت‌ها پروتئین‌هایی هستند که از نورون‌ها در هنگام آسیب‌دیدگی آزاد می‌شوند و به نوعی مارکر تخریب عصبی هستند. . QALSODY به صورت داخل نخاعی در سه دوز با فواصل 14 روزه و سپس دوزهای یاد آور به صورت 28 روز یک بار تزریق می شود.

🔗منبع: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2204705  

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌تکنولوژی CODEC: توالی یابی با ۱۰۰۰ برابر دقت بیشتر

تشخیص جهش های مولکول های انفرادی DNA در بسیاری از زمینه ها بسیار مهم اما چالش برانگیز است. توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) توان عملیاتی فوق‌العاده‌ای را برای این منظور فراهم می‌کند، اما نمی‌تواند مستقیماً مولکول‌های DNA دو رشته‌ای ("دوبلکس‌های تکی") را برای تشخیص جهش‌های واقعی در هر دو رشته توالی‌یابی کند.

در این مقاله که در ژورنال Nature Genetics به چاپ رسیده است، نویسندگان روشی به نام Concatenating Original Duplex for Error Correction (CODEC) را ارائه کرده‌اند که NGS دوبلکس‌های تکی DNA را امکان‌پذیرمی‌کند. دقتCODEC به میزان 1000 برابر بالاتر از NGS است و برای دست‌یابی به این دقت، تا 100 برابر کمتر تعداد خوانش (Read) استفاده می‌کند.

برای تمایز جهش های واقعی از بازهای آسیب دیده یا خطاهای پلیمراز، CODEC به طور فیزیکی دورشته‌ی ‌DNA دوپلکس اولیه را که ممکن است دارای جهش باشند را به همدیگر پیوند می دهد. هر مولکول DNA دوپلکس یه خوشه را تشکیل میدهد و NGS توالی های هر دو رشته را می خواند تا یک دوبلکس کامل را توالی یابی کند،

تکنولوژی CODEC از آداپتورهای چهارگانه استفاده می کند که با تمام اجزای مورد نیاز برای Illumina NGS هماهنگی دارد و طی فرآیند گسترش و جابجایی رشته (strand displacing extension) توالی یابی انجام می‌شود. CODEC هم با توالی یابی targeted و هم با WGS سازگار است.

تکنولوژی CODEC قادر است جهش هایی با فراوانی 8 - ^ 10 × 2.72 را در اسپرم یک فرد 39 ساله و جهش‌های سوماتیک ناشی از افزایش سن در سلول‌های خونی را شناسایی کند. CODEC همچنین قادر به شناسایی موارد زیر بود:
-جهش‌های سراسر ژنومی تک مولکول‌های DNA در سلول‌های خونساز
- جهش‌های دوبلکس‌های تکی ژنوم تومور و بیوپسی‌های مایع
-ناپایداری ریزماهواره‌ای و امضاهای خاص توموری با 10 برابر حساسیت بیشتر
-جهش‌های خاص تومور با 100 برابر خوانش کمتر

تکنولوژی CODEC آزمایش‌های ژنتیکی دقیق‌تری را امکان‌پذیر می‌کند و جهش‌های مهم بیولوژیکی که معمولاً در اثر خطاهای NGS پنهان می‌شوند را شناسایی میکند.

🔗منبع: https://doi.org/10.1038/s41588-023-01376-0  

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌ماشین زمان سلول

این واقعیت که همه سلول های موجودات زنده پر سلولی از یک سلول منفرد به وجود آمده اند، امروزه بر کسی پوشیده نیست. اما درک سیر تحولات و مراحلی که یک سلول منفرد به میلیون ها سلول تبدیل میشود هنوز هم برای ما با چالش های بزرگی رو به رو است.

دانشمندان دانشگاه جان هاپکینز در مقاله‌ای که در ژورنال Cell منتشر شده، مدل کامپیوتری و ریاضی را ارائه داده‌اند که با استفاده از آن میتوان در خط زمانی روند یک سلول به عقب بازگشت. اهمیت این روش به خصوص زمانی آشکار میشود که با جانداران غیر مدل کار میکنیم. از این روش میتوان برای بررسی رشد موجودات از نمونه‌های سلولی، از جمله ارگانیسم‌های موجودات غیرمدل مانند نهنگ‌های گوژپشت که معمولاً مورد مطالعه قرار نمی‌گیرند، استفاده کرد.

این مدل کامپیوتری که "نقشه برداری کمی سرنوشت" (quantitative fate mapping) نامیده میشود، بر اساس جهش هایی که یک سلول در حین تقسیم شدن به سلول های دختر متحمل میشود، کار میکند. جهش ها به عنوان نوعی بارکد عمل می کنند که با تجهیزات توالی یابی ژنومی قابل تشخیص است. این مدل از این جهش ها به عنوان نوعی بارکد استفاده میکند و به صورت معکوس برای ساختن دودمان های سلولی به کار میبرد.

نقشه‌برداری کمی سرنوشت شامل دو مرحله است. مرحله اول مستلزم استنتاج یک درخت فیلوژنتیک با مقیاس زمانی از بارکدها یا همان جهش های تبار تک سلولی است. برای این موضوع دانشمندان Phylotime را توسعه داده اند. مرحله دوم مستلزم بازسازی سلسله مراتب حالت‌های اولیه است که منجر به انواع سلول‌های مشاهده‌شده و تخمین زمان تعهد، اندازه جمعیت و سوگیری‌های تعهد آنها می‌شود. برای انجام این کار هم الگوریتم ICE-FASE را توسعه داده اند.

جهت مطالعه بیشتر به لینک متن مقاله مراجعه کنید.

🔗منبع:   https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.10.028

✒️ به قلم بهنام باقریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌سوئیچ اپی‌ژنتیکی و تنظیم سیستم ایمنی

درطول عفونت، سیستم خونساز از حالت عادی به حالت اضطرازی تغییر می‌کند که باعث بهبود دفاع در برابر عوامل بیماری‌زا می‌شود. دانشمندان یک سوئیچ (switch) اپی‌ژنتیکی را در سلول‌های بنیادی خون و سلول‌های پیش‌ساز موشی پیداکرده‌اند که می‌تواند باعث تحریک این تغییر حالت شود.

خونسازی اضطراری یک پاسخ هماهنگ با هدف مقابله با عفونت است که انواع سلول ها و مراحل رشد در سراسر سیستم ایمنی را درگیر می‌کند. دیوبیکوئیتیناز USP22 سطح هیستون H2B مونوبیکویتینه شده (H2Bub1) را تنظیم می کند که با فعال شدن پاسخ های اینترفرونی در هنگام عفونت ویروسی مرتبط است.

مطالعه ی اخیر نشان داد که موش‌هایی که Usp22 در تمام سلول‌های خونساز آن‌ها knock out شده بود، حتی در غیاب عفونت یا التهاب خون‌سازی اضطراری شدید و سیستمیکی را نشان می‌دادند. از نظر عملکردی، از دست دادن Usp22 منجر به افزایش فاگوسیتوز توسط نوتروفیل ها و افزایش ایمنی ذاتی در برابر عفونت لیستریا مونوسیتوژنز می شود. به نظر می‌رسد افزایش سطح H2Bubl دکمه هشداری است که سیستم ایمنی را در حالت آماده‌باش قرار می‌دهد.

در سطح مولکولی، این وضعیت اضطراری خونسازی با علائم رونویسی در پیش‌سازهای میلوئید، افزایش اکسیداسیون میتوکندری و التهاب ناشی از ایمنی ذاتی و اکتسابی مشخص می‌شود. بیان افزایش یافته‌ی بسیاری از ژن های التهابی با افزایش سطح H2Bub1 اختصاصی مرتبط بود. در مجموع، این نتایج وجود یک حالت اپی ژنتیک قابل تنظیم را نشان می‌دهد که خون‌سازی اضطراری سیستمیک را به شیوه‌ای مستقل از سلول برای افزایش ایمنی ذاتی و در نتیجه شناسایی مسیرهای بالقوه به منظور تقویت سیستم ایمنی تبدیل می‌کند.

🔗منبع: https://doi.org/10.1126/sciimmunol.abq2061

✒️ به قلم نیلوفر سلیمانی

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌پیش به سوی مقابله بل کرونا ویروس توسط CRISPR

محققان کشف کرده اند که CRISPR-Cas13 می تواند به عنوان یک ابزار قوی در ویرایش فاژها عمل کند. این RNA-guided RNA nucleases، که در برابر فاژهای RNA دار و DNA دار دفاع می کنند، می توانند برای ویرایش فراوان ترین و متنوع ترین موجودات بیولوژیکی روی زمین استفاده شوند. برخلاف سایر سیستم های کریسپر که سلول های باکتری را در برابر عفونت فاژی به صورت فردی محافظت میکنند، این سیستم به صورت فردی و جمعی این کار را انجام میدهد.

دانشمندان در این مطالعه از CRISPR-Cas13a به عنوان یک ابزار ضد ویروسی جهت ویرایش ژنوم فاژ با طیف گسترده استفاده کرده اند. آنها سپس بر روی LbuCas13a از Leptotrichia buccalis تمرکز کردند و دریافتند که یک مهارکننده قوی عفونت فاژ در سراسر فیلوژنی فاژ E. coli است. LbuCas13a یک نوع RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector proteins است.

اهمیت این مطالعه در مبارزه با آن دسته از RNA ویروس هایی هست که خطر پاندمی های بعدی را در پی دارند. مطالعه بر روی نابودی SARS-CoV-2 با واسطه LbuCas13a در شرایط آزمایشگاهی، پیامدهای عملی قابل توجهی برای توسعه درمان‌های جدید برای COVID-19 و سایر بیماری های ویروسی RNA دار دارد که به طور موثر می تواند از تکثیر و انتشار SARS-CoV-2 در افراد آلوده جلوگیری کند. این رویکرد به ویژه در مواردی که واکسن‌های موجود و درمان‌های ضد ویروسی ممکن است مؤثر نباشد می‌تواند مفید باشد. علاوه بر این، از بین بردن RNA ویروسی با واسطه LbuCas13a ممکن است در مقایسه با سایر گزینه‌های درمانی، مانند داروهای ضد ویروسی با طیف وسیع، که می‌تواند عوارض قابل توجهی داشته باشد، عوارض جانبی کمتری داشته باشد.


🔗منبع: https://doi.org/10.1038/s41564-022-01258-x

✒️به قلم بهنام باقریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌ژن درمانی بتا تالاسمی

بتا تالاسمی یک ناهنجاری خونی ارثی میباشد که منجر به کاهش تعداد گلبول های قرمز خون می‌شود. در این بیماری جهش در زیرواحد های بتاگلوبین منجر به عدم اکسیژن رسانی بدن میشود و همچنین کاهش سلول های قرمز خون باعث خستگی، سرگیجه و ... میشود. این بیماران به صورت مداوم (هر ۲ تا ۵ هفته) نیاز به تزریق خون دارند.

ژن درمانی Betibeglogene autotemcel (beti-cel) با عنوان تجاری zynteglo برای بتا تالاسمی β0/β0
وابسته به انتقال خون از طریق سلول های بنیادی خونساز CD34+ و سلول های پیش ساز است که با ناقل لنتی ویروسی BB305 کد کننده ژن β-گلوبین که جهش HbAT87Q را اصلاح می‌کند مهندسی شده است.

داروی zynteglo یک ژن درمانی تک دوز است و درمان با هر دوز آن با استفاده از سلول های خود بیمار میباشد. در این روش بیمار بدون نیاز به تزریق خون به مقدار مطلوبی از سطح هموگلوبین می‌رسد و این وضعیت را برای ۱۲ ماه حفظ میکند، که البته عوارضی هم دارد از جمله کاهش تعداد پلاکت و تب که خیلی جدی نیست. از ۴۱ بیماری که در کارآزمایی بالینی این دارو را دریافت کرده اند ۹۰٪ از تزریق خون بی نیاز شده اند .

این دارو آخرین دستاورد حوزه دارو است و به عنوان یکی از گران ترین داروهای جهان از FDA مجوز درمان خود را دریافت کرده است.

🔗منبع: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2113206

✒️به قلم بهار صدقی

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌شناسایی ژن های جدید دخیل در بیماری آلزایمر

بر اساس مطالعه‌ی منتشر شده در ژورنال Alzheimer’s and Dementia.، ژن اینوزیتول پلی فسفات-5-فسفاتازD با التهاب که به عنوان یک مکانیسم کلیدی در ابتلا به بیماری آلزایمر شناخته می‌شود مرتبط است.
میکروگلیاها سلول‌های ایمنی در مغز هستند که مسئولیت حذف سلول‌های در حال مرگ و پلاک‌های آمیلوئیدی مرتبط با زوال عقل ناشی از آلزایمر را برعهده دارند. مطالعات قبلی INPP5D را با خطر ابتلا به بیماری آلزایمر مرتبط دانسته بود و سطوح بالایی از این ژن در بافت مغزی بیماران فوت شده در اثر آلزایمر یافت شده‌بود، اما نقش این ژن در وقوع این بیماری ناشناخته باقی مانده بود.
از آنجایی که بیان INPP5D در مغز در سلول های میکروگلیا متمرکز شده است، محققان از موش های مهندسی شده ای استفاده کردند که بیان این ژن در آن ها کاهش یافته بود (knock down) و بعد از سه ماه، تجمع پلا‌ک‌ها و رفتار میکروگلیال‌ها را بررسی کردند.
دانشمندان انتظار داشتند که در موش‌هایی که این ژن غیرفعال شده است میزان پلاک‌های آمیلوئیدی کاهش یابد. اما مشاهدات حاکی از آن بود که موش‌های فاقد INPP5D ، پلاک‌های بیشتری نسبت به موش‌های طبیعی داشتند. در موش های عادی میکروگلیا اغلب روی لبه‌های پلاک‌ها می‌نشیند، اما وقتی INPP5D از بین رفت، پلاک‌ها کاملاً با میکروگلیا ها پوشانده شده بودند.
برای بررسی علت جایگیری متفاوت سلول‌های میکروگلیا در مغز، از روش های ترانسکریپتومیکس فضایی (Spatial transcriptomics) و آنالیز کمی بیان ژن استفاده شد. نتایج مطالعات بیانگر دامنه بالای تغییرات بیان ژن‌ها در میکروگلیاها بود.
سلول‌های میکروگلیاها در نزدیکی پلاک‌های آمیلوئید، ژن‌هایی موسوم به ژن‌های القاشده توسط پلاک (PIGs) را بیان میکنند. موش‌های مهندسی شده با INPP5D کاهش یافته، افزایش بیان PIG را نشان دادند که در تحقیقات قبلی نیز مشاهده شده بود، اما این مطالعه PIG های جدیدی را نیز شناسایی کرد. PIG جدید با بیشترین افزایش بیان ژن CST7 بود که پروتئین سیستاتین F را کد می کند و مشخص شده‌بود که در آلزایمر نقش دارد و با بیماری های پریونی مرتبط است.
این یافته ها نشان می دهد که هم INPP5D و هم سیستاتین F می‌توانند به عنوان اهدافی برای توسعه مداخلات جدید با هدف کاهش التهاب در مغز بیماران آلزایمر در نظر گرفته شوند.

🔗منبع: https://doi.org/10.1002/alz.12821

✒️به قلم آیلار شاهسوندی

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

.....

مدرسه بهاره بیوانفورماتیک

#معرفی_پکیج‌

🔻پکیج کلون:

پکیج کلون از مدرسه بیوانفورماتیک شامل ۳۵ ساعت آموزش درباره نه تنها مهم‌ترین پایگاه داده در حوزه زیست شناسی، بلکه نحوه طراحی بهترین پرایمر برای تکثیر ژن مورد شما و همچنین یکی از پرکاربردترین تکنیک های بیولوژی، #کلونینگ است.

سرفصل‌های کلی این پکیج شامل👇
🔸معرفی NCBI
🔹آشنایی با پایگاه‌های داده ژن
🔸آشنایی با پایگاه‌های داده نوکلئوتید
🔹بلاست کردن ژن و پروتئین و مقایسه شباهت ها و تفاوت های آن
🔸نحوه ترسم ماتریکس PAM و BLOSUM
🔹اصول طراحی پرامیر
🔸طراحی پرایمر با نرم افزار
🔹کار با پرایمر بلاست
🔸آشنایی با پایگاه داده SNP
🔹کار با نرم افزار CLC
🔸محل برش وکتور و insert
🔹نحوه شناخت محل برش آنزیم های محدودالاثر
🔸نحوه قراردادن insert در وکتور
🔹نحوه قرار دادن Taq در وکتور-insert
🔸نحوه قراردادن GFP در قطعه

💵 این پکیج دارای ۲۰ درصد #تخفیف تا تاریخ ۱۵ فروردین می‌باشد.



🔴 همچنین به منظور آشنایی شما با این دوره، امکان تماشای جلسه اول به صورت #رایگان فراهم شده است. برای تماشای این جلسه و همچنین دریافت اطلاعات بیشتر به لینک زیر مراجعه بفرمایید👇
https://immtoday.com/product/virtual-education/bioinformaticsschool/


❓️ هر سوالی داری از ما بپرس
@GeneticsToday_admin


🧪ایمونولوژی‌تودی | @ImmunologyToday

🧬ژنتیک تودی | @GeneticsToday

📌 بازرگانان ایرانی، اجداد ژنتیکی نیمی از مردم شرق آفریقا در قرون وسطی

یک مطالعه ژنتیکی جدید بر روی مردم قرون وسطی که در امتداد سواحل اقیانوس هند در شرق آفریقا زندگی می کردند - منطقه ای که اغلب به دلیل زبان و فرهنگش "ساحل سواحیلی" نامیده می شود - نشان داد که آنها هم ریشه آفریقایی و هم ایرانی داشتند.

نتایج نشان می دهد که ارتباطات تجاری دریایی که مدت ها توسط باستان شناسان بر اساس کالاهای وارداتی و تأثیرات معماری به رسمیت شناخته شده بود، باعث تقویت روابط بین بازرگانان آسیایی و بازرگانان آفریقایی و خانواده های آنها شده بود.

در مقاله ای که در ۲۹ مارچ در ژورنال نیچر منتشر شد، این نتایج را با استفاده از DNA از بقایای اسکلتی 80 نفر بررسی کردند. این اسکلت ها که در شش شهر ساحلی قرون وسطایی و اوایل دوران مدرن در کنیا و تانزانیا دفن شده‌اند، مربوط به سال‌های 1250-1800 و یک شهر داخلی در کنیا که قدمت آن به سال‌های بعد از 1650 می‌رسد می‌باشند.

تجزیه و تحلیل داده های ژنتیکی دانشمندان را قادر ساخت تا تخمین بزنند که مردم آفریقایی و ایرانیان در حدود سال 1000 میلادی، شروع به وصلت و تولید مثل با هم کردند. همچنین پذیرش دین اسلام نیز مربوط به این برهه می‌باشد.

تحقیقات باستان شناسی و تاریخی قبلی نشان داده‌بود که بازرگانان خلیج فارس برای تجارت از سواحل شرقی آفریقا بازدید می کردند. این تاجران ماه‌ها در یک مکان می‌ماندند تا اینکه جهت باد تغییر کند و آنها بتوانند به خانه برگردند.

مطالعه جدید نشان داد که برخی از افرادی که در گورستان های اشرافی شهرهای ساحلی دفن شده اند، عمدتاً اجداد آفریقایی داشته اند. اما نسبت زیادی از آنها نیز اصل و نسب آسیایی داشتند که در برخی از موارد بیش از نیمی از آنها را شامل میشد. این اصل و نسب آسیایی عمدتاً از مردان ایرانی آمده است.

نژاد اجداد آسیایی این مناطق در حدود سال 1500 از ایران به عربستان تغییر کرد که خود نشان دهنده تغییر در سیاست‌گذاری‌های اقتصادی و سیاسی در سواحیل بود. این نتایج پیشنهاد میکند که این مناطق قبلاً مستعمره پارسی‌ها بوده‌است.

این یافته‌ها همچنین تاریخ شفاهی مردم سواحیلی که اکنون در شرق آفریقا زندگی می‌کنند، را تأیید می‌کند. آن‌ها مدت‌ها می‌گفتند که اجدادشان از ایران آمده‌اند.

🔗منبع:
https://doi.org/10.1038/s41586-023-05754-w 

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

.....

🔻مدرسه بهاره بیوانفورماتیک

جلسه اول رو تماشا کردی؟

برای اینکه با روند برگزاری دوره آشنا بشی، میتونی همین الان جلسه اول رو به صورت رایگان تماشا کنی. برای تماشای این جلسه:

1⃣ اینجا کلیک کن و وارد صفحه دوره بشو
2⃣ باکس جلسه اول رو انتخاب کن
3⃣ گزینه افزودن به سبد خرید رو انتخاب کن
4⃣ کد تخفیف free_Bio رو وارد کن و خرید رو نهایی کن
5⃣ روی باکس قرمز کلیک کن و جلسه اول رو تماشا کن

❓اگر سوالی داشتی از ما بپرس
@GeneticsToday_admin

🧪ایمونولوژی‌تودی | @ImmunologyToday
🧬ژنتیک تودی | @GeneticsToday

.....

مدرسه بهاره بیوانفورماتیک

#معرفی_پکیج‌

🔻پکیج پرایمر:

پکیج پرایمر از مدرسه بیوانفورماتیک شامل ۲۷ ساعت آموزش درباره نه تنها مهم‌ترین پایگاه داده در حوزه زیست شناسی، بلکه نحوه طراحی بهترین پرایمر برای تکثیر ژن مورد شما است.

سرفصل‌های کلی این پکیج شامل👇
🔸معرفی NCBI
🔹آشنایی با پایگاه‌های داده ژن
🔸آشنایی با پایگاه‌های داده نوکلئوتید
🔹بلاست کردن ژن و پروتئین و مقایسه شباهت ها و تفاوت های آن
🔸نحوه ترسم ماتریکس PAM و BLOSUM
🔹اصول طراحی پرامیر
🔸طراحی پرایمر با نرم افزار
🔹کار با پرایمر بلاست
🔸آشنایی با پایگاه داده SNP

💵 این پکیج دارای ۱۰ درصد تخفیف تا تاریخ ۱۵ فروردین می‌باشد.



🔴 همچنین به منظور آشنایی شما با این دوره، امکان تماشای جلسه اول به صورت #رایگان فراهم شده است. برای تماشای این جلسه و همچنین دریافت اطلاعات بیشتر به لینک زیر مراجعه بفرمایید👇
https://immtoday.com/product/virtual-education/bioinformaticsschool/


❓️ هر سوالی داری از ما بپرس
@GeneticsToday_admin


🧪ایمونولوژی‌تودی | @ImmunologyToday

🧬ژنتیک تودی | @GeneticsToday

.....

مدرسه بهاره بیوانفورماتیک

#معرفی_پکیج‌

🔻پکیج ژن:

پکیج ژن از مدرسه بیوانفورماتیک شامل ۱۳ ساعت آموزش درباره مهم‌ترین پایگاه داده در حوزه زیست شناسی است.

سرفصل‌های کلی این پکیج شامل👇
🔸معرفی NCBI
🔹آشنایی با پایگاه‌های داده ژن
🔸آشنایی با پایگاه‌های داده نوکلئوتید
🔹بلاست کردن ژن و پروتئین و مقایسه شباهت ها و تفاوت های آن
🔸نحوه ترسم ماتریکس PAM و BLOSUM

💵 این پکیج دارای ۱۰ درصد تخفیف تا تاریخ ۱۵ فروردین می‌باشد.



🔴 همچنین به منظور آشنایی شما با این دوره، امکان تماشای جلسه اول به صورت #رایگان فراهم شده است. برای تماشای این جلسه و همچنین دریافت اطلاعات بیشتر به لینک زیر مراجعه بفرمایید👇
https://immtoday.com/product/virtual-education/bioinformaticsschool/


❓️ هر سوالی داری از ما بپرس
@GeneticsToday_admin


🧪ایمونولوژی‌تودی | @ImmunologyToday

🧬ژنتیک تودی | @GeneticsToday

📌 اولین موفقیت گران‌ترین داروی جهان در ژن‌درمانی MLD

انتظار می‌رود تدی شاو نوزده ماهه که به لوکودیستروفی متاکروماتیک (MLD) مبتلا است، به عنوان اولین فردی که به کمک ژن درمانی با گران‌ترین داروی جهان تحت درمان قرار گرفته است، یک زندگی طولانی و عادی داشته باشد.

داروی Atidarsagene autotemcel تحت نام تجاری Libmeldy برای درمان کودکان مبتلا به MLD استفاده می شود. MLD یک اختلال ارثی نادر است که در آن تغییر (جهش) در ژن مورد نیاز برای ساخت آنزیمی به نام آریل سولفاتاز A (ARSA) وجود دارد که موادی به نام سولفاتیدها را تجزیه می کند. در نتیجه، سولفاتیدها انباشته می شوند و به سیستم عصبی و سایر اندام ها آسیب می رسانند و باعث بروز علائمی مانند مشکلات راه رفتن، زوال تدریجی ذهنی و در نهایت مرگ می شوند.

داروی Libmeldy به بیمارانی که در اواخر دوران نوزادی یا اوایل جوانی هستند و هنوز علائمی از خود نشان نداده اند داده می شود. کسانی که علائم اولیه دارند اما هنوز می توانند مستقل راه بروند و زوال ذهنی نداشته باشند.

برای ساخت Libmeldy، سلول‌های CD34 (سلول‌هایی که می‌توانند گلبول‌های سفید خون بسازند) از خون یا مغز استخوان استخراج می‌شوند. ژنی که به آنها اجازه می دهد ARSA بسازند با استفاده از نوعی لنتی ویروس در سلول های CD34 وارد می شود که از نظر ژنتیکی تغییر یافته است تا بتواند ژن ARSA را به داخل سلول ها حمل کند و باعث بیماری ویروسی در انسان نشود.

پس از بازگشت به ورید بیمار، Libmeldy در جریان خون به مغز استخوان منتقل می‌شود، جایی که سلول‌های CD34 شروع به رشد می‌کنند و گلبول‌های سفید طبیعی می‌سازند که می‌توانند ARSA فعال تولید کنند. این گلبول های سفید در بدن پخش می شوند و ARSA تولید می کنند و به تجزیه سولفاتیدها در سلول های اطراف کمک می کنند و بنابراین علائم بیماری را کنترل می کنند. انتظار می رود اثرات طولانی مدت باشد.

داروی Libmeldy با قیمت ۲.۸ میلیون پوند مجوز بازاریابی معتبر در سراسر اتحادیه اروپا را در 17 دسامبر 2020 دریافت کرد و منتظر دریافت تاییدیه FDA است.

🔗منبع:
https://amp.theguardian.com/society/2023/feb/15/girl-with-deadly-inherited-condition-mld-cured-gene-therapy-libmeldy-nhs 

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

🔥ژنتیک‌تودی با همکاری ایمونولوژی‌تودی برگزار می‌کند:

🌱مدرسه بهاره بیوانفورماتیک🌱

🔺️ژن، پرایمر، کلون! هرچیزی که لازم داری رو برات آوردیم!

🔻بیش از ۳۵ ساعت آموزش در ۲۵ جلسه (آفلاین + جلسات پرسش و پاسخ آنلاین)

💢 جلسه اول #رایگان

👤دبیر علمی: دکتر رسول بهارلو، دکترای تخصصی ایمونولوژی

🗓شروع دوره: ۲۷ فروردین ماه ۱۴۰۲

🔖همراه با ارائه گواهی

💰 ۲۰ درصد #تخفیف برای ۱۰ نفر اول و تا تاریخ ۱۵ فروردین

🔴 ظرفیت محدود

❓️ هر سوالی داری از ما بپرس
@GeneticsToday_admin

📱مشاهده سرفصل‌ها 👇
https://immtoday.com/product/virtual-education/bioinformaticsschool/

🧪ایمونولوژی‌تودی | @ImmunologyToday

🧬ژنتیک تودی | @GeneticsToday

📌تولید تخمک از والد نر و تولد فرزندان دو موش نر

محققان دانشکاه توکیو موفق به تولید تخمک های زنده ای شدند که از سلول های بنیادی موش نر در شرایط آزمایشگاهی ساخته شده اند. این پیشرفت به دانشمندان اجازه میدهد تا سلول های بنیادی را به تخمک تبدیل کنند و نوید بخش درمان ناباروری و باروری هایی با نقص ژنتیکی در انسان است، به ویژه در مورادی که فرد از ناهنجاری های کروموزومی رنج میبرد مانند سندروم داون.

محققان در این مطالعه موفق شدند تا با حذف کروموزم Y از سلول های بنیادی موش نر؛ در نهایت تخمکی ایجاد کنند که بارور شده و موش های سالمی متولد شوند. برای دستیابی به این هدف، محققان از سلول‌های بنیادی جنینی BVSCN2 XY استفاده کردند که دارای ریپورتر ژن هایی برای primordial germ (PG) و primordial germ cell-like (PGCL) . و اووسیت بود. همچنین برای نظارت بر تعداد کروموزم های X در سلول، با استفاده از تکنیک CRISPR Cas9 یک وکتور برای بیان DsRed در کروموزم X جایگذاری کردند. آنها ابتدا سعی کردند کروموزوم Y را با پاساژ های متوالی از کلون سلولی حذف کنند و دریافتند که 6٪ از سابکلون های تولید شده پس از 8 پاساژ کروموزوم Y خود را از دست دادند و در نتیجه سلول های BVSCN2 XO ES را تولید کردند. برای اینکه از سلول های XO تولید شده، سلول های XX بدست آورند از reversin که یک مهار کننده سازماندهی دوک تقسیم است استفاده کردند. سلول‌های PGCL سپس با سلول‌های سوماتیک غدد جنسی ماده ادغام شدند و تحت شرایط کشت تمایز آزمایشگاهی (IVDi) کشت شدند. در نهایت محققان سلول های بنیادی پرتوان القایی را از دم یک موش نر بالغ به سلول های تخمک با توانایی بالا تمایز دادند که پس لقاح فرزندانی به وجود می آورد که از نظر جنسی هم فعال هستند.

این مطالعه دیدگاه هایی را ارائه می دهد که می تواند ناباروری ناشی از کروموزوم های جنسی یا اختلالات اتوزومی را بهبود بخشد و امکان تولید مثل دوپدری را باز می کند. به گفته پروفسور هایاشی، این کار در مراحل اولیه است و در حال حاضر نمی‌توان آن را به طور ایمن روی انسان استفاده کرد. همچنین موانعی برای استفاده از تخمک‌های آزمایشگاهی برای اهداف بالینی وجود دارد.

پیش از این، دانشمندان موش‌هایی را به دنیا آوردند که از نظر فنی دو پدر بیولوژیکی داشتند و همچنین موش‌هایی با دو مادر، اما این اولین بار است که تخمک‌ها از سلول‌های نر کشت می‌شوند.

🔗منبع: https://doi.org/10.1038/s41586-022-05283-yhttp

✒️به قلم بهنام باقریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌آسپارتام و اضطراب بین نسلی

محققان آسپارتام را که یک شیرین کننده مصنوعی به کار رفته در محصولات رژیمی است با رفتارهای اضطرابی در موش ها مرتبط دانسته اند. بر اساس این مطالعه، علاوه بر ایجاد اضطراب در موش‌هایی که آسپارتام مصرف می‌کردند، اثرات آن تا دو نسل بعد در موش‌های نری که در معرض این شیرین‌کننده قرار گرفته بودند، قابل ردیابی بود.

سازمان غذا و داروی ایالات متحده (FDA) آسپارتام را به عنوان یک شیرین کننده در سال 1981 تایید کرد. امروزه تقریباً 5000 تن در سال از این ماده تولید و مصرف می شود. آسپارتام بعد از مصرف، در بدن به اسید آسپارتیک، فنیل آلانین و متانول تبدیل می شود که همه اینها می توانند اثرات شدیدی بر سیستم عصبی مرکزی داشته باشند.

این مطالعه که در Proceedings of the National Academy of Sciences منتشر شده است نشان می‌دهد علائمی که در فرد می‌بینیم تنها متاثر از وقایعی که امروز اتفاق می افتد نیست، بلکه می تواند ناشی از حوادثی باشد که دو نسل قبل و شاید حتی بیشتر از آن اتفاق افتاده است، پدیده ای که از طریق اپی‌ژنتیک اتفاق می‌افتد.

در این پژوهش به موش‌ها آب آشامیدنی حاوی آسپارتام داده شد که دارای حداکثر 15 درصد مقدار مصرف مجاز روزانه انسانی بود. این مقدار که معادل ۲ تا ۴ قوطی نوشابه رژیمی در روز برای انسان است، به مدت 12 هفته و در یک مطالعه چهار ساله ادامه یافت.

رفتارهای اضطرابی مشهود در موش‌ها از طریق انواع آزمایش‌های ماز در چندین نسل از نرهای تغذیه شده با آسپارتام مشاهده شد.

هنگامی که دیازپام، دارویی که برای درمان اختلال اضطراب در انسان استفاده می‌شود، به موش‌ها داده شد، رفتارهای شبه اضطرابی در تمام نسل‌ها ناپدید شدند.

این مطالعه بیانگر تغییرات موقت یا اپی ژنتیکی در سلول‌های اسپرم موش است. برخلاف تغییرات ژنتیکی (جهش)، تغییرات اپی ژنتیک برگشت پذیر هستند و توالی DNA را تغییر نمی دهند. با این حال، آنها می توانند نحوه خواندن یک توالی DNA را در بدن تغییر دهند و به نسل بعد هم منتقل شوند.

🔗منبع:
https://doi.org/10.1073/pnas.2213120119  

✒️ به قلم پردیس دهدارنسب

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌روش جدید تولید سلول های سایبورگ

مهندسان زیست پزشکی در دانشگاه کالیفرنیا، "سلول های سایبورگ" نیمه زنده ایجاد کرده اند که اگرچه دارای توتنایی های یک سلول‌های زنده هستند اما قادر به تکثیر نیستند. این سلول ها می‌توانند کاربردهای گسترده‌ای داشته باشند، از تولید داروهای درمانی گرفته تا پاکسازی آلودگی.

هدف زیست شناسی مصنوعی ساخت سلول هایی است که می توانند عملکردهای جدیدی را انجام دهند و برای این منظور از دو روش استفاده می شود: یک روش این است که یک سلول باکتری زنده را برداریم و DNA آن را با ژن‌های جدیدی که عملکردهای جدیدی به آن می‌دهد، بازسازی کنیم. دیگری ایجاد یک سلول مصنوعی از ابتدا با یک غشای مصنوعی و مولکول‌های زیستی است.

سلول زنده مهندسی شده طی رویکرد اول انعطاف پذیری بالایی دارد اما همچنان قادر به تکثیر است، که ممکن است مطلوب نباشد. یک سلول کاملا مصنوعی نمی تواند تولید مثل کند، اما پیچیدگی کمتری دارد و تنها قادر به انجام طیف محدودی از وظایف است.

نویسندگان این مقاله که در ژورنال Advanced Science منتشر شده است رویکرد سومی را ارائه کردند. آنها واحدهای پایه یک پلیمر مصنوعی را به سلول های باکتریایی زنده تزریق کردند. بعد از ورود پلیمر به سلول، آن را در معرض نور ماوراء بنفش قرار دادند تا پلیمربه یک ماتریس هیدروژل متصل شود. سلول های حاصل فعالیت بیولوژیکی خود را حفظ کردند اما نمی توانند تکثیر شوند.

سلول های سایبورگ قابل برنامه ریزی هستند، تقسیم نمی شوند، فعالیت های سلولی ضروری را حفظ می کنند و توانایی های جدیدی به دست می آورند. محققان دریافتند سلول‌های سایبورگ در برابر عوامل استرس زا که سلول‌های طبیعی را از بین می‌برند، مانند قرار گرفتن در معرض پراکسید هیدروژن، آنتی‌بیوتیک‌ها یا pH بالا مقاومت بیشتری داشتند. در نهایت، آنها توانستند سلول ها را طوری مهندسی کنند که بتوانند به سلول های سرطانی رشد یافته در آزمایشگاه حمله کنند.

این گروه در حال انجام تحقیقات بیشتر در مورد چگونگی ایجاد و کنترل سلول های سایبورگ و اثرات مواد مختلف ماتریکس است. آنها همچنین امیدوارند استفاده از آنها را در طیف وسیعی از کاربردها، از رویارویی با چالش های محیطی گرفته تا تشخیص و درمان بیماری ها، کشف کنند.

🔗منبع:
https://doi.org/10.1002/advs.202204175 

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌 روز جهانی شنوایی

3 مارس روز جهانی شنوایی در سال 2023 است. موضوع امسال «مراقبت از گوش و شنوایی برای همه» است که بر اهمیت دسترسی به شنوایی برای همه، صرف نظر از محل زندگی یا وضعیت اجتماعی-اقتصادی‌شان تأکید می‌کند.

بر اساس گزارش سازمان بهداشت جهانی، بیش از یک میلیارد نفر در سراسر جهان در معرض خطر کم شنوایی هستند و تخمین زده می شود که تا سال 2050، نزدیک به 2.5 میلیارد نفر درجاتی از کم شنوایی را تجربه کنند. این گزارش چند دلیل برای این آمار خیره کننده بیان می کند:

- باورهای غلط و عدم آگاهی در مورد کم شنوایی که به تاخیر در درمان کمک می کند

- عدم دسترسی به خدمات مراقبت های بهداشتی گوش و شنوایی، به ویژه زمانی تأثیرگذار است که افراد با عوامل خطر بالقوه ای که باعث کاهش شنوایی در دوره های بحرانی زندگی خود مانند دوره قبل از تولد و کودکی و نوجوانی مواجه می شوند.

در کودکان، نزدیک به 60 درصد کاهش شنوایی به دلایل قابل اجتناب است که با اجرای اقدامات بهداشت عمومی قابل پیشگیری است.

سازمان جهانی بهداشت از اصل "1-3-6" حمایت می کند که به موجب آن همه نوزادان باید در ماه اول زندگی تحت غربالگری شنوایی، آزمایش های تشخیصی و ارزیابی شنوایی شناسی حداکثر تا 3 ماهگی قرار گیرند و بلافاصله پس از تشخیص بیماری وقبل از دست دادن شنوایی حداکثر تا 6 ماهگی ، به خدمات مداخله زودهنگام دسترسی پیدا کنند.

عوامل ژنتیکی مسئول بیش از 50 درصد از کاهش شنوایی در نوزادان هستند و تقریباً 40 درصد از کم شنوایی های دوران کودکی را تشکیل می دهند.

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday

📌دانشمند بدنام ایجاد کننده کودکان CRISPR به دنبال درمان DMD توسط ویرایش ژنوم

بیوفیزیکدان چینی He Jiankui که در سال ۲۰۱۸ جهان را با آزمایش های منجر به تولد اولین کودکانی که توسط ویرایش ژنوم تغییر داده شده بودند شوکه کرد و سال گذشته از زندان آزاد شده است، در یک رویداد اخلاق زیستی در تاریخ ۱۲ فوریه به میزبانی دانشگاه کنت در کنتبری بریتانیا برای اولین بار در مورد اخلاق زیستی و CRISPR در رویداد عمومی سخنرانی کرد، با این حال درباره کارهای گذشته خود صحبتی نکرد و از پاسخگویی به سؤالات حاضران خودداری کرد و در عوض گفت که سؤالات باید از طریق ایمیل برای او ارسال شود.

برخی از دانشمندان معتقند که او باید قبل از انتشار آخرین برنامه های خود برای استفاده از فناوری ویرایش ژنوم روی افراد، به سؤالات مربوط به تحقیقات گذشته خود پاسخ دهد.

در سال 2018، جهان متوجه شد که او از CRISPR-Cas9 برای ویرایش ژنی به نام CCR5 - که یک گیرنده مشترک HIV را رمزگذاری می‌کند - با هدف مقاوم‌سازی کودکان حاصل در برابر ویروس استفاده کرده است. او دو جنین را در رحم یک زن و یکی در رحم دیگری کاشت که دوقلوها و یک نوزاد سوم به دنیا آمد. والدین با درمان موافقت کرده بودند زیرا پدران مبتلا به HIV بودند و مادران نه. او به دلیل نقض مقررات پزشکی در چین به زندان افتاد

آزمایشات او به طور گسترده توسط دانشمندان محکوم شد و چندین گروه علمی از آن زمان به این نتیجه رسیده اند که ویرایش ژنوم نباید برای ایجاد تغییراتی که می تواند به نسل های آینده منتقل شود استفاده شود. مشخص نیست که آیا کار قبلی او در محافظت از کودکان در برابر اچ آی وی موفق بوده است یا این که آیا عوارض جانبی داشته است. بدون شواهدی از آن، در مورد برنامه علمی آینده او تردید وجود دارد.

او که یک سخنرانی 25 دقیقه ای به زبان چینی به طور خلاصه برنامه های خود را برای توسعه یک داروی ویرایش ژن برای افراد مبتلا به DMD توضیح داد که در حال حاضر در حال جمع آوری بودجه از سازمان های بشردوستانه است. او گفت که سرمایه گذاری از سوی نهادهای تجاری را نمی پذیرد، تا اطمینان حاصل شود که درمان هایی که توسعه می دهد مقرون به صرفه هستند و یک کمیته اخلاق بین المللی راهنمایی هایی را در مورد این کار ارائه خواهد کرد.

✒️ به قلم فهیمه اکبریان

🔗 منبع: https://www.nature.com/articles/d41586-023-00382-w.pdf

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @genetics.today

#ژنتیک #ژنتیک_تودی #ژنتیک_انسانی #ژنتیک_پزشکی #ژنتیک_مولکولی #مگس_سرکه #توماس_مورگان #نوبل #جایزه_نوبل #نوبل_فیزیولوژی_و_پزشکی

۱۰۰ سال پیش در چنین روزی دکتر رناتو دولبکو ویروس شناس سرشناس ایتالیایی متولد شد. شهرت این دانشمند بزرگ بخاطر دستاوردهای علمی در خصوص آنکوویروس‌ها است که به همین خاطر نیز جایزه نوبل پزشکی سال ۱۹۷۵ به ایشان تعلق گرفت.

۲۲ فوریه سال ۱۹۱۴ رناتو دولبکو در شهر کاتانزارو در جنوب ایتالیا متولد شد. رناتو با هوش بالای خود توانست در ۱۶ سالگی از مقطع دبیرستان فارغ التحصیل شده و به دانشگاه تورین وارد شود. با وجود علاقه شدیدی که به ریاضیات و فیزیک داشت اما تصمیم گرفت در رشته پزشکی به تحصیل بپردازد.

دکتر رناتو دولبکو بخاطر تحقیقات علمی در خصوص آنکوویروس‌ها سال ۱۹۷۵ مفتخر به دریافت جایزه نوبل پزشکی شد. دکتر دولبکو همچنین یکی از دانشمندانی است که پروژه معروف ژنوم انسان را آغاز کرد و در بخش تحقیقات کمک بسیاری به پیشبرد این پروژه کرد.

این پروژه طرح نقشه ‌برداری و تعیین توالی کل ژنوم انسان است که اولین بار سال ۱۹۸۴ در کنفرانسی در آلتا اوتا مطرح شد و تأمین قسمتی از بودجه این پروژه را دپارتمان انرژی آمریکا به عهده گرفت و کنگره آمریکا رسماً اجرای پروژه ژنوم انسانی را از سال ۱۹۹۱ به مدت ۱۵ سال تصویب کرد. بطور کلی پروژه ژنوم انسان نه تنها چهره دانش ژنتیک مولکولی انسانی را دگرگون ساخت بلکه بر بیشتر علوم زیستی اثر زیادی گذاشته‌ است.

✒️ به قلم پردیس دهدارنسب

🧬با ژنتیک تودی همراه باشید | @geneticstoday