🖥 Достижения ЦГИМУ: онкология

9 сентября 2026 года в международном научном журнале Genes опубликована работа коллектива Центра геномных исследований мирового уровня (ЦГИМУ) «Allelic Variants of the DPYD Gene in Russian Patients with Cancer: The Results of Exome Sequencing».

Исследование выполнено под руководством Федоринова Дениса Сергеевича и Сычева Дмитрия Алексеевича в сотрудничестве с врачами-онкологами, клиническими фармакологами, генетиками и биоинформатиками из Москвы и Санкт-Петербурга.

Фторпиримидины, включая 5-фторурацил и капецитабин, остаются основой лечения многих злокачественных опухолей. Ежедневно тысячи пациентов получают эти препараты в составе схем FOLFOX, FLOT, FOLFIRINOX и других режимов химиотерапии.

Однако у части пациентов даже стандартная доза может вызывать тяжёлые, иногда жизнеугрожающие осложнения: диарею, мукозит, нейтропению и другие проявления токсичности.

Одна из причин - наследственное снижение активности фермента дигидропиримидиндегидрогеназы (DPD), который отвечает за метаболизм фторпиримидинов.

Именно поэтому фармакогенетическое тестирование DPYD позволяет ещё до первого курса выявить часть пациентов с повышенным риском тяжёлой токсичности и индивидуализировать стартовую дозу лечения.

Большинство стандартных фармакогенетических тестов определяет лишь несколько наиболее изученных вариантов DPYD. При этом сам ген значительно более разнообразен, а редкие варианты могут оставаться незамеченными при обычном ПЦР-тестировании.

Исследователи решили посмотреть на эту проблему шире.

В работу включили 339 пациентов со злокачественными опухолями желудочно-кишечного тракта, получавших химиотерапию по схемам FOLFOX, FOLFIRINOX и FLOT.

Вместо исследования только отдельных полиморфизмов специалисты выполнили полноэкзомное секвенирование, что позволило изучить более широкий спектр вариантов DPYD.

Всего выявлено 17 вариантов DPYD, включая распространённые полиморфизмы, известные фармакогенетические маркеры и редкие изменения с потенциальным функциональным значением.

У одного пациента обнаружен установленный вариант со сниженной функцией c.2846A>T, а ещё у 13 пациентов - c.1236G>A, используемый в качестве маркера гаплотипа HapB3.

Таким образом, у 14 из 339 пациентов (4,13%) выявлен установленный вариант со сниженной функцией либо прокси-маркер HapB3. Для окончательного подтверждения функционального гаплотипа HapB3 необходимо дополнительное исследование глубокого интронного варианта c.1129-5923C>G.

Но ещё интереснее результаты анализа редких вариантов.

У 11 пациентов (3,24%) обнаружены редкие изменения DPYD, в том числе p.Thr65Ala, p.Thr65Met, p.Asn151Asp и p.Val691Leu.

🧬Особое внимание привлёк вариант p.Thr65Ala, для которого на момент анализа не удалось обнаружить соответствующий идентификатор rsID или запись в основных фармакогенетических базах данных. Это делает его перспективным кандидатом для дальнейшего изучения.

Публикация коллектива ЦГИМУ - ещё один важный шаг в развитии российской клинической фармакогенетики. Главная цель остаётся неизменной: сделать противоопухолевую терапию не только эффективной, но и максимально безопасной.

Поздравляем коллектив авторов и желаем дальнейших научных успехов!

https://www.mdpi.com/2073-4425/17/9/1082