ПРОДОЛЖЕНИЕ

➀ Про успехи ИИ-докинга: платформы типа REIVENT, действительно, великолепно работают для «доводки» лид-молекулы в сторону повышения эффективности и снижения токсичности. Однако, сам лид ещё ни разу не был найден только инсилико. Это всегда комбинация инсилико и инвитро, причём второе – всегда важнее.

Как были, так и остаются нерешёнными проблемы фармакотерапии многих острых заболеваний, для которых не могут найти эффективные нетоксичные терапии. Когда я говорю, что грантов на ИИ-ДД насосано миллиарды, а результат нолевой, я имею в виду именно то, что с помощью ИИ пока не решена ни одна прикладная задача, в отношении которой бессильными оказались существующие технологии. Я не отрицаю, что ИИ уже хорошо справляется с «полировкой» существующих решений, но восторги апологетов направлены не на это, а на прорывы с большой букву «П».

В случае же трёхпальцевого токсина лаборатория Бейкера создала полностью новый белковый скаффолд, который полностью отличается от всех ранее существовавших подходов. Ранее трёхпальцевые токсины пытались связывать антителами и получалось это плохо, поскольку эти токсины имеют небольшие размеры, не позволяющие нейтрализацию антителами. К тому же, антитела дороги и термолабильны.

Уже давно все мечтали придумать короткий полипептид, который бы таргетно связывал трёхпальцевый токсин, но было понятно, что поиск такой займёт годы перебора структур. А тут аспирантка Бейкера нашла работающую структуру за три месяца с помощью ИИ-инструментов. Это однозначный повод для восторга!

➁ Действительно, противоядие Бейкера может обрушиться в клинических исследованиях. Однако, то, что они уже продемонстрировали стопроцентное спасение крысы от смерти от трёхпальцевого токсина, с большой вероятностью доказывает, что КИ они пройдут. Поэтому не надо нагнетать чернуху.

Но давайте посмотрим на эту историю с совсем житейской стороны! Сусанна Васкес-Торрез, полноватая и несексапильная аспирантка лаборатории Бейкера, прозябала в тени постдоков, которые пытались (и до сих пор пытаются и ещё лет десять будут пытаться) изобрести эндотаги к онкомаркёрам, которые позволять таргетно доставлять химиотерапию к опухолевым клеткам. В лучшем случае эта технология заработает лет через десять, а может быть, не заработает никогда. Но даже если она заработает, Сусанна всё равно останется в тени первоавторных постдоков.

Сусанна это поняла и сделала ход конём: запартнёрилась с датскими исследователями, у которых была крутая база координат трёхпальцевых токсинов и за три месяца (!!!) сделала короткие пептидные ингибиторы. Теперь Сусанна не только имеет первое авторство статьи в Нейчер и оффер на профессора, но, главное, она может обьяснить любому пацану на пляже, чем она знаменита: она изобрела первое в мире недорогое и устойчивое противоядие к самому страшному яду кобры! Многих пацанов это отпугнёт, но некоторых подманит!

А вот постдоки, изобретающие эндотаги, по-прежнему не могут обьяснить своим мамам и девушкам, чем же и зачем они занимаются, кроме получения грантов и отчётности по ним. Мы им очень жедаем, чтобы года через три они смогли обьяснить, но по состоянию "здесь и сейчас" Сусанна их круто обошла на повороте!

➂ Но вот тут вы зря. С одной стороны, никто не спорит, что ИИ-датасайентисты ничего не могут без данных, которые им добывают «мокрые биологи» в лабах. С другой стороны, то, что Сусанна сделала за три месяца, у мокрого учёного заняло бы три года. Я уверен, что вы не будете спорить.

➃ А это вообще смешной шовинистический довод! Я согласен, что у нас в Подмосковье кобры с трёхпальцевыми токсинами — это редкость (если вы не поняли, это шутка и тут надо задорно смеяться – у нас в Подмосковье таких кобр вовсе нет и не будет никогда). Но вот когда я жил с монастыре Суан-Мокх в Таиланде (поставьте плюсик в камменты, если вы хотите ещё послушать монастырских историй), то с удивлением наблюдал монахов-ампутантов, которые круглосуточно истово мели мётлами тропинки в лесу. Я думал, это у них такая медитация. А выяснилось, что это они уже потеряли одну ногу из-за укусов кобр и скорпионов и теперь берегут вторую.