Ряды Фурье

Люди с домашними животными жирнее или стройнее?

Были у нас учёные, которые считали, что собаки помогают владельцам худеть за счёт обмена метаногенными бактериями.

И тут врывается @manwithoutface:

Исследования не показывают такой связи.
Скорее обратную - если хозяин страдает от ожирения, то велика вероятность, что и питомец будет тоже :) но не наоборот

Короче, теперь разбираемся, как же это работает.

До этого владение собакой уже связывали со снижением общей смертности на 24%, меньшим риском астмы и аллергии у детей, более редкими визитами к врачу. Это потому что собаку надо выгуливать, и для этого нужен кто-то, кто будет гулять.

Тут метаанализ. В большей части исследований разницы не видно, а остальные тянут в противоположные стороны и гасят друг друга.

Домашние звери, включая собак, хозяев ни толще, ни стройнее не делают. Собака сама по себе не тренажёр!

А вот в локалях начинается странное. В Америке американцы с собаками часто немного с перевесом (но почти никогда не жирные) — так, 4-5 килограмм от нормы сверху. Самые толстые — те, кто не выгуливают собаку.

Тут про Канарские острова. Ветеринары оценили упитанность собак, взяли у них кровь натощак и измерили давление, а хозяев взвесили и измерили на медицинских весах. У 40% собак ожирение, и больше половины толстых собак с букетом из давления, сахара и триглицеридов, который у людей называют метаболическим синдромом.

Если хозяин полный, шанс, что его собака тоже толстая, около 78%; если стройный — около 12%. Главная версия — общие пищевые привычки семьи: собака ест то же и так же, как хозяин (все собаки получали остатки со стола).

Тут проверяли, помогает ли толстая собака худеть толстому хозяину, если худеть вместе. И с собакой, и без неё люди сбросили примерно по 5% веса и стали двигаться полчаса в день. Собаки худеть сильнее не помогли, зато сами похудели на 15% и стали для хозяев напарником, который никогда не отговаривает от пробежки.

Британское исследование. Чем полнее хозяин, тем толще собака. У кошек ничего подобного.

Так что нет, если вы заведёте собаку, ещё не факт, что вам с ней гулять, а не вместе смотреть сериалы.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Лучшие посты
Судя по выражениям «уставший как собака», «голодный как собака» и «побитый как собака», быть лучшим другом человека — так себе идея!

— А вот у меня сестра выпила эту таблетку и помогло!

Это нифига не доказывает. Может, помогла вода. Может, она бы сама выздоровела и без таблетки. Может, съела в дополнение заячий помёт. Чтобы проверить, что же сработало, надо получить полную копию человека и одной версии дать таблетку, а второй не дать. И дальше держать их в идеально одинаковых условиях.

Так сделать пока сложно, поэтому есть такие штуки — клинические исследования. И вот нас спросили, можем ли мы просто объяснить, как они проводятся.

Враг медицины — самообман. Люди обожают видеть причину и следствие там, где их нет.

Лучшие практики:
— Нужны большие группы людей, потому что люди очень разные, у них долгая биография. С мышами всё проще, там вам вырастили чистых и свежих и они примерно одинаковые.
— Толпу делим на тех, кто пьёт таблетку и тех, кто не пьёт, чтобы потом понять разницу.
— По группам людей делим строго подбрасыванием монеты. Потому что врачи очень хотят решать, кому новая таблетка может оказаться полезнее, и, например, включить в основную группу самых тяжёлых.
— Дальше делаем плацебо для контрольной группы, которое выглядит как настоящая таблетка. И не говорим ни врачам, ни пациентам, никому, какая группа что пьёт, чтобы никто ничего не выдумывал.
— В конце надо проанализировать данные и высчитать разницу между группами, не зная, где какая.
— Лучше всего не опрашивать, а получать физические показатели вроде анализа крови.
— Тестировать можно только одну цель. Если у вас таблетка для повышения артериального давления, и вы вдруг поняли, что она для размножения человека — это надо унести в другое исследование.
— Если пациент не пил таблетку — он всё равно считается. Вот, скажем, выпил раз, его стошнило, он выкинул банку в окно и месяц лечился мочой. Ему стало хуже. Производитель лекарства будет умолять убрать его из выборки, но вот хрен ему через всё рыло. Реальный мир суров.

Дальше этапы:
— Доклиника — животные и культуры клеток. Проверяем, что таблетка не убивает клетки и не лопает мышей.
— Фаза I — дают здоровым людям, проверить, не лопнут ли они. Повышают дозу, пока не станет херово.
— Фаза II — дают сотням больных. Проверяют, работает ли таблетка вообще и какая доза лучше.
— Фаза III — тысячам больных. То самое двойное слепое исследование (и это не когда два хирурга читают ЭКГ). После можно продавать.
— Фаза IV — после регистрации. Ррраз — пришёл мужик и сказал, что у него сосед от него лопнул. Четвертая фаза отлавливает редкие побочки.

Ну и там немного этики — пациенту человеческим языком объясняют все риски, и он подписывает бумагу. Любой может уйти из исследования в любой момент без объяснения причин. До начала эксперимента ученые должны зарегистрировать его на специальном ресурсе — это чтобы если лекарство провалится, компания не смогла по-тихому сныкать результаты. За исследованием следит независимый комитет, могут остановить в любой момент.

Если хотите копаться дальше:
— Описание протокола CONSORT 2025 — стандарта того, как надо проводить исследование и как конкретно отчитываться.
— Такой же по протоколу SPIRIT, его опубликовали в 5 самых крупных медицинских журналах, чтобы дошло не только лишь до всех.
— Ещё детали разработки протоколов и разные забавные грабли
— Хельсинкская этическая декларация
— Два врача могут смотреть на один и тот же результат испытания и понимать под ним разные вещи. Тут стандарт формулировки результата.
— Адаптивный подход, можно заранее планировать вилки "если это не случилось" или "если пациенты покрылись шерстью".
— Испытания сразу кучи препаратов.
— До рынка доходит примерно каждый 7-й препарат, но в онкологии — каждый 30-й, и идёт он туда 13 лет.

Ну а самое обидное — это когда лекарство офигительно работает, а вы в конце исследования узнаёте, что были в группе плацебо, и теперь надо ждать несколько лет, пока препарат выйдет на рынок.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Самые здоровенные посты
Уринотерапия — все препараты вы выписываете себе сами!

Есть такой рак-богомол. Этот хрен видит 12 цветных каналов (мы только 3, если что, а пчёлы и птицы 4) и 6 поляризационных (мы ни одного).

Цвет — это длина волны. Поляризация — в какую сторону она колеблется. Муравьи ориентируются по поляризованному свету неба, водные жуки находят так поверхность воды.

У рака всё это в диапазоне от ультрафиолета до конца видимого нам света (без инфракрасного). То есть у него все задатки стать лучшим цветовым дизайнером, потому что цвет он видит далеко за привычными нам шкалами.

Точнее, мог бы, если бы у него было достаточно мозга.

Хватит ли у него способностей стать дизайнером, выяснить не удалось, но:
— Цвет он различает хуже нас — до мозга доезжает всё это с очень большим округлением до 25 нм. Мы в середине спектра в зелёных цветах различаем с точностью 1-2 нм, а в несъедобных цветах (наши предки ели листву) вроде фиолетового — 10-20 нм.
— Система, похоже, не сравнивает сигналы каналов между собой, а считает их отдельно — скорость важнее точности.

Есть камеры, которые могут снимать и цвет, и поляризацию — но они тяжёлые и дорогие. В них используются сложные системы линз, призм и разделителей луча. Из-за этого пиксели цвета и поляризации часто не совпадают друг с другом с идеальной точностью (погрешность десятки пикселей).

Начали реверсить рака:
— В обычных матрицах фотоаппаратов пиксели RGB лежат рядом друг с другом (фильтр Байера). У рака клетки расположены друг под другом стопкой. Синий свет поглощается на самой поверхности (на глубине около 400 нанометров), зеленый проникает чуть глубже (до 1 микрометра), а красный уходит глубже всего (до 3 микрометров). Один элемент фиксирует сразу три цвета.
— Поверх этого пирога прямо на чип напылили микроскопические решетки из алюминиевых нанопроводов (шириной всего 75 нанометров). Они работают как жалюзи, пропуская свет только с определенным углом поляризации. Нанопровода расположили блоками 2х2 с углами 0°, 45°, 90° и 135°.

Собрали полноценную матрицу 1280 на 720 пикселей и протестировали. Потребление 250 милливатт (примерно как в телефоне). Очень хорошее качество съёмки поляризации, пространственный шум 2% (норма 5%), точность высокая. Но очень херовый шум считывания, поэтому камера работает только при хорошем освещении. Из-за интерполяции по поляризации ещё и результирующее разрешение ниже физического.

Поныряли с ней около Австралии, снимали каракатиц, кальмаров и раков-богомолов. Оказалось, они имеют на теле поляризационные узоры, невидимые нам, которые используют для маскировки или общения друг с другом.

А вот прикладные применения этой камеры:
— Вскрыли мозг живой саранче, направили на него свою камеру (снимая 20 кадров в секунду) и начали пускать насекомому в усы разные запахи (гексанол и октанол). И увидели без красителя, как в ответ на запах меняется поляризация нейронов мозга. Изменения микроскопические: отражение менялось всего на 0,38% для одного запаха и на 0,45% для смеси. Но этого хватило, чтобы увидеть работу мозга вообще без внедрения красителей!
— Растягивали тонкий срез коровьего сухожилия с частотой 1 раз в секунду. Камера в реальном времени показала изменение угла поляризации, который напрямую соответствует тому, как выстраиваются и натягиваются коллагеновые волокна.
— Примерно 50–80% так называемых плоских предраковых и раковых поражений кишечника пропускаются врачами, потому что на обычной камере они не отличаются от здоровой слизистой. Ученые подключили матрицу к эндоскопу и исследовали кишечник мышей. Было хорошо видно как тёмные пятна.

Слабые места — в конструкции. Например, нанолитография для алюминиевых решеток нестабильная, поэтому там куча битых и кривых датчиков, и нужна компенсация программным фильтром. Ну и интерфейс — поляризацию врач не видит, приходится показывать отдельно.

Так рак помог искать рак!

Фотографии Cédric Peneau.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Лучшие посты
— Эй, лосось, знаешь, мы назвали в твою честь цвет!
— О, это тааак мило! Серебристо-голубой, да?
— Э.. как бы тебе сказать...

Простите, что врываемся в ваш сон, но у нас сказка на ночь про шмелей. Очень короткая.

Далеко-далеко выдры жонглируют камнями, макаки перебирают гальку, а человеки берут мид. В общем, все играют. Непонятно с насекомыми. Думали, они прям совсем глупые и очень серьёзные. Это обычно сочетается.

Но вот в одной из далёких-далёких лабораторий шмелей учили катать шарики, чтобы они меняли их на сироп. И что-то эти шарики шмелей очень прикололи, и они специально летали к ним и катали. Просто катали и пёрлись. Весело же!

Этот вопрос надо было изучить. Взяли 5 критериев игры Бургхардта: не решает задачу выживания, не даёт внешней награды, отличается по форме от функциональных действий (а то это обучение) и повторяется, но не стереотипно, то есть это не случайность и не механический тик, начинается в спокойном состоянии.

Сначала проверили, будут ли шмели катать шарики, если можно не катать. 37 из 45 шмелей катали и тащились! Чем больше у шмелей было свободного времени, тем чаще они их катали. Катание оказалось очень приятным (шмель шёл в комнату, цвет которой обещал шарики). Ни разу ни один шмель не выпустил хоботок к шарику и не грыз его. Ни разу самец не выдвинул гениталии у шарика. При этом у самцов в среднем было 330 катаний на мохнатое рыло. Катали неровно по дням — могли 4 секунды, могли 31. Стресса нет, на стереотип тоже не очень похоже, защитного жужжания не было. По шмелю так-то тяжело установить, счастлив ли он, но было очень похоже.

Пик катания на 3-7 дней возраста — это как раз тот момент, когда грибовидные тела мозга — центры памяти и обработки ощущений очень пластичны. У нас тоже пик игры приходится на окно пластичности мозжечка.

Играют ли шмели в дикой природе и есть ли от этого польза — не узнали, потому что проверяли только в лаборатории.

Но уж точно шмели знают толк в развлечениях и умеют радоваться! И даже при их маленьком мозге им бывает зверски весело!

--
Вступайте в ряды Фурье! | Самые весёлые посты
Мёд — это отрыжка насекомых, причём это полупереваренные выделения половых органов растений.

Помните пост, где мы рассказывали, как математика Николая замечательно подкололи с честным знаком?

Ну, короче, к нам постучала пресс-служба ЦРПТ по поводу этой публикации.

"Просим вас удалить или дополнить материал нашим комментарием. Мы в свою очередь открыты к диалогу и готовы предоставить любую необходимую информацию. Спасибо!"

Ну, что ж, приятно, когда кто-то открыт к диалогу. Вначале они там немного учат Николая бизнесу, давая советы, как ему лучше вести дела. Потому что что там эти математики понимают в ценах операций с товаром, правильно?

"Отзывать весь товар с маркетплейса для маркировки не обязательно — производители и импортёры маркируют продукцию до отгрузки на склад площадки. Если товар уже находится на складе маркетплейса немаркированным, его можно промаркировать там же через услугу маркировки остатков, которую предоставляют сами площадки."

Дальше переходят к конкретике по себе:

"По поводу сложностей со сканированием кода на кошачьем корме — качество считывания зависит от способа нанесения кода и поверхности упаковки. Если код наносится корректно по техническим требованиям, проблем со сканированием не возникает. При стабильных трудностях со считыванием стоит обратиться в поддержку оператора — это решаемый технический вопрос."

Раз они читают наш канал, расскажите, пожалуйста, насколько вам удобнее и приятнее стало покупать товары после введения честного знака, если вы продаёте — насколько лучше стало продавать, если вы конечный покупатель — понимаете ли, как он вас защищает, от чего, и пользуетесь ли этим. Потому что мы, честно говоря, вообще до сих пор не знаем, зачем он.

На всякий случай — придерживайтесь, как и мы, оценочных суждений и персонального опыта )

И да, обещаем, что любая пресс-служба, обратившаяся к нам, точно так же будет услышана!

--
Вступайте в ряды Фурье! | Самые обсуждаемые посты
Из холодильника исчез пармезан. Среди грибов была сыроежка!

Примерно половина людей в мире жирные. В смысле, страдают ожирением или проблемами с метаболизмом. В основном они выражаются в ожирении.

И вот, предположим, такой пациент честно жрёт положенное количество калорий (а не пытается обмануть себя или программу учёта) и честно тренируется. Но! Ему же нужно трекать прогресс, правильно? В особенности сложно понять, когда организм уже перешёл с дневного питания на расщепление запасов жира.

А если что, жир мы по факту выдыхаем. Он выходит не через задницу, а как раз через дыхание.

Если углеводы кончаются, печень начинает расщеплять жирные кислоты, производя кетоны. Там появляется ацетон, который попадает в кровь и выходит через лёгкие.

Измеряя уровень ацетона в выдохе, можно в реальном времени понять, сжигаете вы сейчас жир или нет.

Термодинамика — неумолимая наука, и если у вас есть дефицит калорий, то в трубочку дышать не надо. В смысле, прибор бесполезен, по идее. А если вам не хватает данных про метаболизм, есть отличные носимые датчики сахара в тканевой жидкости.

Но! С прибором человек бы получал мгновенное подтверждение, что вот сейчас он всё делает правильно; у него была бы какая-нибудь игрофикация для безвольных; тяжелее было бы накосячить с диетами так, чтобы жечь мышцы вместо жира и вообще.

Лабораторные масс-спектрометры — так себе идея для быта. А портативные "кето-дыхательные аппараты" для домашнего использования часто врут из-за влажности и неправильного забора воздуха — домашние датчики редко кто-то опускает в лёгкие, обычно воздух в датчик попадает из той части, где в человека вкрячен рекуператор.

Звучит как вызов, правильно?

И вот решили сделать прибор, который всё-таки помогает измерять ацетон. И даже сделали.
— Во-первых, там датчик давления. Когда человек дует в мундштук, на экране телефона появляется круг. Пользователю нужно дуть так, чтобы круг оставался в заданных границах (давление 4–10 гПа). Прибор ждет, пока выйдет около 70% объема легких, и только в самом конце автоматически забирает порцию воздуха.
— Внутри специальная сорбционная колонка (фильтр-ловушка). Она физически разделяет водяной пар и ацетон. Вода проходит мимо, а ацетон задерживается и затем попадает на хеморезистивный сенсор.

В 8-месячных тестах погрешность 6,1% и не деградировал, то есть не завышал и не занижал базу. Это очень хорошо.

Дальше собрали 12 здоровых человек и сделали параллельную проверку на масс-спектрометре размером со шкаф и вот этой девайсине. Ещё троих оставили на 3 недели издеваться:
— При легкой пробежке и макаронах после уровень ацетона низкий. Жир не горит.
— После тяжелой интервальной тренировки и последующего голодания (или жирной пищи) картина резко менялась. Через 3,5 часа после спорта уровень ацетона взлетал в 5-10 раз, у разных людей по-разному.
— Обычная еда неделю — ацетон низкий и стабильный.
— Кето-диета на неделю, жесткое ограничение углеводов — до 25 граммов в день — уровень ацетона начал дико расти.
— Интервальное голодание на неделю 16/8 с обычной едой — ацетон оставался чуть выше базового уровня.

Если что, это не значит, что после тренировки не надо есть белок или что-то ещё, это они над бензопилой прибором издевались.

Портативный детектор не врал. Сборка — высшей технической школы Цюриха (там крутые инженеры) и клиникой Цюриха (врачи там не такие крутые, как инженеры).

Есть конфликт интересов, университет профинансировал производство прибора, авторы в учредителях компании, и они монетизируют науку в хвост и гриву. Журнал Device из Cell Press. Слабые места работы — малая выборка, плюс прототип надо было калибровать каждую неделю баллоном с эталонным газом, что человек дома обычно сделать не может, у него лапки.

Ещё про жир:
— Минус сосуды головного мозга
— Минус память
— И надо тренироваться, если хотите оставаться умными

--
Вступайте в ряды Фурье! | Самые сочные посты
— Что-то печень побаливает…
— Одеколон пили?
— Не помогает!

@agams спросил про куда там делись все исследования про выращивание новых зубов.

Зуб — не ткань. Создание такого объекта вызывается специальным конструктором, и там дофига этапов и химических сигналов. Код у нас есть, а вот стартовых ресурсов нет. Но можно заново запустить эмбриональную программу.

Это иногда случается — так-то зубы хотят расти по всему организму. Точнее, там, где мигрируют первичные половые клетки, включая шишковидную область мозга. Поэтому когда вы останавливаете подавитель роста зубов, часть прорастает у вас во рту. В стоматологии уже был грустный опыт с BMP-2. Там сначала росли не всегда зубы, а потом не всегда во рту.

Поехали по работам!

Взяли эпителиальные и мезенхимальные клетки у мышиного эмбриона, положили в гель, вырастили зуб в инкубаторе, выбили зубы взрослым мышам, подсадили. У 34 из 60 мышей зуб успешно прижился. Остальное — по большей части косяки микрохирургии, мыши не очень крупные, а учёные не очень ловкие. К 49-му дню зуб дорастал до противоположного и останавливался. Оказался таким же прочным, как родной. Мышь немного посверлили до нерва, ей было больно, то есть нервная передача работала.

Главные сигнальные пути роста зуба — BMP и Wnt. За торможение роста зубов отвечает белок USAG-1, он давит эти два пути (и не только он, но он главный). Вопрос: а если у мыша удалить такой белок генетически, то будет профит?

Сварили моноклональные антитела и ввели мышам. Оказалось, Wnt трогать не надо, мыши не выживали. Что-то ещё трогать тоже не надо, поэтому подошла только пара антител. BMP норм, возвращал недостающие зубы. Правда, у некоторых мышей вместо новых зубов вырастали сросшиеся гигантские моляры. Хорькам (у них зубы ближе к нашим) пришлось вводить дозу в 5 раз больше, делать это трижды и дополнительно подавлять их иммунитет, но у них вырос новый зуб сверх комплекта.

А вот история про то, что rhBMP-2 немножко опаснее, чем было в исследованиях производителя. Примерно в 50 раз. Проверяли на позвоночнике. Препарат растворял кости, разворачивал эякуляцию обратно, душил за шею и, очень возможно, провоцировал рак. Заодно узнали, что в ранних исследованиях у 70% их пациентов кости начали бесконтрольно разрастаться внутрь позвоночника, угрожая параличом. И самый прикол — рядом там фраза вывода: «Исследование подтвердило безопасность препарата... никаких непредвиденных осложнений не выявлено».

Вероятно, это вторая по оптимистичности фраза в истории человечества. Первая из авиаинцидента 1982 года: «Дамы и господа, говорит командир корабля. У нас небольшая проблема. Все четыре двигателя нашего самолета остановились, и мы делаем всё возможное, чтобы их запустить. Надеюсь, это не доставляет вам слишком много беспокойства». Если что, они норм приземлились в Джакарте.

Собственно, в 2008 FDA остановило использование BMP-2, и так он кончился в стоматологии — но формального отзыва именно по зубам не было.

Про костный морфогенетический белок BMP в целом.

И, конечно, наша сегодняшняя звезда — случай с тератомой (опухолью) на 10 кг, в которой нашли под 300 зубов сразу, волосы, ткани кишечника и прочее, но не раковые клетки. Зубы были без корней, но имели нормальную коронку, эмаль и дентин. Там, кстати, по ссылке увлекательные фото.

Выяснили, что яичниковые тератомы — результат развития из неоплодотворенной яйцеклетки. Яйцеклетка женщины начинает развиваться в эмбрион без сперматозоида. Процесс её созревания заклинивает. Но часть конструкторов дорабатывают — там зубы, волосы и кожа, например.

Но есть хорошая новость! Если на УЗИ видно целый зуб в опухоли — она точно доброкачественная. Раковые клетки не дают зубам нормально собираться.

А по росту зубов — испытания идут в той же Японии. Первый прогноз — если у всех вырастут зубы (в нужных местах и не вырастет ничего другого) — начнут в 2030 по узким показаниям, ещё через пару лет шире.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Лучшие посты
— Что теперь надо сказать тёте-стоматологу, когда она долечила твои зубки?
— Я тебя запомнил!!

Был в биологии большой проект, почти как БАК — Геном человека. 3 миллиарда долларов, 13 лет, тысячи учёных со всех стран. Ждали, что мы прочитаем исходник человека и сразу всё станет понятно. Например, найдём ген для каждой болезни.

Но выяснилось, что ДНК всех людей совпадает на ≈99,9%. То есть вы в своей основе вот почти точно такой же, как Эйнштейн, Месси или там какой-нибудь австрийский художник. Ну, может, чуть другой, но там изменение буквы даёт примерно разницу как кот и кит. А вот генов, кодирующих белки, у нас всего около 20 тысяч — это меньше половины генома (у помидора, кстати, 31,7 тысяч — он не может убежать, ему нужна библиотека действий на все случаи жизни). А у пшеницы около 100 тысяч, но это уже мы накосорезили, соединив 3 разных злака.

Но вернёмся к самому интересному. Если генетический код у всех близок, почему мы так по-разному выглядим, по-разному реагируем на среду и болеем разными болезнями? Ну, кроме того, что есть разница вот в этом "почти такой же"?

Ответом стала эпигенетика — среда включает и выключает наши гены, не меняя саму последовательность ДНК. То есть у нас там дофига системных настроек уже внутри кода. Условно и очень грубо говоря, ДНК — это наше железо, а эпигенетика — наш конфиг. Ну или перемычки, если вы их помните )

Тут обзор, чего же удалось добиться к 2026.

Что знаем про переключатели:
— Ген можно закомментировать (заметилировать), тогда он не будет читаться.
— В ядре клетки ДНК не плавает просто так, она плотно намотана на белки-катушки — гистоны. Можно запретить чтение с некоторых гистонов.
— РНК нужна не только для создания белков. Есть микроРНК (очень короткие обрывки, всего 22-23 нуклеотида), которые прилипают к рабочим РНК и уничтожают их, блокируя создание белка на финальном этапе. То есть такой белок не выпустит контроль качества — там говорят "Код говно, переделывай!". И переделывает, чё. Ещё не зная, что код всё равно говно, как ни старайся.

Какие болезни можно лечить:
— Рак — классика сломанных переключателей. Полезные гены (супрессоры опухолей, которые тормозят деление клеток) оказываются заблокированы. А вот опасные онкогены и участки нестабильной ДНК как раз теряют свои блокирующие метки и начинают работать на полную.
— При атеросклерозе (закупорке сосудов бляшками) есть глобальная потеря метильных меток на участках генома LINE-1. В гладкомышечных клетках сосудов выключаются гены рецепторов эстрогена, из-за чего сосуды теряют эластичность. При гипертонии ломаются настройки генов, отвечающих за водно-солевой баланс и реакцию на гормон стресса кортизол.
— Аутоиммунные (волчанка, ревматоидный артрит, рассеянный склероз, диабет 1 типа) — эпигенетика ломает систему свой-чужой. Например, при волчанке гены иммунных клеток Т-лимфоцитов теряют тормозные метки, из-за чего иммунитет становится гиперактивным и начинает атаковать собственные ткани. При диабете 1 типа блокируется важнейший ген FOXP3, который в норме должен успокаивать иммунную систему.

Эти изменения обратимы. Не очень легко переписать ДНК, но легче снять с неё лишние химические метки.

Сейчас есть два подхода:
1. Эпи-лекарства — блокируют ферменты, вешающие метки. Например, 5-азацитидин и вориностат уже одобрены FDA и для некоторых видов рака крови. Но они снимают вообще все метки, и это ведёт не к тому, что вы становитесь худой блондинкой, а к высокой токсичности. В смысле, биохимической.
2. CRISPR-dCas9. Взяли ножницы CRISPR/Cas9 и оставили только ту часть, которая ищет нужный участок. Эту сломанную торпеду обмазывают ферментом, который вешает или снимает метку. Хреновина находит конкретный ген, стукается об него и пачкает его своим солидолом, то есть выключает/включает только его.

Собственно, всё. 23 года, наконец-то приближаемся к тому, чтобы начать править весь этот говнокод.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Лучшие посты
Знаете, как микробиологи называют человека, побывавшего на всех континентах? Человек многих культур!

В чате попросили день накидывания мемов (собственно, он уже идёт!). Накидайте, пожалуйста, странных мемов!

Жизнь на Марсе, возможно, не очень-то и жизнь.

Есть такой офигенный опыт «Химические сады». Зерно соли железа (FeSO₄, FeCl₃) бросают в раствор силиката натрия. Вокруг зерна мгновенно образуется полупроницаемая мембрана силиката железа; осмос раздувает её, мембрана рвётся, и из разрыва растёт трубка. Получаются отличные самоорганизующиеся структуры, которые похожи на биогенные.

Проблема в том, что они много кого обманули. Признаки как у жизни: полые круглые сечения, некристаллографическое ветвление постоянной толщины, анастомозы, вложенность в чехлы. На этих находках строились громкие заявления об обнаружении следов жизни возрастом 4 миллиарда лет в Канаде или древнейших грибов аж на 2,4 миллиарда лет в Южной Африке.

И так же определяют разные аналоги марсианских подповерхностных микрофоссилий.

Если хотите изучать происхождение жизни, то вам надо изучать каменюки под микроскопом. В очень древних породах, которым миллиарды лет, находят крошечные структуры из минералов железа. Ладно, вы уже знаете, что это, но коротко — их принимали за окаменелые останки древнейших бактерий или грибов.

И тут чувак Шон Макмахон подумал "Да вы охренели там что ли?!" или что-то подобное. Взял банку и доказал, что можно повторить процесс чисто химически. Собственно, в работе он это сделал на макроуровне и микроуровне и всё измерил. Всё получилось ровно так, как надо. То, что структура выглядит как ветвящаяся клеточная нить, ничего не доказывает. Чувак с банкой уделал кучу коллективов учёных, стал рок-звездой среди астробиологов и доцентом астробиологии в Эдинбургском университете. Дальше он ещё несколько раз проделывал этот же фокус, повторяя другие следы жизни.

Вот, например, с коллегами формулировал ТЗ для нового марсохода. Про трубочки вы уже знаете, ещё там кое-что можно сделать с помощью математики и краски с автомобильных заводов. Если дать палентобиологам бампер от Форда, то они там найдут такие же фрактальные структуры, которые десятилетиями принимали за древнейшие следы жизни на планете — строматолиты.

В этой работе организовали соревнование между химическими садами и бактериями:
— У живой бактерии трубка формируется вокруг гладкой клетки микроба. Из-за этого внутренняя поверхность трубки получается очень гладкой и плотной (она повторяет форму микроба), а снаружи на неё хаотично налипают хлопья железа — она становится рыхлой и бугристой.
— У химического сада всё наоборот. Тонкая внешняя стенка формируется мгновенно на границе двух жидкостей, поэтому она гладкая. А вот изнутри на нее продолжают нарастать грубые рыхлые кристаллы железа.
— Бактерии делают по ГОСТу на 1,7 микрометров в диаметре (это ГОСТ конкретных Leptothrix) и соблюдают разумные углы.
— Трубки химических — от 1,7 до 11,8 микрометров с диким разбросом. Отклонения по углам тоже высокие.
— Бактерии жрут железо, забирая из него энергию. Они берут ионы Fe2+ и выделяют полностью окисленное железо Fe3+ (это, кстати, причина, почему можно выплавить себе нож из рыжей взвеси на дне озера). В бактериальных трубках не осталось ни одного процента Fe2+.
— В химических садах застревает часть неокисленного Fe2+.

Но! В реальности за миллионы лет давление и температура заставляют минералы кристаллизоваться заново. Тонкие текстуры стираются, а химический состав меняется. Поэтому для древнейших марсианских или земных пород этот метод, увы, может не сработать.

Здесь их ещё запекли в печи и получили сложную органику. Эта искусственная органика такая же, как нашли в древних окаменелостях. Значит, органика внутри древних камней — тоже не доказательство жизни. В природе 3,5 миллиарда лет назад были все ингредиенты (барий, стекло, вода, тепло и простая органика), чтобы лепить такие каменные спиральки без участия реальных бактерий.

--
Вступайте в ряды Фурье! | Лучшие посты
— Есть ли жизнь на Марсе?
— У меня там дача!