TGViewer
Channel Public Channel
Заметки лабораторного кота

Заметки лабораторного кота

@catfromlab

Заметки дилетанта широкого профиля.
Subscribers
474
Photos
473
Videos
32
Links
753

Showing posts older than #1791 · Back to latest

Older Posts 20 shown
Post #1790 166
Заметки лабораторного кота Почему, когда я работаю в лаборатории, каждый, кто заходит, считает своим долгом пошутить про Пабло Эскобара...
Химическая лаборатория у биологов: идеальный порядок, чтобы не завелась никакая ненужная жизнь.

Химическая лаборатория у химиков: идеальный беспорядок, чтобы случайно произошло самозарождение какой-нибудь жизни.
  • 🔥 5
Post #1788 179

Forwarded from Биоэтика и биотех

Открыт BRP - эндогенный пептид, эффективно подавляющий аппетит и вызывающий потерю веса, механизм которого принципиально отличается от агонистов GLP-1.

Авторы разработали вычислительный инструмент Peptide Predictor для поиска новых биологически активных пептидов, предсказывая сайты разрезания ферментами семейства PCSK (это 9 молекулярных ножниц, отвечающих за созревание гормонов).

Среди сотен предсказанных пептидов они идентифицировали 12-аминокислотный пептид BRP (BRINP2-related peptide), который является продуктом расщепления белка BRINP2 (это прогормон из головного мозга, роль которого была раньше малоизучена).

На мышах и мини-пигах BRP продемонстрировал мощный анорексигенный эффект (снижение аппетита) и способность обращать ожирение вспять, действуя через центральную нервную систему (гипоталамус) и независимо от рецепторов GLP-1, лептина и MC4R (* это рецептор меланокортина 4-го типа на мембранах нейронов гипоталамуса - центральный переключатель между чувством голода и сытости)

При этом BRP не вызывал тошноты и отвращения, а действовал быстро.

Похоже, что скоро у исследователей, а потом и на рынке, появятся новые препараты.

Ps.
🔸Для человека нужно будет все 100 раз проверить, возможно что эффективная доза вызовет побочные эффекты
🔸До сих пор не найдены рецепторы для BRP
🔸До сих пор не ясны роли большинства найденных гормонов, в том числе что ещё делают BRP и BRINP2
Nature Prohormone cleavage prediction uncovers a non-incretin anti-obesity peptide Nature - Computational drug discovery is used to identify a 12-mer peptide derived from BRINP2 with potent anti-obesity effects that are independent of leptin, glucagon-like peptide 1 receptor and...
  • ❤ 4
Post #1787 217
Группа русских учёных из Петербургского института ядерной физики и Санкт-Петербургского государственного университета впервые определила кристаллическую структуру фермента RelSeq. Чем эта работа так интересна?

Фермент RelSeq из бактерии Streptococcus equisimilis помогает бактериям переживать стрессовые условия, синтезируя и гидролизуя сигнальные молекулы (p)ppGpp. Этот
сигнал улавливают другие белки и запускают изменения в клетке, в частности, приостанавливают ее рост и переключают обмен веществ на режим экономии. Поскольку такие перестройки помогают бактериям выжить, ученые стремятся заблокировать их, чтобы бороться с болезнетворными микроорганизмами, в том числе устойчивыми к антибиотикам. Однако, чтобы нацелить лекарство на фермент RelSeq и прервать цепочку последующих реакций, нужно знать его строение и механизм работы.

Авторам исследования удалось не только получить и проанализировать кристаллы фермента RelSeq, но и исследовать его взаимодействие с самой сигнальной молекулой молекулой pppGpp.

Оказалось, что pppGpp способен связываться сразу с несколькими участками фермента, отвечающими за синтез и за разрушение pppGpp. Компьютерное моделирование показало, что фермент обладает гибкостью: его участки способны смещаться друг относительно друга. Также авторам удалось определить наиболее предпочтительные места связывания алармона pppGpp. Таким образом, существует сразу несколько точек, от которых зависит стабильность и работа фермента — именно их потенциально можно будет использовать для нацеливания препаратов, блокирующих RelSeq.

Работа является хорошим примером борьбы с бактериальными инфекциями не через прямое уничтожение патогена, а через лишение его способности адаптироваться к стрессу, что особенно актуально в условиях роста антибиотикорезистентности.
MDPI Structural Basis of pppGpp Binding to the N-Terminal Domain of the Bifunctional RelA/SpoT Homolog RelSeq: Crystal Structure and… RelA/SpoT homologue family enzymes participate in controlling the cellular levels of the alarmone (p)ppGpp, thereby activating the stringent response and promoting survival under stress conditions. These proteins contain an N-terminal catalytic domain and…
  • 👍 3
Post #1786 182
Заметки лабораторного кота Вот так и живём.
Такие дела.
  • 💯 8
  • 🙈 1
Post #1784 172
Белковое секвенирование остаётся одной из самых сложных задач современной молекулярной биологии, в отличие от хорошо отработанных методов секвенирования ДНК и РНК.

Но недавно группа китайских исследователей из Нанкинского университета предложила новый метод, использующий нанопору MspA с иммобилизованными ионами никеля для распознавания пептидов. В отличие от классического подхода, где молекулы проходят через пору насквозь, в этом методе пептид «пришпиливается» к иону никеля в устье поры на время от десятков миллисекунд до секунд. Этого времени достаточно, чтобы измерить уникальный электрический сигнал, который отражает последовательность аминокислот в пептиде.

Применяя машинное обучение для анализа сигналов, авторы смогли распознать все 20 протеиногенных аминокислот, посттрансляционные модификации и даже пептиды длиной до 39 остатков. Метод позволяет детектировать мутации, например, в неоантигенах BRAF и KRAS, а также идентифицировать биологически активные пептиды. Главным достижением стала демонстрация возможности сборки полной последовательности пептида по перекрывающимся фрагментам, полученным при гидролизе трипсином и термолизином.

Хотя метод пока ограничен длиной пептидов и требует больших обучающих выборок для машинного обучения, он открывает принципиально новые возможности для прямого анализа белков и пептидов на уровне одиночных молекул. В отличие от масс-спектрометрии, этот подход потенциально способен работать со сложными смесями без предварительного разделения и может стать основой для диагностики, мониторинга терапии и фундаментальных исследований.

Авторы подчёркивают, что их разработка особенно перспективна для детекции мутантных пептидов и модифицированных форм, связанных с возрастными и онкологическими заболеваниями. Однако для внедрения в клиническую практику потребуется решить вопросы пропускной способности и адаптации метода к неочищенным биологическим образцам. Тем не менее, работа демонстрирует, что нанопоровое секвенирование белков может стать реальностью уже в ближайшем десятилетии, дополнив и, возможно, частично заменив существующие протеомные технологии.
Nature High-resolution nanopore peptide sensing, profiling and sequence assembly Nature Nanotechnology - A nickel-modified nanopore enables simultaneous, unambiguous identification of amino acids and peptides. Direct analysis or hydrolysis-based sequencing can be used for...
  • 👍 5
  • 🔥 1
Post #1783 178
Заметки лабораторного кота Вынесено из комментариев: Химия зародилась в средние века из алхимии, которая позднее разделилась на загнивающую химию и благородную науку самогоноварения.
Вынесено из комментариев:

-> На самом деле химия – единственная наука негреческого происхождения. Слово "химия" (в латыни и оттуда в других европейских языкаэ - "шэми") происходит от слова "Шам", что означает "Египет", и указывает на древнеегипетское происхождение этой науки.

PS: перегонку и пивоварение придумали древние египтяне, а использовать перегонку для получения спирта придумали арабы. Думайте!

-> Может от бальзамирования фараонов пошло?

-> Не исключено. Но скорее всего – от пивоварения. Без фараонов прожить можно, а без пива – нельзя.
  • ❤‍🔥 6
Post #1782 171
Заметки лабораторного кота В журнале Infectious Diseases of Poverty вышел обзор, который систематизирует имеющиеся данные о клиническом применении широконейтрализующих антител (bNAbs) для терапии ВИЧ-1. Напомню, широконейтрализующие антитела представляют собой антитела, которые в…
Широко нейтрализующие антитела, нацеленные на белок оболочки ВИЧ, являются перспективными терапевтическими средствами. Но хотя они могут контролировать виремию у людей с ВИЧ, эти препараты, к сожалению, не способны очистить организм после того, как резервуар уже сформировался. Альтернативой им может служить леронлимаб, гуманизированное моноклональное антитело класса IgG4, которое связывается с N-концом и второй внеклеточной петлей корецептора ВИЧ CCR5. Леронлимаб показал противовирусную активность у людей с ВИЧ и хорошо переносится.

Американские ученые из Орегонского университета науки и здоровья попробовали использовать комбинацию этих препараты для предотвращения образования скрытых резервуаров ВИЧ у детенышей макак-резусов. Они использовали комбинацию широко нейтрализующих антител, антиретровирусной терапии (АРТ) и леронлимаба. Лечение, начатое через 72 часа после заражения детёнышей макак, привело к отсутствию вирусных копий в плазме и тканях спустя год после окончания терапии. По мнению учёных, такой подход потенциально может быть эффективной стратегией лечения новорожденных, инфицированных вирусом иммунодефицита человека.

У всех восьми животных, получавших комбинацию, после прекращения лечения не наблюдалось рецидива вируса в течение года наблюдения. Примечательно, что у животных из группы тройной терапии не обнаруживалось Gag-специфичных CD8+ Т-клеток, которые отражают клеточный иммунный ответ на вирус, что подтверждает отсутствие даже латентной инфекции. Анализ интактной провирусной ДНК также не выявил ни дефектных, ни интактных провирусов в CD4+ Т-клетках из лимфоидных тканей. Авторы исследования считают «замечательным открытием» тот факт, что комбинация препаратов, каждый из которых по отдельности не работает, в совокупности полностью очищает организм от вируса. По их мнению, этот подход может стать эффективной стратегией профилактики и лечения ВИЧ-инфекции у новорожденных от матерей с положительным статусом.

Все три компонента терапии уже проходят клинические испытания на людях и имеют высокий профиль безопасности. Однако ученые отмечают, что перед переходом к клиническим исследованиям необходимо понять, будет ли этот метод работать у взрослых и каков временной интервал, в течение которого вмешательство остается эффективным.

Работа орегонских учёных вносит два ключевых новшества. Во-первых, они добавили к стандартной комбинации bNAbs и АРТ третий компонент — блокатор корецептора CCR5 (леронлимаб), который не только блокирует вход вируса в клетки, но и, вероятно, изменяет миграцию CD4+ Т-клеток в ткани-резервуары (прежде всего в желудочно-кишечный тракт). Во-вторых, они сместили фокус с попыток очистить уже существующий резервуар (как в обзоре) на его предотвращение, начав лечение в гиперострую фазу (через 72 часа после заражения), когда резервуар ещё не сформировался. Благодаря этому им удалось достичь не просто подавления виремии, а полной элиминации вируса.
Nature Combination therapy with broadly neutralizing antibodies, antiretroviral therapy and CCR5 blockade limits viral reservoir seeding… Nature Microbiology - A combined therapy using broadly neutralizing antibodies that target the HIV envelope protein, the CCR5-blocking antibody leronlimab and antiretroviral therapy limits seeding...
  • 👍 2
Post #1781 228
Заметки лабораторного кота Почему, когда я работаю в лаборатории, каждый, кто заходит, считает своим долгом пошутить про Пабло Эскобара...
Вынесено из комментариев:

Химия зародилась в средние века из алхимии, которая позднее разделилась на загнивающую химию и благородную науку самогоноварения.
  • ❤‍🔥 8
Post #1779 229
Around Science (реинкарнация «Гранита науки» на «Эхе Москвы» Искусственный интеллект использовали для создания совершенно новых вирусов Новые вирусы, созданные в Стэнфордском университете (Stanford University) группой под руководством доцента кафедры химической инженерии Брайана Хая (Brian Hie), полностью функциональны…
Сдаётся мне, что масштаб этого прорыва немножечко преувеличен громкими заголовками. По сути, авторы не создали новую жизнь, а ускорили эволюционный поиск в узком пространстве, жёстко заданном природой. Модель не смогла сгенерировать архитектуру вируса самостоятельно, поэтому исследователям пришлось вручную зафиксировать структуру капсида и ввести строгие правила, например, требование обязательного наличия спайк-белка с гомологией не менее 60% к природному. В итоге из почти трёхсот сгенерированных вариантов только шестнадцать оказались работоспособными, что говорит о том, что большая часть нейросетевогр творчества была шумом. Кроме того, в статье даже нет сравнения с другими аналогичными методами, поэтому непонятно, даёт ли примерение нейросетей реальное преимущество или просто увеличивает информационный шум. При этом в пресс-релизах старательно замалчивают роль человеческого фактора в полученных ркзультатах.
  • ❤ 4
  • 👍 3
  • 😁 1
Post #1778 214
Around Science (реинкарнация «Гранита науки» на «Эхе Москвы» Искусственный интеллект использовали для создания совершенно новых вирусов Новые вирусы, созданные в Стэнфордском университете (Stanford University) группой под руководством доцента кафедры химической инженерии Брайана Хая (Brian Hie), полностью функциональны…
Вынесено из комментариев:

16 сработали. По этим искусственным инструкциям появились настоящие бактериофаги, которых раньше в природе не существовало.

А теперь те самые 269.

Именно столько из 285 тщательно отобранных проектов не заработали вообще.

Получается довольно любопытная картина: ИИ уже умеет писать генетический код, который иногда превращается в живой вирус. Но пока примерно в 94% таких попыток природа смотрит на его код и отвечает: «Нет».
  • 👍 2
Post #1777 189

Forwarded from АНЧА БАРАНОВА

Высыпаться надо, это полезно. Во время сна мозг очищает себя от конечных продуктов метаболизма, накапливающихся в течение дня.

Когда ткани мозга начинают страдать, например, от того, что в них накапливаются вредные фосфорилированные формы белка ТАУ, он автоматически усиливает процессы очистки, настаивая на более длительной продолжительности сна.

Исследователи опросили более 2400 пожилых людей, а потом померили у них различные молекулярные маркеры функции мозга — фосфорилированный тау-белок (p-tau)181 в плазме, общий тау-белок, легкую цепь нейрофиламентов и глиальный фибриллярный кислый белок GFAP.

Оказалось, что более длительный сон связан с более высоким уровнем p-tau181 в крови — белка, связанного с болезнью Альцгеймера. Уровни были самыми низкими у людей, которые спали примерно 7–8 часов в сутки, начинали расти примерно с 8,5 часов и наиболее резко увеличивались с увеличением продолжительности сна за пределы отметки 10 часов.

Наблюденная закономерность сохранилась и после того, как исследователи учли возраст, пол, генетику ApoE, наличие или отсутствие апноэ во сне, диагноз депрессии и сохранность функции почек.

Дорогие читатели, обратите внимание, что ничто из описанного выше не означает, что длительный сон является причиной болезни Альцгеймера. Наоборот, не является.

Увеличение продолжительности сна является компенсаторным изменением. Организм приспосабливается к тому, что глимфатическая система перестала справляться с задачей за 8 часов и требует 10-часового рабочего дня. А точнее, рабочей ночи.

Выспавшись, пожилые люди соображают намного лучше. Однако их длинный сон служит сигналом того, что ранние изменения в мозге уже происходят.
https://alz-journals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/alz.71499

#сон #Альцгеймер
  • 🔥 2
Post #1776 200

Forwarded from АНЧА БАРАНОВА

Опубликованы результаты клинического исследования фазы I антитела IBC-Ab002, направленного на терапию болезни Альцгеймера.

Это вам не вантуз 🪠 для амилоидных бляшек. Это - ингибитор PD-L1, почти как противораковая «кейтруда», но не совсем.

Антитело специально сделано короткоживущим путем модификации Fc фрагментов. Оно должно (без аутоиммунных побочек!) стимулировать работу микроглии мозга, и поэтому «завалы» бляшек сами расчистятся

В группе с самой высокой дозой (30 мг/кг) снизились биомаркеры нейронального и синаптического повреждения, включая нейрогранин, общий тау и pTau181.

https://www.nature.com/articles/s41591-026-04547-8
Nature Immunotherapy with a short-lived anti-PD-L1 antibody in Alzheimer’s disease: a phase 1b, randomized, double-blind trial Nature Medicine - A phase 1b trial shows that IBC-Ab002, a short-lived antibody that intermittently activates the peripheral immune system, is safe and well tolerated with trends in biomarkers in...
  • 👍 4
Post #1775 200

Forwarded from УХВАТ

Эрик Шмидт и Сухас Махеш предлагают научным ИИ выбирать следующий опыт, а не ждать данных уровня AlphaFold

10 августа Эрик Шмидт и Сухас Махеш опубликовали статью об исследовательских агентах. Авторы предлагают использовать их там, где нужно соединить разрозненные данные, выдвинуть гипотезу и проверить её следующим опытом.

AlphaFold предсказывает трёхмерную структуру белка по последовательности аминокислот. Модель обучали на Protein Data Bank — большом архиве экспериментально подтверждённых структур. Шмидт и Махеш приводят AlphaFold как пример задачи с большим числом сопоставимых измерений и одним чётко очерченным вопросом.

В обычной экспериментальной работе биологи и химики соединяют расчёты, известные структуры и несколько новых тестов. Выращиваемые в лаборатории клетки меняют свойства, в химических реагентах бывают примеси, а условия опыта различаются между лабораториями. Новый опыт помогает отличить одно объяснение наблюдения от другого и выбрать следующий шаг исследования.

«Умение заниматься наукой состоит в том, чтобы соединять результаты разных инструментов и пересматривать выводы по мере появления свидетельств», — пишут Шмидт и Махеш.


В качестве существующего примера авторы называют Co-Scientist — многоагентную систему ИИ на базе Gemini. В её кейсе с клеточным старением система предложила для проверки генетические факторы, часть которых лаборатория подтвердила в экспериментах. Учёный задаёт ей исследовательскую цель и предоставляет прежние научные данные. Одни агенты формируют варианты гипотез, другие критикуют и уточняют их; получившиеся предложения проверяют в лаборатории. Разработчики Co-Scientist проверяли систему на трёх биомедицинских задачах: искали новое применение уже известным лекарствам, мишени — молекулы или клеточные процессы для воздействия лекарством — и объяснение механизмов устойчивости к антибиотикам.

По мысли Шмидта и Махеша, агент должен участвовать в этой последовательности: выбирать следующую проверку и записывать, на каких данных и рассуждениях она основана. Лаборатория сможет увидеть путь к гипотезе, проверить его опытом и изменить следующий шаг после результата.
Telegraph Эрик Шмидт и Сухас Махеш предлагают научным ИИ выбирать следующий опыт, а не ждать данных уровня AlphaFold Эрик Шмидт и Сухас Махеш предлагают перестать мерить весь искусственный интеллект для науки по образцу AlphaFold. В авторской статье для MIT Technology Review они описывают другую машину: исследователь ставит цель, агент собирает разрозненные данные, формирует…
  • 👍 2
  • 👎 1
Post #1773 214
Solid State Humanity Ген худобы или природный Оземпик! Существует редкая мутация которая делает с организмом почти то же самое, что делает Оземпик и другие препараты класса GLP‑1, но естественным путём, без лекарств! Мутация в гене FNIP1 меняет то, как клетки расходуют энергию…
Вынесено из комментариев:

Всего лишь-то надо, чтобы siRNA были тропны только к гепатоцитам и вырубали производство строго 50% белка, ведь если случайно вырубят 100%, то будет тяжелая патология сердца, легких, а также тотально нарушится иммунитет 🌚 пусть есть уже как минимум 5 исследований на эту тему (про гепацито-специфичность).
  • 👍 3
Post #1770 288

Forwarded from Around Science (реинкарнация «Гранита науки» на «Эхе Москвы»

Искусственный интеллект использовали для создания совершенно новых вирусов

Новые вирусы, созданные в Стэнфордском университете (Stanford University) группой под руководством доцента кафедры химической инженерии Брайана Хая (Brian Hie), полностью функциональны и способны к репликации в лабораторных условиях. Это первый случай, когда ИИ успешно спроектировал целые геномы. Полученные 16 новых вирусов были созданы для поражения бактерий и не представляют угрозы для людей. Статья о них опубликована в Science. Инструменты на базе ИИ стремительно развиваются, их уже применяли для разработки новых антибиотиков. Но это относительно простая задача по сравнению с созданием нового жизнеспособного вируса «с нуля». Технология работает по принципу больших языковых моделей (таких как ChatGPT), которые предсказывают последовательности слов в тексте. В данном случае модели ИИ, получившие названия Evo1 и Evo2, предсказывают не слова, а «язык жизни». Модели обучались на генетических последовательностях вирусов, бактерий, растений и человека. Затем их работу скорректировали так, чтобы они создавали вирусы определенного типа - бактериофаги, поражающие только конкретные виды бактерий. Исследователи из Стэнфорда отобрали 302 наиболее перспективных варианта, предложенных ИИ, и синтезировали их в лаборатории. 16 из них оказались эффективными в уничтожении кишечной палочки (Escherichia coli). Это выяснилось, когда синтетические фаги добавили на слой бактерий, выращиваемый в чашке Петри: на следующий день после добавления ученые начали замечать на бактериальном слое прозрачные пятна. Когда результаты этого эксперимента увидела вся лаборатория, «в комнате стихийно раздались аплодисменты», вспоминает Хай.

Разработка новых фагов может привести к появлению новых методов лечения инфекций, устойчивых к антибиотикам. Однако этот прорыв также указывает на способность ИИ проектировать новые биологические системы, выходящие за рамки естественного мира, то, что называют синтетической биологией. В то же время уже высказываются опасения, что та же технология может быть использована со злым умыслом для создания новых болезней. В комментарии к статье Science, Томас Инглсби (Thomas Inglesby) и Мориц Ханке (Moritz Hanke) из Центра безопасности здравоохранения Университета Джонса Хопкинса (Center for Health Security at Johns Hopkins University) отметили, что полученные результаты поднимают «насущные вопросы биологической безопасности и защиты». По их словам, вопрос теперь заключается не в том, «появится ли генеративный дизайн вирусных геномов», а в том, можно ли использовать эту технологию, не «нанося при этом серьезного вреда».
https://www.theguardian.com/science/2026/aug/06/safety-fears-as-scientists-make-first-viruses-designed-by-ai
the Guardian Safety fears as scientists make first viruses designed by AI Researchers say breakthrough offers hope for new medicines but also raises urgent biosecurity questions
  • 👍 2
Post #1768 224

Forwarded from Solid State Humanity

Ген худобы или природный Оземпик!

Существует редкая мутация которая делает с организмом почти то же самое, что делает Оземпик и другие препараты класса GLP‑1, но естественным путём, без лекарств!

Мутация в гене FNIP1 меняет то, как клетки расходуют энергию, ускоряет метаболизм и снижает риск целого набора болезней. Этот ген работает в паре с белком фолликуллином и выполняет древнюю эволюционную задачу - замедлять расход энергии, чтобы организм запасал жир "на чёрный день". Это было полезно десятки тысяч лет, когда еда была редкостью. Но сегодня, в мире избытка калорий, такая система играет против нас. Если один из двух экземпляров FNIP1 сломан, организм начинает работать наоборот: жир не копится, а сжигается, клетки расходуют энергию быстрее, а метаболизм становится "экономичным" в правильном смысле.

По данным исследования, среди более чем миллиона людей мутация встретилась примерно у 150 человек - то есть примерно 1 из 7000. У носителей сломанного FNIP1 наблюдалось:

• меньше жира в печени
• ниже уровень липидов в крови
• ниже уровень сахара
• больше мышечной массы
• примерно на 60% ниже риск ожирения, диабета и кардиометаболических заболеваний


Эволюционно мутация редкая, потому что раньше она была вредной: люди с ускоренным метаболизмом хуже переживали периоды голода. Но сегодня она стала полезной.

Если один ген может радикально изменить метаболизм, то это намекает на будущее генетической медицины. Если отключение FNIP1 в печени делает организм устойчивым к ожирению и диабету, то можно представить терапию, которая временно подавляет FNIP1 только в печени или редактирует его активность у людей с высоким риском метаболических заболеваний. Генетическое вмешательство может быть более стабильным, точным и менее зависимым от постоянного приёма лекарств
  • 🔥 11
Post #1767 237

Forwarded from УХВАТ

Дафна Коллер опубликовала эссе о поиске причин болезней с помощью ИИ до проектирования лекарств

3 августа основательница и генеральный директор insitro Дафна Коллер опубликовала эссе о том, где ИИ уже ускоряет разработку лекарств. Она отделяет поиск причины болезни от создания лекарства и его проверки на пациентах.

В эссе Коллер описывает три шага. Сначала исследователи связывают болезнь с механизмом: ищут ген, белок, клеточный процесс или связь тканей, изменение которых меняет ход болезни у человека. Затем химики и вычислительные модели создают средство против этой мишени — малую молекулу, антитело, РНК-препарат или генную терапию. Наконец, клиническая команда набирает пациентов и измеряет пользу лечения и побочные эффекты.

По оценке Коллер, ИИ особенно быстро работает там, где известны мишень и измеримый результат. Модель предлагает структуру молекулы, лаборатория проверяет, связывается ли она с белком, и следующий цикл меняет структуру. Автоматизированная лаборатория так же может улучшать синтез белка или антитело к известной мишени: каждый шаг быстро даёт результат.

Поиск механизма болезни требует другой работы. В организме клетки меняют состояние, ткани влияют друг на друга, а эффект лечения зависит от времени и конкретного пациента. Коллер называет клиническое исследование окончательной проверкой того, меняет ли препарат болезнь у человека. Такая проверка занимает годы и стоит миллионы долларов.

Отчёт BIO, Informa Pharma Intelligence и QLS Advisors подсчитал 12 728 переходов клинических программ за 2011–2020 годы: от первой фазы до одобрения FDA дошли 7,9 процента. На второй фазе, где проверяют клинический эффект, программы переходили дальше в 28,9 процента случаев. Коллер ставит выбор биологического механизма в начало этой цепочки.

Коллер также пишет, что у 38 мишеней уже больше 50 программ на каждую, а число новых мишеней, которые индустрия продвигает за год, сократилось примерно со ста в 2015-м до тридцати в 2024-м. Она связывает эту концентрацию с тем, что компании возвращаются к участкам биологии, где уже умеют ставить опыт и отбирать пациентов.

Поэтому Коллер предлагает направить ИИ на карту причин болезни. Для неё нужны измерения в человеческих клетках и тканях, эксперименты, которые меняют эти клетки и ткани, и данные, связывающие изменения с состоянием пациента. По модели Коллер, такая карта помогает выбрать мишень, подобрать людей для испытания и раньше увидеть, меняет ли лечение биологию болезни.

Для возрастных болезней этот вопрос начинается до дизайна молекулы. Они затрагивают множество типов клеток и органов; исследователю сначала нужно понять, какой процесс в человеческом организме должно изменить лечение.
Telegraph Дафна Коллер опубликовала эссе о поиске причин болезней с помощью ИИ до проектирования лекарств В разработке лекарств появился простой сюжет: модель увидит белок, придумает молекулу, робот проверит её, и лечение появится быстрее. В эссе для a16z основательница insitro Дафна Коллер показывает разрыв в этой цепочке. Молекула может точно связываться с…
  • 👍 1
Post #1766 194

Forwarded from Без рецепта

Российский биосимиляр тоцилизумаба получил признание в PubMed
 
🟢Не можем не отметить важное достижение российской фармы — результаты исследований препарата для лечения ревматоидного артрита от «Генериума» удостоились публикации в Национальной медицинской библиотеке США (NLM).
 
Биосимиляры тоцилизумаба были созданы как более доступная альтернатива дорогим оригинальным препаратам, однако ожидаемо вставал вопрос об их эффективности и безопасности. Чтобы получить ответ, учёные проанализировали данные четырёх крупных КИ III фазы с участием 2,1 тыс. взрослых пациентов с ревматоидным артритом. Во всех биосимиляр сравнивали с оригиналом по эффективности и безопасности.
 
▶️И вот что получилось:
 
🔘по главным показателям эффективности (уменьшение симптомов и воспаления) биосимиляры и оригинал показали практически одинаковые результаты на 12-й, 24-й неделях и примерно через год лечения;

🔘по шкале активности болезни DAS28-СОЭ биосимиляры даже показали чуть лучший результат через год, но разница клинически незначима;

🔘профиль безопасности совпадает: побочные эффекты сопоставимы.

Таким образом, биосимиляры тоцилизумаба — полноценная альтернатива оригиналу, только значительно более доступная для пациентов и системы здравоохранения.

🩺 Без рецепта в Telegram | в MAX
  • 🔥 2
  • ❤ 1
Post #1763 290

Forwarded from biolaw | yustina guseynova

Священный синод Русской православной церкви принял значимый для российской биоэтики документ — «Отношение Церкви к генотерапии и генетической диагностике»

Ключевые тезисы:

Отношение к пренатальной генетической диагностике. Пренатальную генетическую диагностику Церковь считает нравственно оправданной, если она помогает начать лечение как можно раньше, еще на стадии внутриутробного развития, или подготовить родителей к тому, чтобы осознанно взять на себя ответственность и заботу о ребенке, имеющем определенное заболевание. В документе подчеркивается, что обнаруженное заболевание не лишает ребенка права на жизнь, любовь и заботу. Использовать пренатальную диагностику для выбора желаемого пола будущего ребенка Церковь считает недопустимым.

Отношение к генной терапии. Церковь допускает вмешательство в соматические клетки, однако негативно относится к вмешательству в половые клетки, поскольку такие изменения способны передаваться следующим поколениям, а последствия вмешательства еще неизвестны. Ограничение предлагается сохранять до получения убедительных результатов экспериментов на животных, их компетентного обсуждения и достижения общественного согласия. К генотерапии соматических клеток, изменения которых не передаются потомкам, Церковь относится положительно, при условии получения корректного информированного добровольного согласия пациента.

Отношение к исследованиям в сфере генной терапии. Церковь поддерживает исследования и технологии, необходимые для усовершенствования генотерапевтических процедур при условии, что они не подразумевают экспериментирования на живых эмбрионах человека:
«Развитие медико-генетических методов диагностики и лечения может способствовать предотвращению ... болезней и облегчению страданий многих людей.


Церковь подчеркивает, что любое дальнейшее обсуждение вопросов генетической диагностики и терапии касается жизни человека во всей его полноте, целостности и хрупкости. И на обсуждающих лежат особые нравственные обязательства ответственности перед настоящим и будущими поколениями.
  • ❤ 9
  • 😁 2
Post #1762 251

Forwarded from EvgBiotch 🧬

Очередной случай летального исхода при генной терапии

В Китае 6-летней девочке с редким генетическим нарушением развития мозга ввели в спинномозговую жидкость вирусные векторы, несущие инструкцию для редактирования генома и исправления мутации. Персонализированная генная терапия направлена на коррекцию дефектного гена в клетках головного мозга. После лечения у ребенка развились лихорадка и признаки поражения почек. Девочка умерла примерно через неделю. Наиболее вероятной причиной считают иммунную реакцию на сам вектор (вирус).

Случай особенно привлекает внимание на фоне китайского кризиса биоэтики после 2018 года, когда история с редактированием человеческих эмбрионов привела к ужесточению правил, но не сняла вопросы о качестве надзора и прозрачности вокруг экспериментальных вмешательств.

Не менее важна и финансовая сторона: родители сами собрали более $800 тыс. на разработку и применение терапии, а отношения с исследовательской группой, по сообщениям, строились на неформальных договоренностях.

Более того, уже после смерти ребенка команда опубликовала в Nature работу с данными на животных моделях, демонстрируя эффективность подхода, но из финальной версии убрали сведения о семье и о том, что родители финансировали проект.

На этом фоне США все жестче смотрят на данные, связанные с исследованиями в Китае, особенно если речь идет о клинических и генетических вмешательствах, где ставятся под вопрос прозрачность и информированние участников.

Оправданы ли такие риски при отсутствии возможных альтернатив лечения заболевания?
Older posts →
Threads Profile ViewerView any public Threads profile without an account.Open ThreadLook →Writing with AI? Make it sound human.Metric37 rewrites AI drafts so they read naturally. Free AI detector, 1,500 words free.Try Metric37 →