Приятно в качестве первоапрельской новости видеть не только
Идею этой работы мы с коллегами вынашивали аж несколько лет - и вот довели-таки до публикации. Если коротко:
🔹 Интуитивный взгляд на эволюцию: коли уж она возилась с генами и белками миллиарды лет, то почти всё полезное (на молекулярном уровне) перепробовала. Наш анализ говорит обратное: Жизнь исследовала лишь крошечный "уголок" огромного пространства возможных белков. И главный тормоз тут не столько отбор, сколько "родословная" Жизни: если всё начинается от общего предка, то эволюция долго топчется вокруг исходной точки - и мееедленно добирается до дальних (но тоже функциональных) решений.
🔹 Это значит, что Жизнь далеко не исчерпала свои молекулярные возможности. Кстати, для биотеха и AI - это подтверждение (уже принятого многими) вызова: если мы учимся только на природных белках, то наши модели видят лишь маленький фрагмент реальной картины. По-настоящему новые белки нужно искать смелым выходом в те области Sequence Space, куда эволюция (по крайней мере, известная нам) пока не заходила.
🔹А ещё мы (авторы) идём дальше и выдвигаем довольно дерзкую мысль: если даже за миллиарды лет эволюция внутри одного белкового семейства осваивает лишь крошечный участок пространства - то трудно представить, что наблюдаемое богатство белков общего предка всего живого (так называемый LUCA) успело возникнуть как простое разветвление от одной-единственной исходной последовательности. Наша гипотеза в следующем: ранняя белковая Жизнь собиралась как мозаика из независимо (!) возникших пептидов - которые комбинировались, усложнялись, и встраивались в общий организм. Жизнь на планете Земля, похоже, стартовала не с одного удачного молекулярного "текста" - а с целой библиотеки независимых "черновиков"... ну или исходное разнообразие кто-то кхм подкинул... 🤔