Viper.|H&D

Ребенок, кстати, привет передаёт. Давно её не показывала.

Ну, точнее, открываем неделю. Пока меня тут не было, в мире творилось черти что, не дающее мне сфокусироваться на деле. Сейчас, когда все утихло, надо хоть что-то записать, но из всего кое-кто, пальцем показывать не будем, приспособил колбу.

Кхм, продолжаем.

Channel name was changed to «Viper.|H&D»

Channel name was changed to «{РЕСТ до 20.09}Viper.|H&D»

Фейд, ещё раз увижу в личных сообщениях у себя "я календарь", честное слово, пойдёшь у меня на опыты.

📖Очень мне хочется съехидничать касаемо того, как вы сейчас все будете на парах сидеть, но я лежу дома с простудой. Честно, сейчас бы на парах лучше сидела.

〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️

Запись протокола №43
Дата: 30.08.👻👻👻👻

❌...Но вот что мне действительно интересно: откуда клетка вообще знает, какие именно молекулы ей нужно производить? Почему один эритроцит несёт на поверхности одну комбинацию антигенов, а другой — совершенно другую? Ответ, как всегда, спрятан не в самой клетке, а немного глубже. В ДНК. Да, мы наконец добрались до неё. Генетика в этом смысле не какая-то отдельная магическая дисциплина, существующая рядом с химией. Генетика — это химия, которая научилась хранить информацию, копировать её и достаточно точно передавать дальше. ДНК представляет собой длинную молекулу, построенную из нуклеотидов, и у каждого нуклеотида есть азотистое основание. Их всего четыре: аденин, тимин, гуанин и цитозин. Четыре варианта. И этого оказалось достаточно, чтобы записать инструкции для построения и поддержания человеческого организма. Четыре химических «символа», расположенных в определённом порядке. Смешно мало, если подумать. Вы можете взять любую достаточно длинную последовательность из этих четырёх оснований — и получите информацию, которую клетка способна прочитать. Вопрос только в том, умеет ли она распознать нужный участок и что именно сделает с полученной инструкцией.
❌ДНК не бегает по клетке и не раздаёт приказы вроде: «Эй, рибосома, собери мне белок». Сначала определённый участок ДНК считывается ферментом, который синтезирует молекулу РНК. Нуклеотиды РНК подбираются по принципу комплементарности к матричной цепи ДНК, и в результате получается последовательность, содержащая копию генетической информации. Затем эта РНК может использоваться рибосомой как инструкция для сборки белка. И только после этого мы получаем настоящую рабочую молекулу. Белок может быть ферментом, рецептором, структурным элементом или вообще выполнять десятки функций, о которых клетка даже не станет вас предупреждать. Например, в случае с системой ABO генетическая информация определяет структуру фермента, который модифицирует углеводный фрагмент на поверхности эритроцита. То есть та самая маленькая молекулярная метка, которую мы наблюдаем в лаборатории, в конечном счёте является результатом работы генов. Не напрямую. Через цепочку химических процессов. Именно поэтому фраза «ген определяет признак» технически удобна, но слишком груба.
❌Потому что один ген — это далеко не всегда одна функция. Хотите простой пример? Возьмём тот же ABO. Человек получает один вариант гена от матери и один от отца, и комбинация этих вариантов влияет на то, какой фермент будет работать в его клетках. Но даже здесь всё не сводится к двум буквам в генетическом тесте. Есть регуляторные последовательности, есть уровень экспрессии, есть другие белки, есть ферменты, которые работают выше или ниже по цепочке. Клетка — это не конвейер, где один рабочий нажимает кнопку, а другой получает готовый продукт. Это скорее огромная химическая сеть, в которой тысячи реакций происходят одновременно, конкурируют друг с другом, подавляются, усиливаются и зависят от концентрации веществ. И всё это без единого диспетчера. Прекрасная система. Абсолютно ненормальная по количеству переменных. Мне нравится.
❌Теперь представьте, что одна буква в ДНК меняется. Всего одна. Не вся последовательность, не целый ген, не какая-нибудь драматическая катастрофа — один нуклеотид. Иногда клетка даже не заметит. Иногда изменится кодон, но аминокислота останется той же самой из-за вырожденности генетического кода. Иногда замена приведёт к появлению другой аминокислоты в белке, и последствия будут зависеть от того, где именно она оказалась. А иногда одна такая замена создаёт стоп-сигнал, и белок получается укороченным. Вот вам и мутация. Не обязательно что-то эффектное. Не обязательно сразу болезнь, изменение внешности или прочая драматическая чепуха. В большинстве случаев изменение последовательности либо не имеет заметного эффекта, либо его последствия зависят от контекста. Но если эта последовательность действительно важна, маленькое изменение способно пройти через всю цепочку: ДНК изменилась → РНК изменилась → белок изменился → изменилась химическая реакция → изменилось поведение клетки. И вот уже результат можно увидеть не на уровне молекул, а на уровне организма.
❌А теперь самое неприятное: ДНК не только должна храниться. Её необходимо копировать. Причём копировать достаточно точно, чтобы клетка могла разделиться и передать дочерним клеткам практически тот же набор информации. Перед делением молекула ДНК расплетается, и каждая из двух цепей становится матрицей для построения новой комплементарной цепи. Аденин напротив тимина, гуанин напротив цитозина — никакой импровизации. Ферменты последовательно присоединяют подходящие нуклеотиды, проверяют результат, исправляют часть ошибок. Да, у системы есть механизмы контроля. И всё равно ошибки случаются. Потому что химия не обязана быть идеальной только потому, что вы очень этого хотите. Повреждения ДНК происходят постоянно: под действием химических веществ, излучения, реактивных форм кислорода и просто случайных ошибок при копировании. Клетка постоянно ремонтирует собственный геном. Представьте себе лабораторию, где оборудование каждую секунду получает микроскопические повреждения, а персонал круглосуточно пытается их найти и исправить. Вот примерно так выглядит ваша клетка. И она делает это всю вашу жизнь.
❌Даже если последовательность ДНК не изменилась, клетка может изменить то, насколько активно использует определённый ген. Один участок будет активно считываться, другой практически молчать. На это влияют регуляторные белки и химические модификации ДНК и белков, вокруг которых она упакована. Поэтому геном — это не просто текст. Это текст с системой закладок, пометок, переключателей и уровней доступа. Одна и та же ДНК находится практически во всех клетках организма, но клетка мозга не пытается работать как клетка печени, потому что использует другой набор генетических инструкций. И это, пожалуй, одна из самых важных вещей, которую стоит понять о генетике: наличие гена ещё не означает, что он прямо сейчас активен и производит свой продукт. Иногда инструкция лежит на месте. Просто никто не открыл нужную страницу.
❌Я смотрю на эритроциты и вижу антигены. Затем добавляю реагент и наблюдаю агглютинацию. За этим стоят антитела, их пространственная структура и множество слабых нековалентных взаимодействий. Но если продолжить цепочку назад, окажется, что структура антигена зависит от работы фермента. Структура фермента определяется последовательностью аминокислот. Последовательность аминокислот задаётся последовательностью нуклеотидов в РНК. РНК получается при считывании ДНК. А ДНК мы получили от родителей. Вот вам и наследственность. Не абстрактная «передача признаков», а физическая передача молекулярной информации, которая затем проходит через целую систему химических реакций и в конце концов становится чем-то, что можно увидеть, измерить и использовать в диагностике. Человеческое тело любит притворяться сложным. На самом деле оно просто очень, очень большое количество химии, происходящей одновременно.
❌Мы до сих пор не знаем всех последствий. Мы научились читать последовательности ДНК гораздо быстрее, чем научились полностью понимать их функции. Мы можем увидеть изменение в геноме и сказать: «Вот оно». А затем ещё долго выяснять, что именно оно делает, влияет ли вообще, взаимодействует ли с другими вариантами и при каких условиях проявляется. Генетика редко говорит: «Эта буква означает вот это». Гораздо чаще она отвечает: «Эта буква повышает вероятность вот такого результата при таких-то условиях». Намного менее удобно. Зато честно.
❌Система химической информации, которая постоянно считывается, копируется, регулируется, повреждается и ремонтируется. Иногда она работает почти идеально. Иногда ошибается. Иногда ошибка оказывается совершенно незначительной. Иногда становится причиной серьёзных последствий.
❌.....По-моему меня укусил Зено. Ну ладно. Дальше пойду лечиться, а то после продолжительной прогулки умудрилась простыть.

Конец записи.

Да-да, тебе торт брать?

Я, кстати, напоминаю, что кофе не вредит здоровью, если вы пьёте не более нескольких кружек в день и не добавляете туда термоядерную дозировку водки, закусывая сигаретой.

Ну так, к слову.

Мы, кстати, обе добежали одновременно.

Ну что, побежали кто быстрее до стадиона?

От кофе к кофе.

〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️

Запись протокола №42
Дата: 23.08.👻👻👻👻

❌Ладно. Если вы всё ещё думаете, что группа крови — это какая-то абстрактная цифра в медицинской карточке, придётся вас разочаровать. Это химия. Очень конкретная, очень физическая и, как обычно бывает с человеческим организмом, до смешного капризная химия. Я как раз сижу над образцом Протокола и пытаюсь определить его ABO и Rh-фенотип. Просто если уж работать с человеческим материалом, неплохо понимать, какие именно молекулы сейчас плавают перед тобой и почему одна капля реагента превращает суспензию эритроцитов в хлопья, а другая — остаётся совершенно однородной. Начнём с главного: группа крови ABO определяется не «типом крови» как таковым, а набором антигенных структур на поверхности эритроцитов. Эти антигены представляют собой в значительной степени углеводные фрагменты, встроенные в мембранные гликопротеины и гликолипиды. У всех есть базовая структура, так называемый H-антиген, а дальше фермент, кодируемый геном ABO, либо добавляет к нему N-ацетилгалактозамин — получаем антиген A, либо галактозу — получаем антиген B. Аллель O в классическом варианте кодирует нефункциональный фермент, поэтому дополнительная модификация H-антигена не происходит. И вот уже комбинация наследованных аллелей определяет фенотип: A, B, AB или O. То есть клетка буквально несёт на своей поверхности молекулярную метку, а иммунная система умеет читать эту метку.
❌Почему иммунная система вообще реагирует на чужую группу? В плазме находятся антитела, преимущественно иммуноглобулины класса IgM, способные связывать соответствующие антигены на эритроцитах. У человека с группой A есть антиген A, но при этом присутствуют анти-B антитела. У B — наоборот. У AB присутствуют оба антигена, зато естественных анти-A и анти-B антител практически нет. У O нет ни A, ни B-антигена, зато присутствуют оба типа антител. И если сейчас я добавлю к образцу диагностический реагент с анти-A антителами, а эритроциты начнут агглютинировать, это означает, что анти-A антитела связались с A-антигенами на разных клетках и создали пространственную сеть. Никакой мистики. Антитело имеет несколько участков связывания, антигенов на поверхности клетки много, поэтому клетки начинают буквально сцепляться друг с другом. То, что глаз воспринимает как характерное «склеивание», на молекулярном уровне является результатом специфических нековалентных взаимодействий — водородных связей, электростатических взаимодействий, гидрофобных эффектов и пространственной комплементарности. Сама реакция антиген–антитело не требует образования новой ковалентной связи. Здесь важна форма. Молекула распознаёт другую молекулу примерно так же, как ключ подходит к замку, только сравнение с ключом довольно грубое и биохимики от него уже немного устали....

Я очень не хочу знать, как у Сайфера получается заставить меня разговаривать больше двух часов, но расползаться в ночи по кабинетам — уже традиция.

Да чего уже скрываться, Сайф, тебя долго уговаривать не пришлось.

〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️

Запись протокола №41
Дата: 16.08.👻👻👻👻

〰️Щелчок диктофона, шум воды, тяжёлый вздох.〰️

❌Так. Нет. Вот это я сейчас действительно хочу понять. Почему я не отмыла кофейную группу сразу? Почему решила, что «потом» — это разумная стратегия? Я же прекрасно знаю, что происходит с кофейным маслом на горячем металле. Сначала это просто тонкая липкая плёнка из гидрофобных органических соединений, липидов, жирных кислот и прочей кофейной дряни. Потом, под воздействием температуры и кислорода, начинаются окислительные процессы, часть компонентов полимеризуется, и вот уже вместо нормального загрязнения мы получаем устойчивый коричневый налёт, который держится на поверхности так, будто у него здесь пожизненный контракт.

〰️Скрежет металла.〰️

❌Прекрасно, Сабина. Просто прекрасно. Можно было потратить две минуты после работы и всё это убрать. Но нет. Конечно же, надо было оставить! Теперь я стою здесь и пытаюсь удалить результат собственной лени. И ведь я даже знаю, почему водой это нормально не отмывается. Вода — полярный растворитель, а кофейное масло в значительной степени состоит из неполярных, гидрофобных соединений. Они не хотят смешиваться. Вода проходит мимо, масло остаётся на поверхности, а я потом смотрю на это и задаюсь вопросом, почему металл выглядит так, будто его достали из мусорного контейнера.

〰️Щелчок открывающейся крышки.〰️

❌Ладно, «Кофиза». Посмотрим, насколько быстро она исправит мою ошибку. Здесь всё хотя бы понятно с точки зрения химии: поверхностно-активные вещества снижают поверхностное и межфазное натяжение, улучшают смачивание загрязнённой поверхности, а затем взаимодействуют с гидрофобными компонентами кофейного налёта. Молекулы ПАВ имеют гидрофильные и гидрофобные участки, поэтому могут связывать масляную фазу и переводить её в диспергированное состояние. По сути, загрязнение перестаёт существовать как единая липкая плёнка и превращается в более мелкие частицы, которые уже можно удалить промывкой. Смачивание, адсорбция на границе фаз, эмульгирование, диспергирование — обычная химия. Очень полезная химия, особенно когда ты, как идиот, решил не мыть оборудование вовремя.

Конец связи.

Какой бы мразью я ни была, но как только всякий неизвестный зовёт на кофе — злость подождёт.

Запись №000-000038
Протокол HND_Q090x312

💉 Уровень доступа: D

Рекомендация, которую нужно воспринять в качестве добровольно-принудительного приказа: научитесь ждать. Когда вы обращаетесь к собеседнику в переписке, вы автоматически лишаете себя права требовать от него ответа в удобное для вас время.
Вы — не эпицентр его жизни. А если будете проявлять настырность, когда дело терпит отлагательства и не входит в категорию экстренных (см. техногенные катастрофы и стихийные действия, угроза жизни и здоровью, а также моё сообщение), никогда им не станете.

Утверждено к публикации.
🔤.🔤

📖Сейдж очень хорошую мысль сказала: «Если долго сидеть на берегу реки, то можно увидеть, как мимо проплывёт труп твоего врага».

Тебя я дождусь.
Как раз я не всё изучила с последней нашей встречи.

💖Взрослеть — это понимать, что ошибаться нормально, если ты готов делать выводы.