Помимо Ногайской, были ещё Казанская (с выделившейся из неё Осинской) и Сибирская дороги, охватывавшие племена, прежде находившиеся в подданстве у казанских и сибирских ханов соответственно. Видимо именно в пределах Казанской дороги, на Бугульмино-Белебеевской возвышенности, и находилась исходная страна башкир, Magna Hungaria XIII в.

Сибирская дорога ещё в 1662-64 гг. была центром последней попытки реставрации Сибирского ханства Кучумовичей, в ходе которой башкиры и сибирские татары сумели сжечь Кунгур и несколько основанных незадолго до того слобод по Исети (но Долматов монастырь в нынешней Курганской области устоял). Казанская и Ногайская дороги подключились, и пожалуй это первый пример совместного политического действия всех башкирских юртов. В итоге правительство договорилось с башкирами о примирении и восстановлении (и, видимо, расширении на зауральские племена) старых договорённостей.

В советской историографии эти события обозначены как башкирское восстание. Но эта дефиниция сомнительна, больше похоже на завершение 80-летней военно-политической борьбы за переферию Сибирского ханства. В любом случае, видно длительное сохранение тесных связей в рамках прежних ханств даже после разрушения постордынского пространства Иваном Грозным в третьей четверти XVI в.

Тут более понятно становится и основание Уфы одновременно с Тюменью и Самарой в 1586 г. Это была буквально пограничная крепость, скорее даже анклав между слабо контролируемыми союзниками (Казанская дорога), ещё менее подвластными союзниками союзника (Ногайская дорога) и совершенно неподконтрольными союзниками врага, хана Кучума (Сибирская дорога).