🔷Сотрудники Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова выявили и охарактеризовали новый патогенный вариант гена PARN при врожденном дискератозе, который приводит к разрушению точки ветвления (branch point site). Статья ученых была опубликована в научном журнале «Clinical Genetics».
🔷Врожденный дискератоз – это редкое генетическое заболевание. Сегодня в качестве причин болезни идентифицированы патогенные варианты в 18 различных генах. Одним из генов, регулирующих стабильность теломеразы, является PARN.
🔷В своем исследовании ученые МГНЦ описали историю болезни пациента с дискератозом 6 типа.
«Постановка диагноза для врача-генетика не всегда происходит одномоментно. Это связано с тем, что клинические симптомы пациента проявляются с течением времени. Так было в нашем случае у ребенка с дискератозом 6 типа. Основная проблема связана с нарушением функции костного мозга. Симптом, который позволил нам приблизиться к диагнозу, появился у ребенка с рождения. Среди первых симптомов были отмечены микроцефалия, задержка развития»
, – рассказала врач-генетик, ведущий научный сотрудник Научно-консультативного отдела МГНЦ, к.м.н., доцент кафедры медицинской генетики ИВиДПО МГНЦ Наталия Семенова.
🔷Первоначальный анализ трех исследований методом полногеномного секвенирования (WGS) не смог выявить патогенные варианты, объясняющие клиническую картину у пациента. На основании дополнительных клинических данных, специалисты МГНЦ провели повторный анализ данных WGS, что позволило выявить два варианта в гене PARN: один патогенный вариант c.1045C > T и один вариант с неопределенным клиническим значением c.178-28T > C.
«С помощью биоинформатического анализа и анализа РНК мы продемонстрировали, что вариант c.178-28T > C приводит к пропуску экзона 4 в гене PARN из-за разрушения сайта точки ветвления и запускает NMD-опосредованную деградацию полученных транскриптов. Эти результаты позволили реклассифицировать вариант c.178-28T > C как патогенный. Таким образом, у пациента было обнаружено два патогенных варианта PARN, что позволило поставить окончательный молекулярный диагноз»,
– пояснила научный сотрудник лаборатории некодирующих вариантов генома МГНЦ Дарья Акимова.
🔷Результаты научных исследований специалистов МГНЦ демонстрируют критическую роль повторного анализа WGS в сочетании с функциональными исследованиями в разрешении атипичных проявлений, особенно, для генов с плохо определенными корреляциями генотип и фенотип.
Авторы: Дарья Акимова, Наталья Семенова, Татьяна Череватова, Михаил Скоблов