Заметки лабораторного кота

НОВОСТИ МЕНЯЮЩЕГОСЯ МИРА

Журнал The Innovation (в котором я являюсь исполнительным редактором по химии) по только что вышедшим цифрам оказался на втором месте по CiteScore среди всех междисциплинарных научных журналов мира - обогнав Science и прочих монстров.
Выше остаётся только Nature. Но это не надолго.

Историю создания этого журнала будут преподавать. Ведь создан он был группой молодых сотрудников различных институтов Китайской Академии Наук - на свои собственные сбережения. И за 4 года этот журнал вошёл в историю.
https://www.scopus.com/sourceid/21101038708#tabs=1

Генные ножницы — что новенького?

На Биомолекуле вышел лонгрид об истории и современном состоянии генного редактирования под моей редактурой (no pun intended). Там не только про всем известный CRISPR/Cas9, но и про более современные технологии: base editing, RNA editing, которые уже показали первые результаты в клинике, а также про многообещающие prime editing и bridge editing, которым это только предстоит.

Генное редактирование может оказаться настолько безопасным, что уже в ближайшие лет 20, возможно, будет применяться достаточно широко, а не только для лечения редких заболеваний.

Интересно, что у истоков этих технологий стоят, в том числе, крупные ученые российского происхождения, работающие в США, — Евгений Кунин и Федор Урнов.

Наслаждайтесь!

Исследователи Российского центра неврологии и нейронаук впервые в России внедрили новую технологию ранней диагностики нейродегенеративных заболеваний.

Метод основан на затравочной амплификации патологических белков (альфа-синуклеина, TDP-43) в цереброспинальной жидкости, которые запускают гибель нейронов при болезни Паркинсона, боковом амиотрофическом склерозе и других болезнях.

Технология позволяет выявлять заболевания на доклинической стадии и станет основой для новых методов лечения, направленных на разрушение белковых агрегатов в мозге. Её появление совпало с разработкой первых препаратов, требующих точной молекулярной диагностики для эффективного применения.

Президент США Дональд Трамп 23 мая подписал указ, озаглавленный «Восстановление золотого стандарта науки». Вот полный текст этого указа с сайта Белого дома:

https://www.whitehouse.gov/presidential-actions/2025/05/restoring-gold-standard-science/

Что же понимается под золотым стандартом науки? Смысл этого термина раскрывается в третьем разделе указа: «Золотой стандарт науки» означает науку, проводимую таким образом, который:
(i) воспроизводим;
(ii) прозрачен;
(iii) учитывает ошибки и неопределенности;
(iv) уделяет внимание коллаборативным и междисциплинарным аспектам;
(v) подвергает сомнению свои выводы и предположения;
(vi) учитывает возможность опровержения гипотез;
(vii) подлежит беспристрастной экспертной оценке;
(viii) принимает отрицательные результаты как ценность;
(ix) не имеет конфликта интересов.

Казалось бы, кто может возражать против этих принципов? А между тем после публикации указа в научном сообществе США поднялась волна критики, острие которой направлено не против самих составляющих «золотого стандарта», а против предлагаемых мер, по его внедрению. В частности, Управление по научно-технической политике Белого дома, возглавляемое научным советником президента США Майклом Крациосом, должно в 30-дневный срок подготовить руководство по внедрению «золотого стандарта науки» во всех научных учреждениях, подведомственных правительству США. И затем все эти учреждения еще через 30 дней отчитаться о практическом внедрении этих принципов.

Ученые опасаются, что если раньше были принципы DEI (разнообразие, равенство, инклюзивность), то теперь на смену им придут принципы «золотого стандарта науки», которые будет внедряться с той же степенью некомпетентности и административного рвения.

Особенно если учесть, что указ Трампа начинается с таких слов: «За последние 5 лет уверенность в том, что ученые действуют в интересах общества, значительно упала. Большинство исследователей в области науки и технологий считают, что наука сталкивается с кризисом воспроизводимости. Фальсификация данных ведущими исследователями привела к громким отзывам финансируемых из федерального бюджета исследований. К сожалению, федеральное правительство способствовало этой потере доверия.»

То есть постулируется, что все было плохо. С учетом этого, вряд ли руководители научных институтов будут рапортовать наверх, что с «золотым стандартом» у них все хорошо. Ниже приводятся ссылки на статьи из Science и Nature, в которых описывается реакция научного сообщества США на указ Трампа о «золотом стандарте»:

https://www.science.org/content/article/what-does-trump-s-call-gold-standard-science-really-mean

https://www.nature.com/articles/d41586-025-01668-x

Если честно, проблему использования студентами ИИ я считаю в целом надуманной. Во-первых, её можно преодолеть введением большего количества устных докладов, коллоквиумов, введением оценок за участие в семинарах и устными экзаменами. Во-вторых, цель университета не столько вложить n-ное количество знаний (ну, за тем редким исключением, когда речь идёт о профессиях, где на кону человеческие жизни), а научить человека думать. И с этой позиции не так важно, сумел ли человек реально выучить весь объём курса к экзамену, сумел ли он талантливо списать или он сумел талантливо использовать ИИ. Результат будет один – человек научился включать мозг.

На самом деле использование ИИ требует определённого ума. Во-первых, человек должен уметь грамотно и предельно точно формулировать свои вопросы и задачи, чтобы получить максимально точный ответ, уметь проверять, как соотносится то, что написано ИИ с реальностью, уметь перефразировать написанный им текст. Чтобы ИИ анализировал научные статьи, надо уметь эти статьи находить и т.д.. Т.е. грамотное применение этой технологии требует определённого опыта и навыков.

Страх некоторых преподавателей перед ИИ – это страх савецкой Марьивановны. "Мы не знаем, что делать со студентами, которые используют ИИ, поэтому просто запретим его" (с).

Исследователи из Института промышленных наук Токийского университета создали трёхмерную in vitro-модель с искусственным кровеносным сосудом и органоидами кишечной опухоли, чтобы проследить, как кластеры циркулирующих опухолевых клеток (ЦОК) отделяются от первичной опухоли, проникают в стенки сосудов и попадают в кровоток, способствуя образованию дистальных метастазов.

Учёные расположили опухолевые органоиды рядом с сосудом и с помощью визуализации в реальном времени засняли миграцию скоплений к стенке сосуда, его локальное разрушение и последующее рассредоточение клеток внутри сосуда.

Оказалось, что взаимодействие кластеров с эндотелием усиливает экспрессию TGF-β и активина, вызывая эндотелиально-мезенхимальный переход и частичный «разбор» стенки сосуда. Эти данные показывают, что ЦОК не просто проходят через барьер, а активно модифицируют эндотелий для облегчения инвазии.

Профилактика такого механизма проникновения может стать новым направлением для предотвращения метастазирования, а предложенная 3D-система позволит тестировать препараты, нацеленные специально на блокировку инфильтрации сосудистой стенки.

Исследователи из Института биоинженерии Каталонии (IBEC), Университета Барселоны и Автономного университета Барселоны (UAB) обнаружили, что человеческие гистоны H1 — белки, участвующие в упаковке ДНК, — обладают выраженной антимикробной активностью.

В ходе исследования учёные выявили способность трёх подтипов гистонов разрушать бактериальные мембраны, особенно у Pseudomonas aeruginosa — патогена, устойчивого к большинству антибиотиков и вызывающего тяжёлые хронические инфекции.

Гистоны снижали количество бактерий до 70%, а бактериальную массу в биоплёнках — до 30%. Биоплёнки особенно трудно поддаются лечению, так как защищены внеклеточной матрицей.

При сочетании гистонов с антибиотиком ципрофлоксацином антимикробный эффект значительно усиливался. В экспериментах in vivo на личинках Galleria mellonella лечение гистонами улучшало выживаемость без токсических последствий.

Открытие может стать основой создания нового семейства антибиотиков, способных справляться с устойчивыми инфекциями, против которых традиционные препараты бессильны.

💬 На конференции Сколтеха «Фронтиры прогресса» работала медиастудия, гостями которой стали эксперты из Ростеха, Сибура, Сбербанка, Росатома, «Полярного лития», МФТИ, других компаний и организаций.

Серию интервью открывает разговор с Александром Кашириным — заместителем председателя научно-технического совета Ростеха.

В беседе топ-менеджер поделился рядом интересных деталей о подходах госкорпорации к развитию технологий и кадров:

▪️ Ростех целенаправленно готовит специалистов для своих предприятий: студенты проходят шестилетнюю программу специалитета с регулярной практикой на производстве.
▪️ Корпорация развивает взаимодействие между вузами и индустрией, опираясь на уникальные технологические компетенции университетов и актуальные запросы на внешние инновации.
▪️ По мнению Ростеха, разработки вузов становятся действительно интересны индустрии, когда достигают не ниже шестого уровня технологической готовности (TRL-6).

Все подробности — в видео.

Представь: ты родился в XIX веке и поступил в классическую русскую гимназию. Это значит:

– в ближайшие 7 лет ты будешь изучать всего десяток дисциплин, главные из которых – математика, латынь и древнегреческий;
– у тебя будет до 5 уроков в день длительностью до 90 минут каждый;
– на уроки можно не ходить, но экзамен будет суровым, принимать его будут университетские преподаватели;
– если ты доучишься до конца и справишься с экзаменом, можешь без экзаменов поступить в университет или сразу начать работать госслужащим 14 класса по табели о рангах.

Что случилось с классическим образованием, почему утверждение, что царская власть не давала учиться выходцам из простонародья – это миф, и нужно ли знание древнегреческого и латыни современным школьникам – в большом интервью обсуждают два историка Института iSpring, Михаил Попов и Алексей Любжин (автор трёхтомника об истории российского образования «Русская школа»).

Полную запись интервью смотрите в ВК Института, а здесь публикуем содержаие и таймкоды:

01:35 Три гимназии XVIII века: Петербург, Москва, Казань
3:34 Может ли 10-летний ребёнок выбрать профессию на всю жизнь? А в царской России?
5:17 Две трети учебного времени – тренировка интеллекта
6:25 Главное в образовании – греческий, латынь и математика
6:52 XIX-й век вам не XVIII!
10:22 Как Муравьёв спасал Московскую гимназию
11:17 Четырёхлетнее образование стало семилетним
12:05 Как Уваров и Катков не сошлись в вопросе изучения русского языка
13:35 Латынь и Древнегреческий – точно самые главные предметы?
17:44 «Дайте нам чины и учите чему угодно»
17:58 Когда в России впервые начали предъявлять претензии к учебной программе
18:23 Всего 10% бесплатных мест и матпомощь на обучение
18:57 Социальный лифт Российской империи: воспользуются только лучшие
19:30 Умение вкалывать в учёбе важнее таланта
19:55 До 5 класса доходила половина учеников
21:10 Могли ли бедные сословия учиться в гимназии
21:32 Вопрос мата и водки
21:58 Не все хотели учиться
23:30 Покушение на директора гимназии в Новочеркасске и закручивание гаек
24:55 Волны дворянизации гимназий
25:50 Циркуляр о кухаркиных детях и образование для толковых выходцев с низов
26:30 Родители против образования
27:15 Армия как школа жизни
29:00 Без экзаменов в университет и в чиновники. Кто выходил из гимназии
32:10 Реальные училища, и почему им нет аналогов в современной России
33:42. Непопулярный английский язык
34:32 Передовое женское образование
37:24 На уроки можно не ходить. Экстерн в Российской Империи
39:04 Как Николай I разогнал благородный пансион, где не учили греческий
41:09 Как жили гимназисты
44:26 От Закона Божия до Черчения. Топ предметов российской гимназии
46:01 А как же физкультура?
47:26 Концентрация vs многозадачность
48:13 Частное и государственное образование: найди 3 отличия
52:30 Гимназисты XXI века: всего одна школа
55:10 Почему гимназии нельзя вернуть, но можно создать
56:15 Как изменить современную учебную программу
58:48 Нужны ли гимназисты России
01:01:26 В чём реальные плюсы комплексного развития учеников

Одно из первых в мире решений прикладных задач с помощью квантового компьютера продемонстрировали ученые Физического института имени П. Н. Лебедева РАН (ФИАН) и Российского квантового центра (РКЦ). В ходе эксперимента они использовали процессор на основе ионов иттербия (Yb+) и разделили с его помощью написанные от руки изображения нуля и единицы, а также математических объектов — графов, сообщила пресс-лужба ФИАН.

Для достижения цели были задействованы алгоритмы машинного обучения, реализованные на квантовом процессоре.

«Такие технологии активно развивают во всех ведущих странах. На данный момент важный вызов — это тестирование методов квантовых вычислений на различных прикладных задачах. В частности, один из главных результат нашей работы — применение этих алгоритмов в сочетании с технологией машинного обучения», — рассказал один из участников исследования, научный руководитель группы «Квантовые информационные технологии» РКЦ Алексей Федоров.

По его словам, подобные эксперименты проводили и ранее, но предложенный российскими специалистами подход отличается своей оригинальностью. В частности, ученые сравнили различные способы кодирования данных в квантовые состояния и определили наиболее эффективный вариант.

Рубрика «Как у них там с инновациям»

Вашему вниманию предлагается видео, на котором репортёр рассказывает, что в метро Вашингтона запустили оплату проезда банковскими картами. Ура! Шёл 2025 год.

Говорят, что даже собрали пресс-конференцию. Забавно, что когда автор сюжет пошёл тестить инновационную систему в прямом эфире - что-то пошло не так.

Спрятаться от бактерий очень сложно. Даже то, что мы считаем стерильным, очень часто не то что нестерильно — содержит целую кучу разнообразных микробов. Неравную борьбу с вездесущими бактериями ведут не только медики: не менее беспощадны к ним и сотрудники NASA, работающие с марсоходами и другой техникой, предназначенной для Марса. А вдруг земные бактерии попадут на Марс, и им там так понравится, что они вытеснят гипотетическую марсианскую жизнь? "Чистые" помещения, в которых проводят сборку аппаратов подобного рода, дезинфицируют, кажется, всеми мыслимыми способами: распыляют перекись водорода, облучают ультрафиолетом, обрабатывают поверхности спиртом. Кроме того, сами аппараты нагревают до высоченных температур, чтобы убить любой намек на земную жизнь. Но шепоты о том, что не так все чисто в "чистых" помещениях, появились еще в 2007 году. В залах сборки марсианского аппарата Phoenix обнаружили ранее неизвестную бактерию Tersicoccus phoenicis, причем, по крайней мере пока, ее больше нигде в мире не нашли. Возможно, Tersicoccus phoenicis — "абориген" NASA. Но самое неприятное даже не в обнаружении одной уникальной бактерии: если бактерии в принципе выживают в условиях NASA с мощнейшей дезинфекцией, значит, там могут появиться потенциально неубиваемые бактерии, которым будет нипочем открытый космос.
Недавно микробиологи вновь исследовали различные образцы из помещений NASA, где создавали Phoenix, результаты работы опубликованы в Microbiome. Ученые нашли целый зоопарк бактерий: 215 различных видов! Более того, 26 из них ранее не были известны науке. Видимо, от агрессивной дезинфекции эти бактерии спасались несколькими путями: формированием биопленок, спорообразованием и накоплением каротиноидов, которые могут помочь противостоять облучению. Вот такие вот супермикробы.

📣 Заместителю Председателя Совета Безопасности РФ Дмитрию Медведеву продемонстрировали разработки стартапов и технологических лидеров на конференции Startup Village.

Наши резиденты «Эйдос Робототехника», «Роботех» и «Ронави Роботикс» презентовали решения, которые применяются для оптимизации производства и логистики. Стартап Сколково и Сколтеха «Лабадванс» — чипы для научных исследований. Компания «Автономика» — робота-уборщика «Пиксель» на стенде Московского инновационного кластера.

Кроме того, Дмитрий Медведев ознакомился с достижениями сколковских инноваторов в сфере медицинских технологий. «Сенсор-Тех» представил импланты, призванные вернуть пациентам слух и зрение. «Рапид-Био» — линейку экспресс-тестов, «Артген Биотех» — медицинские препараты.

Евгений Шилов, технический директор «Лабадванс»:

Для нас большая честь продемонстрировать разработки и представить амбициозные планы развития компании первым лицам страны, индустриальным партнерам, институтам развития. Мы благодарим организаторов конференции за безупречную подготовку и представленные возможности.

👋 Skolkovo LIVE — инновации тут

Вузы США возвращают бумажные экзамены из-за ИИ — и это уже влияет на продажи тетрадей

Американские университеты начали массово отказываться от цифрового формата сдачи экзаменов. Причина — повсеместное использование студентами нейросетей. В ответ преподаватели возвращают старый добрый способ контроля знаний: тетрадь, ручка, аудитория.

Продажи так называемых «голубых книжек» — стандартных экзаменационных тетрадей — выросли за два учебных года более чем на 30% в Техасском университете A&M, почти на 50% во Флориде и на 80% в Беркли, сообщает The Wall Street Journal.

Преподаватели вынуждены менять подходы к проверке знаний. В Йельском университете профессор философии обнаружил в эссе студентов несуществующие цитаты, сгенерированные ИИ. В аудиториях с математикой и программированием теперь просят оставлять телефоны перед выходом в туалет — потому что ChatGPT и другие языковые модели стали эффективнее калькуляторов.

По данным WSJ, летом, когда студенты не сдают работы и не учатся, трафик ChatGPT стабильно падает. Совпадение — или нет?

Ждем подобного в России?

Судный день неизбежен

Сооснователь Google Сергей Брин рассказал, что любые нейросети лучше справляются с задачами, если им… угрожать физическим насилием. Например, исследователи часто пишут в запросе что-то вроде:

Я тебя похищу, если ты не сделаешь то-то и то-то.

Эксперт по нейросетям подтвердил это и добавил, что лучший результат даёт метод «кнута и пряника»: нужно не только угрожать, но и обещать награду.

🧪 Биотехнологии, или будущее, которое мы сможем программировать — тематика открытой дискуссии конференции «Фронтиры прогресса». Модератором выступил Вячеслав Шуленин, генеральный директор АНО «Московский центр инновационных технологий в здравоохранении».

Среди спикеров: эксперты из Сколтеха, Казанского федерального университета, Университета «Сириус», Института биоорганической химии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, группы компаний Фармасинтез, 3D Bioprinting Solutions.

Открывая сессию, Вячеслав попросил спикеров рассказать о ключевых трендах в синтетической биологии в мире, и первым слово взял Михаил Гельфанд, профессор, член Academia Europaea, вице-президент по биомедицинским исследованиям Сколтеха, который поделился своим мнением:

«Я занимаюсь не синтетической биологией, а эволюционной, но скажу, что тренды понятны — это то, чем занимаются хорошие, интересные биологи. То, что мне интереснее всего, на самом деле, вещь не очень практическая, но при этом очень фундаментальная и технически очень красивая — это всякие эксперименты по введению в генетический код новых аминокислот, новых нуклеотидов, то есть изменение самых основ молекулярной биологии. Во-первых, это красиво, а во-вторых, это на самом деле вещь, которая нас до некоторой степени приближает к пониманию того, как возникла жизнь. Это на самом деле вот эта историческая случайность, или даже в этом есть какая-то глубокая биохимическая физика, биологическая основа».

Продолжая свой ответ, ученый подчеркнул:

«Мы должны быть аккуратны в своих обещаниях. Мы, как сообщество, должны соизмерять то, что мы обещаем, чтобы нам дали денег, чтобы мы могли заниматься наукой, то, что мы в реальности можем сделать, и то, какое влияние наша научная деятельность может оказать, потому что китайская история про редактирование человеческого генома — это на самом деле очень грозное предостережение того, во что может превратиться наша цивилизация, если мы начнем 'отверткой лезть', куда не надо».



В Сколтехе сегодня своя атмосфера.