Неизбежные столкновения систем репликации ДНК и транскрипции способствуют геномной нестабильности, свойственной опухолевым клеткам. Согласно исследованию в Nature Cancer, в результате таких столкновений образуются в том числе большие тандемные повторы, наличие которых ассоциировано с неблагоприятным прогнозом у онкологических больных. Однако содержащие эти повторы клетки обладают повышенной чувствительностью к ряду противоопухолевых препаратов.

Оказалось, что линии раковых клеток, содержащие много больших тандемных повторов, обладают повышенной чувствительностью к двум типам реагентов. Первый из них — ингибиторы ядерной тирозинкиназы WEE1 (например, адавосертиб), которая распознает повреждения ДНК в S фазе и регулирует переход G2/M, обеспечивая завершение репарации ДНК до начала митоза. Вторыой разновидностью оказались ингибиторы поли(АДФ-рибоза)-полимеразы PARP. Кроме того, клетки с нокаутом CDK12 были более чувствительны к нескольким ингибиторам киназ CHK1 и ATR, находящихся выше WEE1 по каскаду сигналов о повреждении ДНК. При этом они были устойчивы к трем ингибиторам синтеза ДНК —бендамустину (алкилирующий агент), неларабину и фамцикловиру (аналоги гуанина).
Таким образом, большие тандемные повторы в опухолевых клетках образуются в результате столкновения систем репликации и транскрипции. Их наличие может быть полезным прогностическим биомаркером, а также влиять на чувствительность опухолевых клеток к определенным препаратам — понимание этого имеет ценное значение в клинике.