начну издалека...

Осенью 2022 г. мы обсуждали с коллегами всякие интересные молекулярные каскады, приобретённые бактериями в ходе эволюции. В частности, речь зашла о механизме подавления иммунной системы хозяина, который есть у шигелл - бактерий, вызывающих сильнейшую дизентерию и диарею. Вообще, это один из самых опасных для человека инфекционных патогенезов - ежегодно, он уносит примерно миллион (!!!) жизней, в основном детей в беднейших странах мира, т.к. тамошние условия гигиены приводят к грандиозному заражению такими бактериями.

А ещё в то время как раз набирал обороты «хайп» вокруг AI-систем. Обсуждения ChatGPT стали занимать заметную часть новостной ленты. Я был уверен, что таковые системы могут стать отличным подспорьем в работе людей, в т.ч. в научных исследованиях. На примере темы бактериальной эволюции, я попросил тогдашний ChatGPT – в его ещё первой версии — написать небольшой научный обзор про бактерий и какие-то интересные проявления их эволюции. Что уж говорить, обзор получился... никакущий! Связность формулировок AI и уж тем паче их привязка к конкретным фактам и публикациям оказалась очень слабой. Не то чтобы моя вера в AI была подорвана - но и поводов верить в пользу таких подходов, сей эксперимент не прибавил.

Зато я тогда нырнул в дебри PubMed’a и нашёл там массу новых интереснейших исследований того, как шигеллы на молекулярном уровне «прорывают оборону» иммунной системы человека. Меня больше всего заинтересовало, что шигеллы приобрели гены, кодирующий аналоги убиквитин-лигаз - белков, пришивающих к другим белкам (мишеням) специальную «метку», сигнализирующую о необходимости деградировать («съесть») эти мишени с помощью протеасомы (комплекса, на постоянной основе занятого разложением всякого белкового «мусора» в клетках). Нюанс в том, что мишенями конкретно шигелльных аналогов лигаз являются… белки иммунной системы человека! Т.е. патоген использует системы «хозяина», чтобы те ударили по его же (хозяина) защите - собственная протеасома человека начинает «пожирать» его иммунно-важные белки. А через ослабленную иммунку прорывается (и размножается) шигелла. Глядя на своеобразную элегантность такого решения и простоту его молекулярного воплощения, рассматривая структуры комплексов лигаз и их мишеней, я задумался: «хм… наверно, эти лигазы можно модифицировать так, чтобы они нацеливались на вообще любую мишень? например, важный белок из патогена… или на онкоген в клетке человека… Жизнь пришла к "выгодному" для бактерий решению за миллионы лет эволюции - ну а Наука может прийти за миллионы теоретических расчётов... надо будет, как-нибудь, повозиться с соответствующими моделями - попробовать предсказать, что именно и где нужно мутировать в лигазе, дабы нацелить её на новые мишени...».

Прошло некоторое время с той истории, и мой приятель из США попросил прокомментировать терапевтические технологии, которые «продвигает» компания Kymera (приятелю была интересна потенциальная коллаборация с ними - но и хотелось разобраться «а что они вообще делают, стоит ли их игра свеч»).
Почитав описание их подхода, я с некоторым разочарованием понял - по сути, это ж мои мысли осени 2022! Не с чатботами мне надо было разговаривать - а хватать чужие статьи и собственные идеи в охапку, и бежать к инвесторам! Разве что в 2022 было уже поздновато… а вот в 2015 самое то - ибо, Kymera была основана ещё тогда. Идеи о целевой деградации белков настигли некоторых гораааздо раньше, чем меня - и ныне, Kymera оценивается в пару миллиардов (!) долларов.

В общем: если вовремя успеть - можно и миллиардером стать… наверно 🧐