Компания Illumina начала проект Billion Cell Atlas - первую часть программы по созданию атласа из 5 миллиардов человеческих клеток в течение трёх лет. Цель - получить максимально подробную карту того, как гены управляют болезнями на уровне отдельных клеток

В основе атласа лежат эксперименты с CRISPR. Учёные последовательно включают и выключают все ~20 000 человеческих генов и смотрят, как на это реагируют отдельные клетки. В первой фазе будет проанализирован 1 миллиард клеток из более чем 200 клеточных линий, подобранных под конкретные заболевания. Среди них рак, иммунные патологии, кардиометаболические болезни, неврологические расстройства и редкие генетические синдромы - именно те области, где биология до сих пор плохо поддаётся расшифровке.

Ключевая ценность проекта в масштабе. Раньше такие эксперименты проводились на тысячах или миллионах клеток, теперь речь идёт о миллиарде. Это позволяет видеть не усреднённые эффекты, а редкие и сложные клеточные состояния, которые часто и определяют развитие болезни или отклик на лекарство. Эти данные используются для проверки лекарственных мишеней, поиска новых показаний для уже известных препаратов и построения так называемых виртуальных клеток.

Проект создаётся совместно с AstraZeneca, Merck и Eli Lilly. Фармацевтические компании будут использовать атлас для обучения собственных фундаментальных ИИ-моделей, которые работают не на текстах и публикациях, а на реальных биологических данных. Это должно повысить точность предсказаний: какие гены действительно связаны с заболеванием, в каких тканях и при каких условиях, и какие вмешательства с наибольшей вероятностью приведут к терапевтическому эффекту.

С технической точки зрения это один из самых тяжёлых биологических проектов в истории. Illumina ожидает до 20 петабайт данных одноклеточной транскриптомики в год. Для этого используются их платформа Single Cell 3’ RNA, ускоренный пайплайн обработки DRAGEN и облачная аналитическая система Illumina Connected Analytics. Именно сочетание лабораторной автоматизации, вычислительного железа и облаков делает такой масштаб вообще возможным.

Важно, что это не академический атлас "ради науки", а продукт нового бизнес-направления BioInsight. Illumina фактически продаёт фундаментальную биологическую реальность как инфраструктуру для ИИ-фармацевтики. В долгосрочной перспективе такие атласы могут стать базой для точной медицины, где лекарства проектируются не под "среднего пациента", а под конкретные клеточные и генетические сценарии болезни

https://www.illumina.com/company/news-center/press-releases/press-release-details.html?newsid=fda84c92-b4b3-4691-a402-35555abe8605

#генетическое_редактирование #искусственный_интеллект