Псевдоаутосомные регионы

Каждая аутосома человека имеет пару с одинаковым набором генов и схожей морфологией, что позволяет им обмениваться генетическим материалом через процесс, называемый гомологичной рекомбинацией. Этот процесс обеспечивает разнообразие и генетическую стабильность.

Однако половые хромосомы человека (X и Y) значительно отличаются друг от друга. Эволюционно обе половые хромосомы происходят от гомологичной пары. Но в ходе эволюции млекопитающих происходила потеря генетического материала на Y-хромосоме и как следствие уменьшение ее размеров. У женщин обе Х-хромосомы одинаковы по размеру и генетическому содержанию, поэтому рекомбинация может проходить по всей их длине. Но у мужчин одна Х- и одна Y-хромосома, при чем они морфологически и генетически различаются. Однако они все равно способны взаимодействовать как гомологичная пара во время мейоза.

Возможно это благодаря псевдоаутосомным регионам (pseudoautosomal region, PAR). Они представляют собой небольшие участки, которые расположены на концах X- и Y-хромосом и имеют идентичные последовательности (PAR1 и PAR2). PAR ведут себя как аутосомы и рекомбинируют во время мейоза. Таким образом, гены в этой области наследуются аутосомно, а не строго сцеплено с полом. Их физическая длина составляет примерно 2,7 Мб для PAR1 и 0,33 Мб для PAR2.

Помнить об этой особенности очень важно при анализе данных NGS. Гены в PAR присутствуют в двух копиях как у мужчин, так и у женщин, что означает, что варианты, найденные в областях PAR у мужчин, будут либо гомозиготными, либо гетерозиготными, а не гемизиготными. Более того, интерпретация вариаций в числе копий (CNV) может быть непростой, поскольку некоторые алгоритмы могут пропускать PAR, рассматривая их как дупликации. Знания о PAR крайне важны для точного генетического анализа и понимания закономерностей наследования.

Точные координаты PAR1 и PAR2 по hg38 можно увидеть на сайте Ensembl.

#молбиол_ученый_вариант | @variant_scientist