День биоразнообразия: агрегаторы и базы данных

Где искать данные о биологическом разнообразии планеты? Агрегаторы биологических данных появились не так давно, но сегодня с их помощью каждый ученый может получить миллионы записей из биологических баз на свой компьютер. Рассказываем об этом подробнее в международный день биоразнообразия.

🌱 Варианты баз данных

В случае биологии можно выделить таксономические базы и базы «коллекционные». Первые включают информацию о положении таксона в системе живого мира, валидных названиях, синонимах и родственных связях между таксонами (скажем, TROPICOS). 

Коллекционные базы данных работают на уровне отдельных организмов и предоставляют информацию об их распространении, внешних признаках. Сюда же включены фотографии, записи голосов птиц, видео, последовательности ДНК и пр. Их, кстати, можно разделить «оцифрованные коллекции» и на «агрегаторы». Примером оцифрованных коллекций может служить портал Цифрового гербария МГУ имени М.В. Ломоносова, о котором мы рассказывали раньше.

🪴 Агрегаторы

Агрегаторы пополняются разными людьми и организациями. У каждого проекта свои требования к типам данных, их региональной приуроченности и т.д. Например, «GBIF» — база по распространению всех видов живых организмов. Она насчитывает более 3 миллионов записей из 113 856 датасетов. Скачать их может любой — достаточно пройти регистрацию на портале. А вот добавлять можно лишь от лица научных организаций и в определенном формате.

🌳 Другие примеры

Ещё несколько порталов, которые могут быть интересны не только ученым, но и всем любителям живой природы, собрали ниже.

iNaturalist – крупный международный портал, о котором мы рассказывали подробнее в отдельном посте. Их сообщество насчитывает 5 миллионов пользователей со всего мира, наблюдающих за природой. Сайт полностью русифицирован.

Avibase посвящена исключительно птицам и насчитывает 53 962 805 записей. Здесь можно выбрать свой регион и скачать для него список встречающихся птиц с фотографиями и базовой информацией. Портал частично переведен на русский язык.

На портале Млекопитающие России можно найти 277 844 записей и 111 689 фотографий млекопитающих страны. Пользователи могут добавлять свои данные в свободном режиме.

🤖 «Системный Блокъ» @sysblok