Тут уважаемый @pensarata рассказал про свой конкурс предсказания транскрипционных факторов IBIS.

В докладе был интересный момент про то, что модельки могут хорошо предсказывать связывание TF с днкой, но при этом ломаются, если пытаться определить эффект однонуклеотидной замены в сайте связывания.

Мне кажется, я знаю, почему.

Потому что мл модельки не выучивают физику связывания ДНК и ТФ точно так же, как AlphaFold не выучивает физику свёртки белка. Модельки работают как базы данных и если в базе данных нет информации об эффекте замены, то и не появится. Это все история про стохастического попугайчика.

P.S. донт гет ми стартед на тему ллмок, которые являются ровно тем же самым, несмотря на новые лолгоритмы типа зацикленного самопромптинга, ой, простите, ризонинга. Агииииии нет.