FragalyseQt - 0.5.3

Что это такое:

свободный (AGPLv3) и кроссплатформенный (Linux, macOS, *BSD, Windows - x86, ARM, RISC-V...) софт для неинвазивного (исходные файлы НЕ ИЗМЕНЯЮТСЯ) анализа данных капиллярного электрофореза, способный обрабатывать результаты, независимо от оборудования, на котором они было получены (поддерживаются в т.ч. древние и недокументированные версии ABIF), а также корректировать базовую линию, подавлять шумы, определять размер фрагментов, бинировать аллели, фильтровать статтеры, поддерживает панели GeneMapper, GeneMarker и NCBI OSIRIS.

В этом релизе:
- выравнивание маркера молекулярной массы с возможностью игнорирования пиков-спутников и блобов,
- улучшенное шумоподавление и коррекция базовой линии,
- возможность раздельного просмотра результатов по каналам,
- возможность сокрытия боковой панели,
- общее улучшение производительности.

Репозиторий: github.com/Dorif/fragalyseqt
Релиз: github.com/Dorif/fragalyseqt/releases/tag/southern_ladder

P.S.: отдельные благодарности за поддержку коллегам из @webhostmost и моей жене ( @Dr_Elena_Bahova ).
P.P.S.: на скриншоте часть моего собственного профиля Global Filer, полученного на картридже SeqStudio с истёкшим сроком и представлявшего трудности для анализа, которые по итогу были преодолены.
____

What's this:

free (AGPLv3) and crossplatform (Linux, macOS, *BSD, Windows, x86, ARM, RISC-V...) soft for non-invasive capillary electrophoresis data analysis, capable of handling CE data independently from machine they were obtained at (even extremely old and undocumented versions of ABIF are supported), correct baseline, denoise signal, sizecall fragments, bin alleles, filter stutters and supports panel definitions from GeneMapper, GeneMarker and NCBI OSIRIS.

In this release:

- ladder alignment and ladder channel blobs and satellites overcoming,
- better noise filtering and baseline correction,
- split view for electrophoresis results,
side panel hiding,
- overall performance improvement.

Repo: github.com/Dorif/fragalyseqt
Release: github.com/Dorif/fragalyseqt/releases/tag/southern_ladder

P.S.: special thanks for support to my colleagues from @webhostmost and to my wife ( @Dr_Elena_Bahova ).
P.P.S.: screenshot represents a part of my own Global Filer profile obtained at expired SeqStudio cartridge having problems with analysis which were successfully overcomed.

#foss #fragalyseqt