Когда лингвисты реконструируют совсем древние пра-пра-пра-языки, они опираются на принцип униформитаризма: предполагается, что языки прошлого работали примерно так же, как современные. То есть например, мы почему-то сразу наивно полагаем, что там точно были гласные и согласные, глаголы и существительные и так далее.
Но на самом деле проверить это без машины времени невозможно...