TGViewer
Kardymonchik Channel Kardymonchik Channel @kardymonchik · 906 subscribers
Post #224 2.39K
Дошли руки до AlphaGenome - модель от Google, способная по последовательностям ДНК в 1 млн "букв" делать предсказания среди 11 модальностей, включающих экспрессию генов, элементы сплайсинга, состояние хроматина и карты хроматиновых контактов.

Плюсы:
- очень простой и понятный тьюториал. Для коллег, занимающихся образованием, очень рекоммендую попробовать готовые блокноты.
- для запуска ничего не надо, кроме API ключа (нет никакой проблемы получить)
- отдельные треки предсказывает очень хорошо

Минусы:

- не все обещанные треки умеет хорошо предсказывать, периодически выдает ерунду
- доступ только через API, вы не можете у себя установить и что-либо еще с ней поделать
- можно запускать небольшими регионами для исследования, целый геном в нее сразу не воткнете
- использование разрешено только в некоммерческих целях и в исследовательских задачах (для медицины нельзя)

Если более 100 страниц статьи читать не хочется, был неплохой семинар под запись, где Алена Аспидова и Вениамин Фишман, в открытой дискуссии с коллегами, разобрали статью. Как по мне, самая интересная часть в конце :)
  • 🔥 12
  • ❤ 2
More from @kardymonchik
  1. Sep 18, 2026Медицинская генетика - это почти всегда про что-то неизлечимое, страшное. Но сегодня я пла…
  2. Aug 29, 2026Предсказание пространственной структуры белка — задача, сформулированная еще Кристианом Ан…
  3. Aug 29, 2026Вообще, мне очень нравится, как Георгий Куракин профессионально подходит к изучению вопрос…
  4. Mar 17, 2026Post #229
  5. Jan 29, 2026От себя добавлю, что авторы AlphaGenome выложили код и веса! Бесценно ❤️
  6. Jan 29, 2026Несколько месяцев назад мы на этом канале разбирали препринт aGenome. А сегодня полноценна…
Threads Profile ViewerView any public Threads profile without an account.Open ThreadLook →Writing with AI? Make it sound human.Metric37 rewrites AI drafts so they read naturally. Free AI detector, 1,500 words free.Try Metric37 →