@BarProfi спросил вот:
"А есть какие-то эталоны у них, с которыми сверяется результат? Типа собирали БМВ, а получились Жигули - разбираем обратно. А то кажется, что в целом там процессы идут ну так себе и нет ОТК на выходе"
Так вот. Есть и ОТК, и много чего ещё. Например, очень часто имеет смысл взять готовую структуру и путём доустановки модулей или откусывания чего-то превратить её в другое изделие.
Для этого есть, в частности, белки-шапероны (от французского "сопровождающий").
Для примера возьмём Hsp90, один из наиболее распространённых белков, бродящих по клетке с лобзиком, как мастер по цеху.
— Он видит неправильно свёрнутые или частично свёрнутые белки и умеет их правильно доворачивать.
— Может удерживать белки свёрнутыми, пока они не соберутся до конца сборки.
— Может модифицировать уже после трансляции — берёт белок и несёт в другой цех на доработку. Например, может помогать транспортировке белков в ядро клетки или к мембранам. В разных цехах делаются разные доработки: белок, доставленный в аппарат Гольджи, может быть гликозилирован (+ сахарные группы).
— Может фосфорилировать, если надо. Может не фосфорилировать.
— Может участвовать в контроле качества и разметить белок как брак. Тогда его потом уберут другие рабочие.
Самая частая работа шаперона — досвернуть белок из какого-нибудь ублюдочного неправильного состояния в рабочее, либо отметить его как брак.
Иногда в зависимости от того, что делает шаперон, меняется функционал собираемого изделия. Фосфофруктокиназа может действовать как фермент гликолиза или как регулятор транскрипции в зависимости от её структуры.
Возьмём для примера "кризисный" p53. Это такой добрейший парень Женя с редкой фамилией Уик, который всю жизнь тренировался обращению с оружием, единоборствам и тактике спецназа. Просто хобби такое. У него есть несколько неупорядоченных доменов, которые не имеют фиксированной геометрии в обычной жизни. Вся жизнь Жени держится на собаке — это уже знакомый вам шаперон Hsp90 всегда с ним и на всякий случай убеждается, что ни во что опасное p53 не сворачивается. То есть благодаря собачке Женя нормально социализирован, добр, у него есть работа, жена, хобби, любимая футбольная команда и машина.
При клеточном стрессе (например, повреждении ДНК) взаимодействие между Hsp90 и p53 изменяется. Машина из жизни Жени пропадает, и Женя потихоньку начинает звереть — поначалу от мелких несправедливостей, а потом от всё более крупных. Потом кто-то обижает его собаку, и Уику срывает крышу. Он ровно в нужном месте и в нужное время начинает делать то, к чему его всю жизнь готовили видеоигры.
Изменение той самой неупорядоченной структуры ведёт к тому, что p53 начинает регулировать экспрессию генов, участвующих в остановке клеточного цикла или апоптозе. То есть либо Женя приходит и следит, чтобы у ДНК было время для репарации ДНК, либо гасит вообще всех, а потом прорывается к панели управления клеткой и нажимает на кнопку "ЗАПУСТИТЬ САМОЛИКВИДАЦИЮ".
Пример работы, где на одном конкретном белке очень хорошо видно контроль качества. Вот более общая про уборку битых белков. Про тепловой шок и активацию старых белков на случай перегрева.
В общем, белки, как старые пассажирские Газели, с завода сходят сразу в автосервис на доработки. Чтобы получилась либо скорая, либо машина, например. Либо ещё +2 кресла для пассажиров.
#гуманитарии_познают_мир
--
Вступайте в ряды Фурье! Нормально у нас это так: ⊥