У нас новая ДНК-модель - modernGENA!

modernGENA - продолжение GENA-LM на кодбазе modernBERT. Эта модель быстрее, поддерживает более новые версии библиотек и выдает лучшие результаты на всех задачах, которые мы пробовали.

Если вы используете трансформеры для процессинга последовательностей ДНК - попробуйте использовать modernGENA для ваших экспериментов.

Я написал примеры кода - как затюнить modernGENA для предсказания позиций пиков или уровня сигнала ChIP-seq для вашего любимого трека ENCODE.

Скачать: GitHub & Huggiface
Статья: bioxriv