Ура! Нашу статью о роли конденсинов в организации интерфазного хроматина приняли к публикации в Nucleic Acids Research!
Не буду пересказывать наши находки потому что они интересны двум с половиной специалистам по организации хромосом, а расскажу насколько итоговая работа отличается от исходной задумки. И сколько времени проходит от идеи до публикации.
Идея родилась 2019 из рассматривания карт Hi-C стволовых клеток мыши. На картах была видна "вторая диагональ" - структура характерная для митотических хромосом, а не для интерфазных ядер. В хромосомах ее делает конденсин II, поэтому захотелось проверить, может в стволовых клетках конденсин II работает в интерфазе? Это было бы необычно, а потому интересно. Но поскольку, белок очень важный, просто нокаутировать его нельзя - клетка погибнет. Биология мертвых, это конечно тоже интересно, но это не наш профиль :) Пришлось осваивать систему ауксин индуцируемых дегронов, чтоб быстро и контролируемо убирать конденсины из клеток.
В итоге мы поняли, что исходная гипотеза неверна конденсин II не организует вторую диагональ в интерфазе, эта структура наследуется из предыдущего митоза. Чисто в рекламных целях мы назвали этот эффект структурным эхо и вынесли его в название "Condensins-mediated mitotic folding persists as a structural echo in interphase chromatin".

Поскольку конденсинов у нас два, то второй из них (конденсин I) все время выступал у нас в качестве контроля, и он действительно оказался не причастен формированию второй диагонали. Но мы случайно, а на самом деле неслучайно, а потому что мы большие профики в геномике и внимательно и всесторонне изучаем полученные данные, обнаружили, что если убрать конденсин I, то эу- и гетерохроматин в ядре перемешиваются сильнее, чем в норме. Мы до конца не понимаем как это работает, но эффект показали уверено. Я думаю, что именно этот результат в нашей работе самый важный, потому, что существующие концепции организации хроматина этот эффект никак не объясняют.
Итого от идеи до публикации 7 лет, из них год от первого сабмишена до публикации. Первичная гипотеза  отвергнута, оказалась верна альтернативная. Попутно обнаружился эффект совершенно неожиданный. Для ответа на первичный вопрос освоена технология дегронов, ставшая основой еще для еще 3 или 4 работ лаборатории.
Благодарю всех соавторов и восхищаюсь невероятной работой проделанной лидирующим автором этого исследования Анастасией Юнусовой!
Препринт