TGViewer
Вениамин Фишман Вениамин Фишман @fishmanvs · 1.36K subscribers
Post #798 2.01K
Вышел Nucleotide Transformer v3 - языковая модель ДНК от InstaDeep (BioNTech). Хорошая и очень подробная статья.

TL;DR - если вам нужно зафантюнить модель
ДНК-->разметка или функция
+ в задаче важен длинный контекст,
NTv3 и аналогичные претренированные модели (например, наша GENA) - лучшее решение по соотношению копьют/качество. Если задачу уже решил aGenome/Borzoi/etc - без разницы кого брать.

Больше всего впечатлило, что модель может точно предсказать эффект мутации энхансеров на расстоянии 20+ Kb от промотора, причем чувствует разинцу в силе энхансера, его расстояния до промотора и осознает, в каком типе клеток это все происходит.

П.С. Картинки очень красиво у них сделаны =)
П.П.С. Традиционно привожу и ссылку на мнения критиков, которые считаю, что все эти модели - путь в никуда
  • ❤ 14
  • 👍 5
More from @fishmanvs
  1. Sep 28, 2026Ура! Нашу статью о роли конденсинов в организации интерфазного хроматина приняли к публика…
  2. Sep 28, 2026У нас выходит новая статья по 3D укладке хроматина. С удовольствием делюсь комментариями о…
  3. Sep 26, 2026Не едет ли кто-то из Берлина в РФ в ближайшее время, в идеале - в Новосибирск? Дайте знать…
  4. Sep 25, 2026Объединяем исследователей для обучения ИИ долгосрочному планированию Владислав Куренков, р…
  5. Sep 25, 2026Вдруг получится также круто, как с Go =)
  6. Sep 23, 2026Компания Basecamp research, которая создаёт закрытый (частный) датасет, секвенируя геномы…
Threads Profile ViewerView any public Threads profile without an account.Open ThreadLook →Writing with AI? Make it sound human.Metric37 rewrites AI drafts so they read naturally. Free AI detector, 1,500 words free.Try Metric37 →