Выше я уже неоднократно писал об успехах языковых моделей ДНК. На этом канале также можно почитать и мнения скептиков, которые считают, что текущие модели работают не на столько лучше аналогов, чтобы считать направление языковых моделей перспективным. Мне, в свою очередь, кажется, что мы просто движемся маленькими шажками (как это почти всегда бывает в науке), но эти шаги приведут нас к большим прорывам. И новая работа от ARC institute, как мне кажется, подтверждает эту гипотезу:

Модель Evo2 способна генерировать жизнеспособных бактериофагов, по фитнесу превосходящих дикотипных.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.09.12.675911v1

те, кто работают с фагами, знают, что их геномы высоко оптимизированы и не так-то просто внести какое-либо изменение, которое хотя бы не уменьшает фитнес. Хотя (как и любая генеративная языковая модель) модель Evo по сути комбинирует увиденные ранее фаги, созданные комбинации не являются точной копией какой-либо сущетсвующей в природе последовательности (авторы специально ограничили генерацию уровнем сходства <95% с существующими геномами). Наиболее далекие от встречающихся в природе синтетические фаги имели гомологию на уровне белка менее 70%!

Создание же синтетических бактериофагов с повышенной вирулентностью in silico - сверхсложная задача. Авторы статьи показывают, что современные модели могут к ней подступиться .