Deep generative models design mRNA sequences with enhanced translational capacity and stability

На прошлой неделе в Science вышла статья о дизайне ключенвых элементов РНК: 5' и 3' UTRs с параллельной кодон-оптимизацией на основе предобученых трансформеров (модель GEMORNA). Основное целеполагание - создание эффективных РНК-вакцин. Пока успел лишь бегло пробежать, но радует, что авторы провели экспериментальную валидацию и показали увеличение экспрессии в сравнении с другими методами кодон-оптимизации (см. график).

Статью мне ещё предстоит внимательно прочитать - возможно, отдельные элементы будут нам полезны для создания тканеспецифичных векторов для генной терапии или поиска UTRs при аннотации генов. А пока есть краткий пересказ от PCR-news