Наш инструмент для моделирования Hi-C-контактов хромосомных перестроек Charm опубликован в NAR Genomics and Bioinformatics!

Если вы хотите понять, как на Hi-C карте будут выглядеть делеции, инверсии, транслокации или другие перестройки — попробуйсте Charm.

Подходит для:
— моделирования влияния SV на 3D-архитектуру генома
— генерации синтетических данных
— обучения и демонстраций

📄 Статья: https://academic.oup.com/nargab/article/7/2/lqaf081/8169141
💻 гитхаб: https://github.com/genomech/charm

П.С. Это была статья, в которой мы прошли рекордное для меня число раундов рецензирования у одних и тех же рецензентов - 5 ревизий.