#зоопарк_одобряет

У «Ъ-науки» вышло большое интервью о GENA и биоинформатике с Вениамином Фишманом, доктором биологических наук, ведущим научным сотрудником группы «Биоинформатика» Института AIRI и Института цитологии и генетики СО РАН.

Фишман подробно рассказывает о первой российской нейросетке, обученной обрабатывать длинные последовательности ДНК. Разработчики GENA обучили нейросетевую модель на полной сборке генома человека и выложили ее в открытом доступе. За это время GENA из одной модели стал «семейством», а в конце января ученые AIRI опубликовали статью о разработке в Nucleic Acids Research (IF 16.6).

GENA уже сейчас способна обрабатывать входные данные длиной до 36 000 пар оснований, и благодаря интеграции недавно разработанного механизма рекуррентной памяти этот показатель можно еще нарастить.

Для интересующихся разработкой уже открыт веб-сервис https://dnalm.airi.net, в который можно ввести последовательность ДНК и получить несколько типовых аннотаций, чтобы прикинуть, насколько такой инструмент может вам вообще пригодиться. Чтобы выжать максимум функционала, потребуются навыки программирования и биоинформатики, но в целом все модели максимально упрощены в использовании. Все необходимое лежит в репозиториях на платформах Hugging Face и GitHub.

Читать тут: https://www.kommersant.ru/doc/7550813