ExoBioGene💊🧬

🧬 کارگاه فشرده تحلیل داده‌های Bulk RNA-seq

🔬 مجموعه تحقیقاتی اگزوبایوژن با همکاری آزمایشگاه مرکزی دانشگاه خوارزمی تهران برگزار می‌کند.

👩‍🏫 مدرس:
سرکار خانم ریحانه سادات ظهیرالدینی
دانشجوی دکترای تخصصی ژنتیک مولکولی
پژوهشگر حوزه بیوانفورماتیک و یادگیری ماشین

🧬 سرفصل‌های کارگاه:
▫️مبانی RNA-seq و داده‌های NGS
▫️مدیریت و آماده‌سازی داده‌های RNA-seq
▫️پایپ‌لاین Upstream: QC، Alignment و Quantification
▫️تحلیل Differential Expression با DESeq2 و...
▫️تفسیر و ارائه نتایج برای مقالات علمی

📅 تاریخ برگزاری: ۳۰ مهر و ۱ آبان
⏰ زمان: ۱۷ تا ۱۹
🎓 همراه با گواهی معتبر
🧪 پشتیبانی علمی به مدت ۳ ماه

🎁 تخفیف گروهی🎁
▫️ ثبت‌نام ۳ نفره: ۱۰٪ تخفیف برای هر نفر
▫️ ثبت‌نام بیش از ۳ نفر: ۱۵٪ تخفیف برای هر نفر

پیداکردن هم گروهی برای دریافت تخفیف👈گروه پرسش و پاسخ اگزوبایوژن

📌 پیش‌نیاز:
برای حضور مؤثرتر در این کارگاه، آشنایی اولیه با برنامه‌نویسی و کار با محیط‌های محاسباتی توصیه می‌شود.

🌐 جهت ثبت‌نام کلیک کنید

هزینه ثبت‌نام: ۶۶۵ هزار تومان
📞 پشتیبانی و ثبت‌نام گروهی:
@exobiogen
همراه ما:
وبسایت | تلگرام | اینستاگرام | بله | لینکدین

🧪 آیا می‌دانستید؟
همه آنتی‌اکسیدان‌های یک گیاه را نمی‌توان فقط با یک تست اندازه‌گیری کرد! 🌿

یکی از روش‌های رایج برای ارزیابی ترکیبات فنولی گیاهان، تست Total Phenolic Content (TPC) یا سنجش مقدار کل ترکیبات فنولی است.

در این روش، ترکیبات فنولی موجود در عصاره با معرف Folin–Ciocalteu واکنش داده و شدت رنگ ایجادشده با اسپکتروفتومتر اندازه‌گیری می‌شود. مقدار به‌دست‌آمده معمولاً با استفاده از یک استاندارد مانند Gallic acid گزارش شده و به‌صورت mg GAE/g extract بیان می‌شود.

🌱 ترکیبات فنولی شامل گروه متنوعی از مواد مانند فنولیک اسیدها، فلاونوئیدها و برخی پلی‌فنول‌ها هستند و می‌توانند در فعالیت آنتی‌اکسیدانی گیاه نقش داشته باشند.

⚠️ نکته مهم:
عنوانTPC معادل «مقدار کل آنتی‌اکسیدان‌ها» نیست. این تست عمدتاً ظرفیت واکنش‌پذیری ترکیبات فنولی و برخی مواد احیاکننده موجود در نمونه را نشان می‌دهد؛ بنابراین برای ارزیابی کامل فعالیت آنتی‌اکسیدانی، معمولاً در کنار آزمون‌هایی مانند DPPH، ABTS یا FRAP استفاده می‌شود.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🧪 آیا با تست Total Phenol آشنا هستید؟

سنجش فنول کل (Total Phenolic Content) یکی از رایج‌ترین آزمایش‌ها برای اندازه‌گیری میزان ترکیبات فنولی در نمونه‌های گیاهی، عصاره‌ها، نانوذرات زیستی و بیومتریال‌هاست.

این تست چه چیزی را اندازه‌گیری می‌کند؟
ترکیبات فنولی به دلیل خواص آنتی‌اکسیدانی، ضدالتهابی و ضدمیکروبی نقش مهمی در بسیاری از پژوهش‌های علوم زیستی دارند. در این آزمایش، مقدار کل این ترکیبات در نمونه تعیین می‌شود.

کاربردهای تست Total Phenol
🌿 بررسی عصاره‌های گیاهی و فرآورده‌های طبیعی
🧬 ارزیابی آزادسازی ترکیبات فنولی از داربست‌ها و هیدروژل‌ها
⚛️ مطالعات نانوذرات و سامانه‌های دارورسانی
🔬 پژوهش‌های مرتبط با فعالیت آنتی‌اکسیدانی

نکته آزمایشگاهی

در بیشتر پروتکل‌ها از معرف فولین–سیوکالتیو (Folin–Ciocalteu) استفاده می‌شود و نتایج معمولاً بر حسب Gallic Acid Equivalent (GAE) گزارش می‌شوند.

💡 آیا می‌دانستید؟ افزایش مقدار فنول کل معمولاً با افزایش ظرفیت آنتی‌اکسیدانی نمونه ارتباط دارد، اما این دو شاخص همیشه کاملاً یکسان نیستند و باید به‌صورت جداگانه ارزیابی شوند.

#TotalPhenol

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🧪 سنجش توتال فنول در اگزوبایوژن

یکی از مراحل مهم در ارزیابی ترکیبات زیست‌فعال، اندازه‌گیری میزان فنول کل (Total Phenolic Content) .

در این پروژه، نمونه‌ها طی یک دوره ۲۱ روزه مورد بررسی قرار می‌گیرن و در پایان، میزان توتال فنول با استفاده از کیت سنجش اختصاصی اندازه‌گیری و تحلیل میشه. 🌿🔬

اول هفته‌تون پر از انرژی و ریسرچ های خوب. ❤️

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🔬 همراه شما هستیم در کلاس درس دکتر رسولی
📊 کارگاه «تحلیل داده‌ها با R»

امیدواریم این جلسه، تجربه‌ای مفید و کاربردی برای شما باشد.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🧬 همراه شما هستیم در جلسه دوم کارگاه تحلیل داده‌های زیستی با زبان R

لطفاً حداقل ۱۵ دقیقه پیش از شروع کلاس وارد فضای وبینار شوید تا در صورت وجود هرگونه مشکل در ورود، صدا یا تصویر، فرصت کافی برای بررسی و رفع آن داشته باشیم.

منتظر حضورتون هستیم و امیدواریم کارگاه مفید و پرباری در کنار هم داشته باشیم.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🧬 کارگاه جامع استخراج، شناسایی و مهندسی اگزوزوم‌ها

🔬 مجموعه تحقیقاتی اگزوبایوژن با همکاری آزمایشگاه مرکزی دانشگاه خوارزمی برگزار می‌کند.

👩‍🏫 مدرس:
خانم دکتر لیلا درزی
دکترای تخصصی (Ph.D) بیوتکنولوژی پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس

🧬 سرفصل‌ها:
▫️ مقدمه‌ای بر اگزوزوم‌ها: ساختار و بایوژنز
▫️ کشت سلولی و آماده‌سازی محیط شرطی‌شده
▫️ روش‌های جداسازی اگزوزوم
▫️ شناسایی و کنترل کیفیت اگزوزوم‌ها
▫️ مهندسی سطح اگزوزوم و لیگاندهای هدفمند
▫️ بارگذاری و شناسایی محتوای اگزوزوم
▫️ بررسی جذب سلولی اگزوزوم‌ها

📅 تاریخ برگزاری: ۱۷ مهر ماه
⏰ زمان: ۱۲:۰۰ تا ۱۴:۰۰
🎓 همراه با گواهی معتبر و رسمی دانشگاهی
🧪 پشتیبانی علمی و دسترسی به محتوای آموزشی تا ۳ ماه

هزینه ثبت نام: ۳۵۹ هزار تومان

🔴🟡 تخفیف گروهی:
▫️ ثبت‌نام ۳ نفره: ۱۰٪ تخفیف برای هر نفر
▫️ ثبت‌نام بیش از ۳ نفر: ۱۵٪ تخفیف برای هر نفر

پیداکردن هم گروهی برای دریافت تخفیف👈گروه پرسش و پاسخ اگزوبایوژن

🌐 جهت ثبت‌نام کلیک کنید.

📞 پشتیبانی و ثبت نام گروهی در تلگرام و بله:
@exobiogen

🌱 همراه ما:
وبسایت | تلگرام | اینستاگرام | بله | لینکدین

🧬 همراه شما هستیم در کارگاه تحلیل داده‌های زیستی با زبان R

خوشحالیم که امروز در این کارگاه کنار شما هستیم. 🌿

لطفاً حداقل ۱۵ دقیقه پیش از شروع کلاس وارد فضای وبینار شوید تا در صورت وجود هرگونه مشکل در ورود، صدا یا تصویر، فرصت کافی برای بررسی و رفع آن داشته باشیم.

منتظر حضورتون هستیم و امیدواریم کارگاه مفید و پرباری در کنار هم داشته باشیم.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🌱 پیشرفت‌های اخیر در اگزوزوم‌های گیاهی؛ از آزمایشگاه تا پزشکی

پژوهش‌های سال‌های ۲۰۲۵ و ۲۰۲۶ نشان می‌دهند که اگزوزوم‌های گیاهی از یک موضوع آزمایشگاهی به سمت کاربردهای درمانی و دارورسانی حرکت کرده‌اند.

مهم‌ترین پیشرفت‌ها:
🔹 توسعه روش‌های Microfluidic برای استخراج سریع‌تر و با خلوص بیشتر.

🔹 ترکیب چند روش جداسازی (مانند SEC + Ultrafiltration) برای افزایش کیفیت نمونه.

🔹 مهندسی اگزوزوم‌های گیاهی برای حمل دارو، RNA و مولکول‌های درمانی.

🔹 بررسی کاربرد آن‌ها در ترمیم بافت، بیماری‌های التهابی، سرطان و دارورسانی هدفمند.

📌 چالش اصلی این حوزه هنوز استانداردسازی روش‌های استخراج و خالص‌سازی است تا نتایج مطالعات مختلف قابل مقایسه و قابل تکرار باشند.

🧬 ExoBioGene | Science Support for Research

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🌿 اگزوزوم‌های گیاهی چگونه استخراج می‌شوند؟

استخراج اگزوزوم‌های گیاهی (Plant-Derived Extracellular Vesicles; PDEVs) یکی از مهم‌ترین مراحل پژوهش است؛ زیرا روش استخراج می‌تواند بر خلوص، اندازه، پایداری و عملکرد زیستی این نانووزیکول‌ها اثر بگذارد.

رایج‌ترین روش‌های استخراج:

🧪 Ultracentrifugation
متداول‌ترین روش؛ جداسازی بر اساس اندازه و چگالی با دورهای بسیار بالا.

🧫 Polymer Precipitation (PEG)
استفاده از پلی‌اتیلن گلیکول برای رسوب دادن وزیکول‌ها؛ روشی ساده و کم‌هزینه که در بسیاری از مطالعات گیاهی استفاده می‌شود.

🧬 Size-Exclusion Chromatography (SEC)
جداسازی بر اساس اندازه و کاهش آلودگی پروتئین‌ها و سایر ذرات.

💧 Ultrafiltration
تغلیظ و جداسازی وزیکول‌ها با استفاده از فیلترهای دارای اندازه منافذ مشخص.

📌 هیچ روش واحدی کامل نیست؛ انتخاب روش به نوع گیاه، حجم نمونه، تجهیزات آزمایشگاه و هدف پژوهش بستگی دارد.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🌿 اگزوزوم‌های گیاهی؛ پیام‌رسان‌های طبیعی گیاهان

تا چند سال پیش تصور می‌شد اگزوزوم‌ها فقط در سلول‌های جانوری وجود دارند؛ اما امروزه می‌دانیم گیاهان نیز وزیکول‌های خارج‌سلولی (Plant Extracellular Vesicles یا PDEVs) تولید می‌کنند.

این نانووزیکول‌ها، ساختارهایی با غشای لیپیدی هستند که مولکول‌های زیستی مهمی را حمل می‌کنند؛ از جمله RNA، پروتئین‌ها، لیپیدها و متابولیت‌های گیاهی.

اگزوزوم‌های گیاهی چه وظایفی دارند؟
- انتقال پیام بین سلول‌های گیاه.
- مشارکت در پاسخ به تنش‌های محیطی و عوامل بیماری‌زا.
- نقش در دفاع گیاه در برابر قارچ‌ها و باکتری‌ها.
- انتقال مولکول‌های زیستی به سلول‌های جانوری؛ موضوعی که در سال‌های اخیر توجه زیادی را در پزشکی و نانوزیست‌فناوری جلب کرده است.

چرا این حوزه مهم است؟
اگزوزوم‌های گیاهی به دلیل منشأ طبیعی، زیست‌سازگاری بالا و قابلیت حمل مولکول‌های فعال، به‌عنوان یکی از زمینه‌های نوظهور در دارورسانی، ترمیم بافت و پزشکی بازساختی مورد مطالعه قرار گرفته‌اند.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

⏳ آخرین فرصت ثبت‌نام در کارگاه ۲ روزه تحلیل داده‌ها با R

این کارگاه، پیش‌نیاز کارگاه RNA-seq است و برای افرادی که قصد دارند تحلیل‌های زیستی را با زبان R انجام دهند، طراحی شده است.

خوشحالیم که فردا همراه شما هستیم در آخر هفته علمی و مفید، با آموزش برنامه‌نویسی و تحلیل داده‌های زیستی با R 🧬💻

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🧬 کارگاه آنلاین تحلیل داده‌های زیستی با زبان برنامه‌نویسی R

❌فقط ۱ روز تا پایان مهلت ثبت نام ❌

🔬 مجموعه تحقیقاتی اگزوبایوژن با همکاری آزمایشگاه مرکزی دانشگاه خوارزمی تهران برگزار می‌کند.

👨‍🏫 مدرس:
جناب آقای احمدرضا رسولی
کاندید دکترای بیوانفورماتیک دانشگاه تهران

🧬 سرفصل‌ها:
- آشنایی با محیط R و RStudio
- ورود داده‌های زیستی
- بررسی و مدیریت داده‌های گمشده (NA)
- تمیزسازی داده‌ها با "dplyr"
- آشنایی با "ggplot2" و رسم اولین Scatter Plot از داده‌های ژنی
- آمار پایه
- مفاهیم آماری، p-value، t-test، ANOVA و همبستگی
- رسم نمودارهای پیشرفته با "ggplot2"
- آشنایی با تحلیل Differential Expression
- رسم Boxplot و معرفی پکیج "edgeR"

📅 تاریخ برگزاری: ۲ و ۳ مهرماه
⏰ زمان: ۱۷:۰۰ تا ۱۹:۰۰
🎓 همراه با گواهی معتبر دانشگاهی
🧪 دسترسی به محتوای آموزشی تا ۹۰ روز

🔴تخفیف گروهی:
▫️ ثبت‌نام ۳ نفره: ۱۰٪ تخفیف برای هر نفر
▫️ ثبت‌نام بیش از ۳ نفر: ۱۵٪ تخفیف

هزینه ثبت نام: ۶۶۸ هزار تومان

❌ جهت ثبت‌نام کلیک کنید

📞 پشتیبانی و ثبت نام گروهی در تلگرام و بله:
@exobiogen

🌱 همراه ما:
وبسایت | تلگرام | اینستاگرام | بله | لینکدین

🧬 آخر هفته همراه شما هستیم با کارگاه تحلیل داده‌های زیستی با زبان R

یادگیری R یکی از مهم‌ترین مهارت‌ها برای انجام تحلیل‌های علمی و آماری در پژوهش‌های زیستی است. تسلط بر این ابزار می‌تواند کیفیت تحلیل داده‌ها، نحوه ارائه نتایج و در نهایت سطح علمی مقالات را به شکل قابل توجهی ارتقا دهد.

⏳ مهلت ثبت‌نام این کارگاه تا پایان امشب است.
https://exobiogene.ir/workshop/detail/R-programming-workshop

📌 اگر قصد استفاده از تخفیف ثبت‌نام گروهی را دارید و هنوز هم‌گروهی پیدا نکرده‌اید، می‌توانید از طریق گروه پرسش و پاسخ اگزوبایوژن هم‌گروهی خود را پیدا کنید.
https://t.me/exobiogene_Qa

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🧬 اگر قصد یادگیری تحلیل RNA-seq را دارید...

به‌زودی در اگزوبایوژن کارگاه آنالیز RNA-seq برگزار خواهد شد.

نکته مهم این است که آشنایی با زبان R پیش‌نیاز این کارگاه محسوب می‌شود؛ زیرا بخش زیادی از تحلیل داده‌های RNA-seq در محیط R و RStudio انجام می‌شود.

اگر برای یادگیری بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیستی برنامه بلندمدت دارید، پیشنهاد می‌کنیم ابتدا آموزش R را در اولویت قرار دهید تا برای ورود به مباحث RNA-seq آمادگی بیشتری داشته باشید.

📌 جزئیات برگزاری کارگاه RNA-seq به‌زودی منتشر می‌شود.
لینک ثبت نام کارگاه زبان برنامه نویسی R:
https://exobiogene.ir/workshop/detail/R-programming-workshop

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene

🌿 نگاهی به زیست گیاهی | چرا بعضی برگ‌ها بنفش هستند؟


بنفش بودن برگ‌ها فقط یک ویژگی ظاهری نیست؛ این رنگ نتیجه تجمع رنگدانه‌هایی به نام آنتوسیانین‌ها (Anthocyanins) است؛ گروهی از فلاونوئیدها که نقش مهمی در فیزیولوژی گیاه دارند.

🧐 آنتوسیانین‌ها چه کاری انجام می‌دهند؟
🟣 محافظت در برابر نور شدید: جذب بخشی از نور و کاهش آسیب ناشی از تابش زیاد.
❄️ افزایش مقاومت به تنش‌های محیطی: مانند سرما، خشکی و شوری.
🛡️ خاصیت آنتی‌اکسیدانی: کاهش آسیب ناشی از گونه‌های فعال اکسیژن (ROS) در سلول‌های گیاهی.
🍃 دفاع در برابر عوامل بیماری‌زا و تنش‌های زیستی: در برخی گیاهان با فعال شدن مسیرهای دفاعی، تولید آنتوسیانین افزایش می‌یابد.

آیا هر برگ بنفش همیشه بنفش می‌ماند؟
خیر. در بسیاری از گونه‌ها، میزان تولید آنتوسیانین به نور، دما، مواد غذایی و مرحله رشد گیاه بستگی دارد؛ به همین دلیل ممکن است رنگ برگ‌ها در فصل‌ها یا شرایط مختلف تغییر کند.

💡 رنگ بنفش برگ‌ها نشانه‌ای از راهبردهای هوشمند گیاه برای سازگاری با محیط است.

اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene