Ковровая терапия

к другим новостям:

1. если вы записались на курс по иммуне, указали почту, а вам не пришел на нее инвайт, то это, вопреки общей закономерности, связано не со мной, а с тем, что вы, наверное, указали почту с ошибкой, или на не-gmail домене. Напишите, пожалуйста, в комменты или в директ канала.
2. я видел несколько сообщений в анонимных вопросах канала, на которые у меня не отправляется ответ, хотя в целом, ответы нормально отправляются. Если это про вас, то, возможно, у вас специфичные настройки приватности отправки сообщений, то есть дело, опять таки, не во мне.

если вам неприятно читать мое нытье в канале на личные вопросы, и вы подписывались ради какой-то интересной биологии — заранее прошу прощения, это повторится. Неоднократно. После того, как я текстуализировал свои эмоции про пхд мытарства мне стало чуточку легче, поэтому увы, так будет и дальше.

Некоторые подписчики уже знают, что уже несколько лет я очень хочу попасть на ESMO (кто не знает — самая большая конференция вне США по клинической онкологии). В прошлом году, пытаясь воплотить эту мечту, я подавался я на туристический испанский шенген, который имеет славу одного из самых лояльных к людям с моим гражданством, и получил, конечно же, отказ за "отсутствие обоснования пребывания". Из ~20 моих коллег, подававшихся на эту визу в тот раз, отказ был только у меня и еще одного человека. Ладно, ок, тогда-то я хотел проехать через Испанию транзитом. Неприятно, но шансы есть.

В этом году ESMO запланирована в Испании. Я подготовился основательно, указал, что еду на конференцию, инвайт-письмо, сопроводительное письмо, все возможные брони, пакет документов, перепроверенный невероятное количество раз — и снова получил отказ по тому же пункту.

Вы, наверное, на этом моменте уже устали от того, в какую сильную бытовуху скатился, не успев начаться, этот пост. Но речь о том, что два этих отказа последовательно совершенно подорвали мою веру в то, что я в принципе когда-то смогу получить шенген или съездить на конференцию мечты. Вероятно, если я когда-нибудь и попаду на ESMO, то это произойдет так нескоро, что я уже перегорю этим, и это будет уже каким-то чеховским крыжовником для меня. И ладно бы виза была американской — ее сейчас почти никому не дают, это ожидаемо, но тут ведь — один из самых простых шенгенов. На самом деле, эта ситуация как будто открывает во мне более глубокую травму — неуверенность в том, что мои академические цели в принципе достижимы. Я, в принципе, привык к парадигме, в которой у меня любые не чисто теоретические навыки осваиваются (еще со школы, наверное) намного тяжелее и дольше, чем у моей peer group — будь то какие-то навыки работы руками, программирование, или взаимодействие с государственной бюрократией любого государства (российского особенно). Я, в принципе, уже довольно спокойно отношусь к мысли, что чтобы достичь того же результата, что и моя peer group, мне надо намного больше усилий и времени. Но когда два года подряд не получается даже самая-самая дженерик базовая академическая штука "съездить на желаемую конфу в визово доступную страну", я начинаю сомневаться в том, стоит ли мне вообще касаться академической карьеры.

да, понятно, что есть еще апелляция (я подаюсь, но там положительный исход это скорее исключение из правил), что мне скажете про существование неплохих конференций в безвизовых странах, но все, честно говоря, очень слабо помогает с чувством того, что мне не дается даже самый минимум академической жизни. Я вообще очень долго совершенно отвергал майндсет того, что какой-то род деятельности может быть "не моим", тем более, что наука это то, что меня драйвит, чем я горю, это меня вдохновляет, и тому подобное. Но чем дальше, тем больше я вижу, что мои попытки заниматься этим только приносят мне разочарования в своих возможностях, а моим коллегам дополнительные проблемы из-за того, что у меня не получается то, что должно получаться у всех.

А, да, для полной картинки еще стоит добавить, что я в принципе не был на подобного уровня конференциях, особенно с постером, а в шенгене последний раз был в 2019 году.

а ведь это TRUTH NUKE, даже TRUTH H-BOMB

я много думаю о том, что есть какая-то глубокая социокультурная проблема в том, что в русском языке нет нормального слова для обозначения whistleblower. Разве что информатор, но это не совсем то. Доносчик — самое ближайшее, и явно несущее негативную коннотацию.

Даже не знаю, как вам сказать...

У лица, похожего на админа канала "Ковровая терапия" отлетела кукуха обострилось желание что-то приятное делать в преддверии нового сезона подач.

Я решил, так сказать, сконцентрировать весь свой опыт преподавания лекционных курсов по иммунологии для самых разных аудиторий, мой опыт наблюдения за десятками всяких-разных клинических испытаний в течении последних трех лет, и на основании всего этого концентрата сделать нечто новое — рассказать курс на открытую аудиторию. Вот прям для всех, не только для студентов или олимпиадников. Так, чтобы понравилось и слушателям, и мне самому. Считайте это официальным анонсом.

Курс лекций и семинаров "Иммунитет и инженерия". Будем говорить про самые основы функционирования иммунной системы, про то, что где вырезается в V(D)J-рекомбинации и в класс-свитчинге, а потом перейдем в мир иммунотерапий, трансплантаций костного мозга, онковакцин, клеточных терапий и всего такого. Поговорим про успешные и провальные клинические испытания, про биологические и чуть-чуть экономические проблемы препаратов.

топ-5 причин, на мой взгляд, прийти на этот курс:
1. бесплатно, свободно, онлайн. Если у меня будет горячка и я начну пульверизировать где-то на полпути, вы ничего не потеряете.
2. нишево. Не только попсовые анти-В-клеточные CAR-T и чек, но и экзотика типа CAR-NK, CAR-M, дендритноклеточных вакцин. Я найду чем вас удивить.
3. вайбово. Будем много обсуждать, задавать вопросы, возможно даже находить на них ответы. Иммунология — вообще штука смешная, ну, кроме тех моментов, когда грустная.
4. Низкий порог входа. Если понимаете центральную догму, слышали про существование рекомбинации и клеточного цикла — думаю, все легко поймете. Если нет — разберем, проговорим, объясним как-нибудь.
5. Все это в вечернее время, по субботам. Если на какой-то интересной лекции не удалось побывать — будет запись и аи слоп конспект.

В топ не включил, но если кому-то важно, у меня и лычки credentials есть: закончил кафедру иммунологии, работал в не последней (а во многих вопросах весьма даже первой) российской CAR-T-клеточной лаборатории, сейчас работаю в более индустриальной биомедицине, и провел реально много курсов по иммунологии на разных платформах и в разных форматах.

Буду рад совершенно любой аудитории. Полезнее всего, на мой скромный взгляд, будет врачам и другим представителям смежных областей — не-иммунологам.

В общем, 12 сентября, 18.00 по Москве, расскажу что куда и как, и почему вообще стоит заниматься инженерией иммунной системы. Добавляем в гугл-календарь, заполняем быструю гугл-форму, и жду вас в субботу (кроме fellow биофакеров (upd: и фббшников, как подсказывают в комментах), у них в эту субботу дела поважнее). А вот прям полноценно начнем с октября.

Если кому-то из подписчиков есть куда репостить — буду благодарен! Чем больше людей придет — тем больше шанс, что до конца курса все не разойдутся. А я правда хочу попробовать реализовать задуманное целиком, желательно не на пустую аудиторию.

Испытываю странное чувство кринжа от "скандала" с Анной Виленской, о котором уже реально каждый утюг пишет. Если кратко — уважаемая (тм) лекционная платформа выложила научпоп курс о средневековой музыке, который был сделан в худших традициях того, что называется пульверизация науки. Когда всякие опытные музыковеды начали копать, оказалось, что у авторки этого курса подобного рода пульверизация буквально везде. В итоге развернулась огромная дискуссия, прошедшая путь от бумербука, через твиттер и инсту, до мейнстримных СМИ. Не имея возможности и знаний оценить фактическую составляющую, я делюсь только своими эмоциями от наблюдения за этой всей дискуссией.

Наверное, надо было бы радоваться, ведь вот, наконец-то заговорили о тех проблемах русскоязычной миллениальской научпоп-тусовки, о которой в нашем уголке интернета и т.н. академической тусовки говорили годами. Но от того, во что превратилась дискуссия, я испытываю совершенно противоположные чувства. Да, у этой научпоп тусовки годами копились проблемы невероятного искажения материала в угоду красивой подачи; да, они сами культивировали в себе неадекватные представления о границе собственных знаний; да, ответ Виленской на критику "давайте вы все бесплатно запишете видеокомментарии к моим ошибкам, и мы из всего этого сделаем курс" — максимально неприятный и высокомерный; да, я все понимаю, и на каком-нибудь Ооците эту тему обсасывают реально годами.

Но! я-то думал, что дискуссия вокруг Виленской пойдет вширь, а не вглубь. Пойдет в русло того, чтобы обсудить проблемы всей этой научпоп-тусовки. Вспомнить, например, того же Дробышевского, для которого обычный вторник это написать книгу с огромным количеством ошибок, а потом разводить руками и предлагать академическому сообществу в их свободное от работы время бесплатно исправлять все его ошибки, чтобы он мог это пофиксить в следующей редакции. Вспомнить Александра Иванова с "Химии просто", который, например, в 2017 году занимался тем, что угрожал заявлением, кажется, в ментовку школьникам-олимпиадникам, шутившим про низкое научное качество его контента. Да полно таких примеров. Поговорить, может, о каких-нибудь социальных причинах, почему популяризация в формате "тусовочки" так быстро выродилась в пульверизацию.

Но нет. Срач пошел просто вглубь личности Виленской, и теперь те, кто раньше ее звал на эфиры, вспоминают все ее огрехи прошлого (коих много), обсуждают, какая она ужасная, и просто используют это как повод подтолкнуть падающего. Я понимаю, кстати говоря, почему этот срач так важен для музыковедов. Для них это гейткипинг области. Я и сам болезненно отношусь к тем, кто пульверизирует в моей области, а насчет средневековой музыки как-то никаких эмоций не испытываю. Но когда срач вышел далеко за пределы музыковедов и сейчас идет в основном среди людей, которым вообще до этой самой музыки никакого дела не было до этого момента, это выглядит как-то грустно. Да даже за Виленскую, честно говоря, мне искренне грустно. Пульверизаторские курсы продавали всей тусовкой, а отдувается публично, причем на мой взгляд диспропорционально (но это музыковеды только могут оценить), только она.

Я, кстати, уверен, что эти же самые ведущие, которые больше не будут звать Виленскую на эфиры по музыке, позовут к себе не более компетентного пульверизатора из другой области без тени сомнений.

я ничего не хотел писать по поводу скандала с Джейсоном Ардеем, и без меня вся лента этим забита. Мне как-то по-человечески жаль, что все закончилось так, как закончилось. В какой-нибудь альтернативной вселенной я бы хотел, чтобы он выжил, тихонько ушел отовсюду, а через лет 10 написал бы книжку про свои авантюры в духе Симплициссимуса.

Когда скандал только набирал обороты, я как-то не сообразил поначалу, почему имя и внешний вид Кофнаса (того, кто первый заговорил про мошенничество публично) мне так знакомы, где-то я его уже точно видел, задолго до этого скандала. А потом вдруг каааааак вспомнил.

Также, дополнительный комментарий по Карычу. Как мы ранее установили, имя CAR CARych явно намекает на химерный антигенный рецептор (CAR, chimeric antigen receptor). Поскольку Карыч дед, вряд ли это намек на невирусные криспровые кары. То есть явно мы имеем дело с каром (карычем), где конструкт был доставлен с помощью ретровирусного вектора.

Доказательная база того, что Карыч это ретроэлемент, на этом этапе уже практически неопровержимая.

Пост, который вы все, несомненно, хотели, но просто пока об этом не знали. Я думаю, читая этот канал, вы могли заподозрить, что молекулярную биологию я люблю, а олдфаги с передних рядов также знают, что я с большим уважением отношусь к киновселенной Смешариков. Поэтому вашему вниманию... то, что я придумывал буквально на ходу


Смешарики как транспозоны


Крош -- Alu-элемент, понятное дело. Он в каждую дырку пролезет.

Ёжик -- Transib. Во-первых, серия про Омск. Во-вторых, загадочный, иногда (серия Ежидзе) строит из себя больше, чем является, как с RAG рекомбиназами.

Бараш — Ac/Ds. Вот вся его страсть к разбрызгиванию чернил на свои же стихи это чисто же встраивание в гены пигментации початка кукурузы.

Пин — HTT, транспозоны, с которых у дрозофилы теломеры достраиваются. Тут, я думаю, все понятно, самый полезный из всех.

Нюша — тут осторожно предположу, что она — LINE1, ввиду ощущения собственной большой важности, переменчивости. В серии "как собрать друзей по-быстрому", где показывалась поездка на кровати (т.е. транспозиция из одного участка генома в другой), есть явный намек на то, что кровать — это белок-переносчик. Но, в целом, возможны и другие варианты, может она это что-то из cut-and-paste транспозонов, например, PiggyBac.

Карыч — явно ретротранспозон, думаю, что его частые рассказы о своей молодости и путешествиях это намек на LTR и его прошлое как ретровируса. Сюда же — то, что он не умеет летать, т.е. не способен к сборке капсида. Возможно, именно его env ген сделал возможным появление синцитиотрофобласта при формировании плаценты — на это нам жирно указывает тот факт, что чаще всего смешарики собирались дома именно у Карыча.

Лосяш — тут сложно, особенно ввиду серии про бабочку. Я думаю, что Лосяш это бактериальные самосплайсирующиеся интроны II группы. Объяснило бы его нравоучительно-снисходительный тон.

Совунья — гелитрон. Спортивное прошлое явно намекает на репликацию катящимся кольцом, хозяйственность — явно на адаптацию всяких там кусков генома.

Копатыч — моя ставка на Mutator-элемент, ввиду явной привязки к агрикультурам, а также наличию большого количества скрытых талантов при кажущейся простоте (диско, на мой взгляд, явный намек на частые мутации)

Мысль #2, пошлейшая, пошлейшая политическая сатира


Когда-то, вечность назад, меня очень забавляло и улыбало то, что на аватарке у небезызвестного академического телеграм-канала (а на тот момент еще паблика вк) "Зоопарк из слоновой кости" стоит ментат Харконненов из игры Дюна-2. Это приобрело для меня куда больший смысл сейчас, когда админы этого канала высказываются в поддержку политики лысого Владимира.

Две абсолютно не связанные между собой мысли, максимально случайные по своему генезису. А еще мне сегодня еще отказ пришел, так что надо коупить постами.

#1
Подписчики, знакомые с моим лором достаточно глубоко (а таких тут достаточно), знают, что большую часть своего детства и подросткового возраста я был book nerd, а на стыке старших классов и первых курсов биофака происходила моя стремительная трансформация в social butterfly. Так вот. Рефлексируя над тем, как я вообще в последнее время составлял сиви для всех этих пхд программ, я понял, что намного больше ценю какие-то свои достижения, связанные не с нердовскими вещами, а как раз с социальными. Ну, то есть, например, какие-нибудь всеросы и прочие олимпиады и близко не стоят к тому, например, что на четвертом курсе я инициировал постковидное возрождение фестиваля карьеры на биофаке (это, наверное, вообще пик моих достижений). Во всяких там исключительно интеллектуальных соревнованиях, как будто, просто наедине с собой проставляешь галочки в бланк, ничего сложного. А вот организовать эвент, скоординировать кучу людей... здесь, как будто, это настолько непредсказуемо, настолько сложно, что я как будто куда больше могу гордиться тем, что это на определенном уровне умею.

И тот мой not yet disclosed проект, который, как я писал, эмоционально намного важнее, чем PhD, и который, как я очень надеюсь, однажды выстрелит — у меня столько мотивации заниматься им именно потому, что там я чувствую, насколько сильно это все зависит от моих social butterfly скиллов по сравнению с количеством и качеством каких-то там академических знаний.

спасибо, что написали про то, что влияют не только гены. Кстати говоря, ROC-AUC предиктивной модели влияния именно генов на побочные действия был чота типа 0.6. Получше, конечно, чем бросок монетки, но... это очень далеко от того, чтобы хоть как-то делать надежные предсказания на основе этих самых SNP. Ну, то есть, вы от каких-то внешних факторов без учета генетики скорее предскажите побочные эффекты, чем от генетики.

(скрины, на основании которых я сделал, так скажем, выводы и пошел строчить вот этот вот пост)

Давненько здесь не постили про лучшие вариант-интерпретационные практики компании Генотек, а с задних рядов, между тем, спрашивают "когда уже?".

Если кто-то забыл, начало этой эпопеи, про SNP предрасположенности к 175+ IQ из GWAS Пломина вы можете почитать здесь.

Итак, недавно, как мне сказали с задних парт, они завезли SNP на фармакогеномику семаглутида и тирзепатида (удивительное дело, но про оземпик на этом канале уже тоже есть серия постов). Под капотом — SNP из вот этой статьи. Статья эта содержит полногеномный поиск ассоциаций с эффективностью и возможными побочными эффектами от семаглутида) и тирзепатида (Mounjaro). Поиск был полногеномным, но хоть что-то значимое нашлось только в аллельных вариантах генов, кодирующих непосредственно рецепторы-мишени. Для семаглутида это только GLP1R, а для тирзепатида это GLP1R и GIPR.

Давайте разбираться.
А в том, что эта статья показывает, что никакие из вариантов не могут быть связаны с усиленным или ослабленным ответом с достаточным уровнем доказательности.

Самый их "хороший" вариант в гене GLP1R (p.P7L, rs10305420; если вам это что-то скажет), ассоциирован у них с лучшей потерей веса на обоих препаратах. Но сама величина эффекта довольно низкая — носители этой благоприятной аллели теряли на ~0.70 процентных пунктов больше. В пересчете на килограммы (от авторов статьи, я не перепроверял) это будет на 0.7 потерянных кг лучше для гетерозиготных носителей аллели, и на 1.4 кг лучше для носителей генотипа Т-Т в гомозиготе.
Другие варианты из статьи, особенно варианты, ассоциированные с побочными эффектами, никаких однозначных данных не давали. Хуже того, один из вариантов вовсе был охарактеризован с противоположным эффектом от лекарств, нежели в более ранних статьях.

Для того, чтобы регистрировать потерю массы тела своей когорты пациентов, авторы ориентировались на те эффекты, о которых сообщили сами пациенты (self-report). Они сами говорили, что это имеет очень серьезные ограничения, и валидировали свои данные на внешней когорте (то есть других людях), по данным из медицинских учреждений (Electronic Health Record). И, как несложно догадаться, пациенты из исследования сообщают о том, что потеряли больше, чем зафиксировали врачи на внешней когорте. Для побочных же эффектов авторы полностью полагались на самих пациентов, и не делали внешнюю валидацию.
В общем, данные шумные, хоть и интересные. Те SNP, которые были вынесены как значимые, скорее всего, действительно могут за что-то отвечать. Тот же GLP1R p.P7L до этого возникал в литературе как связанные с различными метаболическими состояниями, от диабета 2 типа, до коронарной недостаточности. Но связь с фармакогеномикой конкретно этих двух препаратов тут неочевидная. Возможно, что P7L просто улучшает свойства GLP1R вне зависимости от действия на него оземпика, и для таких людей любой сброс веса будет чуточку легче. А возможно, что это просто шум от данных, и никакой ассоциации там вообще нет.
Но дело не в статье.

Дело в том, что Генотек, в своем стиле, опять игнорирует шаг интерпретации данных. Есть какой-то вариант, который выстрелил в GWAS с нормальным p-value? Пихаем в тест, и радуемся. А что, в тесте же мелким шрифтом где-то написано, что связь не казуативная. Я, кстати, вообще не удивлюсь, что раз они пишут не только про эффективность, но и про побочные эффекты, там не только P7L/rs10305420, но и еще более призрачно значимые варианты из этой статьи. Да, понятно, что поп-генетика это не медицинская генетика, и им не нужно следовать ACMG-гайдам. Но какая-то критическая интерпретация данных должна быть? Генотек использует термин "уровни доказательности", ну или LOE, говоря по-нашему. И вот в мире генотека это что-то совсем другое, нежели в остальном мире. Уж не знаю, какой уровень доказательности они дали полиморфизмам из этого исследования, но мне кидали скрины, где полиморфизмы из каких-то древних GWAS нулевых, которые потом никто никогда не повторял, имели уровень доказательности 2B. Ребят, это 4 (самый нижний уровень), максимум! И то, если у интерпретатора будет хорошее настроение.

ну хотя нет, ладно, я загнул про то, что никакие гайды Генотеку не указ. Одно дело, когда они там пишут про 175 IQ гениев на основании трех интронных снипов с огромной аллельной частотой. Это глупо, это некритично, но это никому не навредит. А вот если они напишут повышенный риск рвоты при приеме оземпика на основании какого-то SNP из этого исследования — это уже может повлечь медицинский выбор, может привести к отказу от препарата или, там, снижению дозировок. С учетом того, насколько часто сейчас все эти похудейка-препараты люди сами себе "выписывают", Генотек буквально дает информацию, которая может повлечь медицинские решения, на основании практически шума. И мелкий шрифт тут едва ли поможет.

Не любой, еще раз, не любой SNP из даже самого хорошего GWAS, даже с самым малюсеньким p-value, должен попадать в результаты как связанный с клиническим фенотипом вариант.

третья часть

за прошедшие полтора дня мне много людей написали, кто с мыслями, а кто с советами, контактами и так далее. Очень-очень благодарен всем, и рад, что пост вызвал такой отклик.

Но, как я заметил, как минимум несколько человек с этого поста поймали дизмораль. Поэтому, как будто, стоит сделать несколько важных оговорок, и поделиться с вами еще большим количеством деталей.
Во-первых, пожалуйста, не надо экстраполировать мои переживания на себя! Мой опыт — только мой, и если не получилось у меня, не значит, что не получится у вас. Во-вторых, самое главное, если вы правда хотите какую-то интересную пхд позицию, и понимаете, зачем она вам — попробуйте. Я, конечно, не гожусь на роль советчика в таких вопросах, но, как мне кажется, страх перед подачами во многом преодолевается, как только начинаешь это делать. Может даже с каких-то позиций, которые вам не очень нравятся, которые выглядят вторично — чтобы не страшно было получить отказ.

Во-вторых, я не хочу, чтобы мой пост воспринимался как "вот, я сделал все так хорошо и правильно, но все равно ничего не получилось". Моя стратегия подач была довольно хаотичной, некоторые вещи я осознал уже после окончания подач в Америку, а некоторые — вообще только сейчас. А ведь еще ничего не закончено. Может, через 2-3 года я вообще офигею от количества ошибок, которые я допустил сейчас.

Ну и чтобы предостеречь кого-нибудь от своих граблей, ну и просто поделиться с вами — вот список того, что я сам однозначно осознал как свои ошибки.

1. Я начинал эту подачу вообще с одним сиви на все. Очень глупо, это я осознал уже в середине подач. Кто не знает мой лор, у меня есть и опыт мокрой лабы и очень разношерстая биоинформатика. Когда-то я думал, что подобное сиви повышает мою ценность как человека, который понимает полный цикл получения и обработки биологических данных, а, заодно, и дает больше опций, но... нет, ребят, если я пишу в мотивационном письме про конкретные проекты, которые либо мокрые, либо сухие — огромное количество опыта в сиви считывается принимающей стороной как "нерелевантное". Человек хочет на белковый дизайн, но большая часть сиви про NGS, Т-клеточные репертуары и проточную цитометрию? Misalignment, следующий!
где-то к февралю-марту у меня уже было 3 основных сиви для позиций с разным фокусом, условно "Мокрая иммунология", "Классическая биоинформатика" и "Структурка".

2. Когда я подавался в США, я много времени вкладывал в то, чтобы установить контакт именно с интересующим меня завлабом. При том, что в составлении списков на интервью эти завлабы не участвуют. Все эти Virtual Webinars от admission committees я игнорировал. А стоило бы сходить и послушать, что хотят и думают именно те люди, которые будут рассматривать заявки.

3. Заявок в США было мало. Application fees — это очень неприятно, но ожидать успеха всего с трех заявок, из которых одна это Стенфорд, а другая — в Лигу Плюща, было самонадеянно. В следующий раз минимум штук 20 надо, я еще совершенно не придумал, как я вывезу, но, наверное, надо отказываться от привычки переписывать одно мотивационное по несколько раз.

4. Пункт, который мне казался совершенно незначительным, но... Я поначалу писал имейлы европейским профессорам так, будто они американские. В Европе, судя по всему, намного больше смотрят на формальности, быть "классным и дружелюбным" в имейле работает так себе, хотя исключения бывают. До тех пор пока завлаб не ответил тебе неформально, европейское академическое письмо это челобитная Великому Сюзерену в высоком Замке из слоновой кости в намного большей степени, чем американское.
Но это я, после того, как Мадина увидела одно из таких моих писем, довольно быстро пофиксил — ценой ошибки была всего парочка холодных имейлов.

4. Наверное, несмотря на все свои усилия НЕ САМООБЕСЦЕНИВАТЬ, я все-таки недостаточно много уделил времени всяким extracurriculars в сиви. Вернее, для США я написал про это довольно много, тем более, что у всех трех университетов про это были отдельные поля в заявке, ну и американцы точно подобное любят. А вот с европейцами, честно говоря, я не знал, как быть. Слышал, что они, особенно немецкоязычные, вообще не очень относятся даже к факту совмещения работы, учебы и научной деятельности, а если поверх этого еще и экстракуррикулары — может вообще сыграть против. В общем, на сомнениях о европейском академическом менталитете я потратил тоже довольно много времени, и итоговые сиви на европейские позиции часто вообще никакого упоминания экстракуррикуларов не содержали. Не думаю, правда, что эта ошибка стоила мне многого.

4.1 Не ошибка, но одна вещь, которую я выявил у себя в процессе размышления о всех этих дополнительных активностях. Оказывается, у меня есть комплексы русскоязычной неполноценности. "Я сделал образовательные курсы по молекулярке... — но любой курс, созданный не на английском, не считается."
"Паблик вк на 250к подписчиков по биохимии? это вк, подсанкционная проклятая соцсеть, я лучше вообще не буду упоминать", и так далее. Вообще, в какой-то момент я балансировал между "надо рассказать про крутую штуку, которую я делал" и "чем меньше в моих заявках и текстах будет любых упоминаний РФ — тем лучше". Баланс пока не был найден, но, думаю, что надо будет в ближайшие месяцы все же сделать где-нибудь какой-нибудь смешной курс иммуны на английском.

5. Еще было не очень понятно, как артикулировать в мотивашках свои мидл-авторные статьи. Понятно, что "надо написать, в чем заключался именно мой вклад" an so on. Но это иногда очень сильно ломает выстраиваемый нарратив. Я пока не научился делать это хорошо. Мне кажется, что первоавторная статья, даже в средненьком мдпи, будет намного более понятной сущностью. В мидл-авторной, наверное, часто будут исходить из презумпции "рядом стоял".

6. Ну и, конечно, случались и самые обычные косяки, вроде плохого тайм-менеджмента, периодического выгорания, переключения на более важные проекты (надеюсь, однажды я смогу рассказать тут), ну, короче, все самые банальные человеческие вещи.
И это, наверное, я еще не все вспомнил.

Мораль, получается, в том, что не нужно ловить дизмораль. Я ошибался много, я даже не пытался делать идеально, я делал как мог. Вполне возможно, и даже весьма-весьма вероятно, что у тех, кто, прочитав мой пост, демотивировался подаваться на академические позиции, получится это сделать намного лучше, чем у меня. Ну и я еще поборюсь тоже за место под солнцем грантами.

кста, сегодня еще один отказ пришел

а еще подачи на пхд были для меня какой-то огромной эмоциональной нагрузкой. И, наверное, главный экшен айтем этого поста для тех, кто собирается идти по этому пути страданий — это лучше не делать в одиночку. Рядом со мной были мои близкие, мои друзья, коллеги. Люди, которые меня поддерживали, которые ревьювили мои мотивационные письма в несколько раундов в свое свободное время. Которые были ментально рядом во время периодических мелтдаунов из-за очередной пачки отказов. Многие из вас сейчас читают этот пост. Спасибо вам большое, ребят. То, что меня окружают такие люди — на самом деле говорит о куда большем, чем наличие или отсутствие какого угодно оффера и какой угодно научной степени.

Ну и, конечно, романтическая история, главный сюжетный поворот, без которого тон этого поста мог бы быть намного мрачнее. Я был очень внимателен к тому, что пишут люди из моего окружения, и кто из них переживает тот же этап что и я. И как-то я прокомментировал один пост в нишевом канале, как раз на тему пхд подач. С этого началась моя совместная история с ныне самым близким для меня человеком. Мадина была рядом со мной в моменты, когда стена гостинга от европейских профессоров казалась совершенно непробиваемой. В периоды самых тяжелых мелтдаунов, когда я думал, что я совершенно неконкурентоспособен и проиграл гонку еще на том этапе, когда не опубликовал ни одной первоавторной работы за время бакалавриата. Переубеждать меня в подобных максималистских мыслях — это очень тяжелый и неблагодарный труд, я, честно, до сих пор удивляюсь, как Мадина и мои друзья это все вывозили.

Так вот, хоть это звучит банально, хоть оффера у меня до сих пор нет, но есть то, что намного важнее, чем какой-то там докторат.
Может, если я продолжу грести дальше, то, глядишь, что-то и с оффером получится.

[2/2, я никогда не запомню, с какого объема телега посты сплитит и по какой логике...]

Итак, после Нового 2026 года, я решил пытать счастья в Европе. Лабы, в которые я там метил, были очень разного уровня, от реально топовых до ноунеймовых, но с цепляющей темой. Как я уже говорил, географический фактор в силу моих специфичных целей и ожиданий от пхд был для меня сильно важнее, чем обычно. Поэтому всякие там средиземноморские страны, где мог бы быть низкий конкурс, маленький городок и абсолютно никакого движа, я практически не рассматривал (хотя были и исключения).

Европейские подачи и холодные имейлы были намного хуже американских. Единственный несомненный плюс — в Европе хотя бы нет application fees, а то бы я совсем разорился. В отличие от американских профессоров, получить хотя бы какой-нибудь ответ от европейского профессора, даже банальное "нет мест" — иногда становится квестом. Кто-то отвечает только на линкедине, и не чекает почту. Кто-то гостит везде. Да, конечно, завлабам пишут очень много, письма запросто теряются, и таких, как мое — могут быть сотни. Нооо! Если написать европейскому завлабу, у которого точно есть деньги, и который, например, участвует в пхд программе (то есть точно имеет позиции) — шанс ответа значительно повышается.
Моя гипотеза в том, что дело не в потерянных письмах, погребенных в входящих, а в том, что если у европейского профессора нет позиций или, например, он не хочет нанимать человека "извне", он чаще просто игнорирует письмо, потому что это "дешевле", чем потратить минуту на то, чтобы набрать, что позиций нет.


Кстати, для моего опыта, исключением среди европейцев являются шведы. На смешной выборке моих холодных имейлов, все (n=3) шведские профессора отвечали быстро, и отвечали всегда больше, чем дежурная отписка. К одному из них, например, у меня есть активная заявка (ну или та, по которой я еще не успел получить отказ), а с другим мы договорились созвониться после того, как он вернется из своего долгого европейского отпуска — то есть, не раньше конца августа. И это при том что я, в основном, обходил Швецию стороной. Говорят, что там одна из самых проблематичных иммиграционок для обладателей красного паспорта, и все запросы на разрешения на пхд работу для россиян проходят аж через через тамошнюю гебуху.

Еще одно наблюдение из разряда "вода мокрая" — пользу варм интро сложно переоценить. Даже упоминание каких-то общих знакомых или контактов не только значительно повышало шанс ответа на холодное письмо, но и в целом НАМНОГО бустило какое-то желание моего адресата уделить мне чуть больше времени, чем время написания стандартного "мест нет". Мне кажется, что если у меня в итоге что-то и выстрелит раньше, чем в 2027, то именно что-то из таких теплых контактов.

Другой инсайт был для меня весьма болезненным. Во время очередного рассказа про свою ситуацию одному из моих друзей (Дима С, спасибо!), мне посоветовали искать себе не пхд, а годовые позиции рисерч ассоца или стажера, пусть даже за сущие копейки (а позиций такого рода, которые платят не копейки, в Европе пока не наблюдается). Идея тратить целый год на работу за минималку просто чтобы зарекомендовать себя в какой-то лабе, которая потом еще не факт, что станет лабой для пхд была мне как-то очень болезненна. Я живу в майндсете о том, что нет ничего ценнее, чем время, и тратить целый год жизни на то, что мне тогда казалось инвестицией с очень низким ROI, мне было страшно. Тем не менее, я поборол и гордость, и страх, и начал включать строчки о возможностях стажировки в свои письма. И однажды это даже сыграло — у завлабы не было PhD позиций, но поискать любые возможности для стажировки (за которую мне даже ветку не заплатят, все за свой счет) она обещала. Возможно, если бы я ставил в топик письма стажировку, а не PhD, то сработало бы еще лучше, но на такой эксперимент у меня уже как-то не хватало душевных сил. В любом случае, этот разговор был полезным холодным душем.
Когда все остальные говорят "у тебя все получится, у тебя сильное сиви и хорошие письма, продолжай подаваться", и вдруг слышишь "нет, сейчас у тебя нет нужных вводных, тебе надо сильно снизить планку и искать более низкоуровневые возможности", то вскрывается сразу очень много комплексов, страхов и всего такого. Не знаю, насколько в итоге этот совет мне поможет, но я рад, что мне удалось преодолеть свой страх.

Одна из целей почему я вообще пишу этот пост — поныть структурировать, какие эмоции я вообще чувствую. С одной стороны, конечно, это огромная фрустрация. Ровно год назад я был в состоянии того, что заниматься тем, чем я хочу — это чисто логистическая проблема, и если я смогу все хорошо организовать, структурировать свое время, хорошо расставлять приоритеты, то все получится так или иначе. Сейчас намного сильнее стало ощущение непробиваемой каменной стены, теперь мой мозг уже даже не может как-то думать о том, что поступление вообще возможно. Если до этого я как-то думал, как выстраивать свою жизнь если меня возьмут в место А, место Б и так далее, то сейчас это все отодвинулось в разряд вещей с вероятностью достаточно низкой, чтобы о них всерьез думать — "если хоть куда-нибудь возьмут, то уж как-нибудь решу".

С другой — есть жизнь и помимо пхд подач. Я понимаю, чем хочу заниматься, и к какой цели иду, и совершенно не могу себе позволить разочароваться в науке/своей дисциплине/своих проектах. Я понимаю, что ну, я очень привилегирован, что за весь этот год меня ни разу не посетила мысль "А может все бросить, и инвестировать свое время в какой-нибудь более благодарный труд?". Как бы мне ни были интересны другие области, я занимаюсь иммунологией, и в наибольшей степени смогу реализовать свой потенциал именно там. Может я потом поплачусь за такой майндсет, и буду жалеть о времени, которое могло бы быть потрачено на изучение теорвера на собес на кванта, но... сейчас я вижу это так, и любое отступление от цели делать большие биомедицинские проекты выглядит для меня как что-то временное и вспомогательное, что должно так или иначе способствовать прогрессу именно в иммуне.

Я понимаю, что пхд это только средство, а не цель, и параллельно с подачами я ищу любые другие возможности реализовать свои идеи вне стандартного академического трека. Все эти пути куда более сложные, но зато менее формализированные и не такие бюрократизированные. Если какой-нибудь из них вдруг выстрелит, то пхд уже и не так сильно нужен будет. А еще, из-за того, что их больше, наборы там чаще и все намного более персонализировано, мне намного спокойнее дается получать отказы.

Ну и впереди новый сезон подач, на котором надо будет как-то выложиться на максимум, наверное. Особенно в том, что касается США. Скорее всего, все станет еще хуже с конкуренцией, но по крайней мере, у меня вышла еще одна статья, и может какой-нибудь препринт тоже успею. В общем, ай гесс, главное не останавливаться, пока не вышел из гонки — не проиграл (ага, лудоманы говорят также!).