В сосуд с большой концентрацией акриламида/бис можно добавить бромфеноловый синий. Это удобно для отслеживания смешивания. И для контроля градиента в геле. Но нужно добавлять больше - на геле БФС был не виден.

Здесь еще что улучшать:
1) В резервуар “heavy” можно добавить еще один мешальник, чтобы выровнять объемы
2) В “light” раствор можно добавить сахарозу для повышения плотности и чтобы градиент был более ровный
3) Оптимизировать концентрацию персульфата аммония и темеда