ФНС предъявила претензии более чем 50 резидентам «Сколково»

Налоговые органы предъявили претензии более чем 50 компаниям за 2023–2025 годы. Речь идет о резидентах «Сколково», которые потеряли право на льготы фонда и в том же году попытались перейти на льготы для аккредитованных ИТ-компаний. Налоговая сочла такой переход слишком быстрым: сначала нужно заплатить по полной ставке, а уже потом снова думать о льготах. Всего на конец 2025 года в «Сколково» числилось около 5,5 тыс. резидентов.

Льгота «Сколково» по налогу на прибыль действует, пока выручка не превысит 1 млрд рублей, а накопленная прибыль — 300 млн рублей. После превышения обоих порогов ФНС требует пересчитать налог с начала года по полной ставке: 20% за 2024 год и 25% с 2025 года. К сумме также добавляются пени, чтобы переход к взрослому бизнесу запомнился надолго.

Компании считают, что после утраты льготы «Сколково» они могут применить ставку для ИТ-компаний: 0% в 2022–2024 годах и 5% в 2025–2030 годах. ФНС настаивает, что перейти на нее можно только со следующего года. Юристы называют этот подход спорным: до второй половины 2025 года сами инспекторы советовали подавать уточненные декларации и использовать ИТ-льготу. Затем, судя по всему, рекомендации уточнили еще раз.

С 2026 года правила стали однозначнее. Компаниям, которые одновременно являются резидентами «Сколково» и аккредитованными ИТ-компаниями, теперь нужно выбрать один набор льгот. Совмещать их больше нельзя. Одновременно выросли страховые взносы: для ИТ-компаний ставка составляет 15% в пределах годовой зарплаты 2,98 млн рублей и 7,6% с суммы выше этого порога.

Еще одна зона риска — дробление бизнеса ради налоговой экономии. В реестре Минцифры находится более 20 тыс. ИТ-компаний, около 5% уже попали в поле зрения ФНС. Налоговая проверяет штат, происхождение выручки и движение денег. Особый интерес вызывают случаи, когда прибыль основного бизнеса внезапно обнаруживает в себе технологические способности и переезжает в льготную ИТ-компанию.