В 1987 году японские биологи из Осакского университета изучали один ген кишечной палочки. По соседству с ним они заметили странный участок ДНК: короткая последовательность повторялась раз за разом, а между повторами стояли разные вставки. Что это такое, исследователи не поняли и честно написали в статье, что биологическое значение находки неизвестно.
Через 33 года за метод, который вырос из этих повторов, дали Нобелевскую премию. Это был CRISPR – технология редактирования генов, на которой сегодня строят лекарства.
Теперь похожее “что-то” заметила нейросеть. Anthropic рассказала, как агенты Claude Mythos 5 разбирали огромную базу генетических последовательностей и нашли в ДНК вирусов, поражающих бактерии, неописанную систему. В ней три части: фермент, который переписывает РНК в ДНК, длинный ряд повторов перед ним и белок-партнер. Anthropic назвала находку ART.
В CRISPR повторы работают как картотека. Между ними бактерия хранит кусочки ДНК вирусов, которые на нее уже нападали, и по этим записям белок находит врага и режет его. Подложите свою запись – и он разрежет нужное вам место. Поэтому CRISPR и стал инструментом.
Первый эксперимент с ART показал одно сходство с CRISPR: ряд повторов нарезается на отдельные короткие РНК. Что делает сама система, пока не знает никто, включая авторов. Не доказано даже, что фермент в ней работает.
Повторы Mythos 5 искать никто не просил. Агентам поручили другое: найти у таких ферментов новых “напарников” – белки, которые постоянно встречаются рядом с ними и, видимо, работают в паре. Дальше агенты действовали сами, 21 час без участия людей.
Первый напарник оказался ложным: рядом с ферментом стоял обычный ген самого вируса. Агент разобрался и отверг связь – это просто порядок генов, никакого партнерства. Но фермент показался ему похожим на бактериальные системы защиты, и он оставил задачу присмотреться к нему еще раз.
Такие ферменты у бактерий обычно работают в паре с РНК, записанной прямо перед ними. Следующему агенту поручили заглянуть туда. Он загрузил почти три тысячи букв сырой ДНК и написал:
Это потрясающе: я вижу на глаз ряд повторов… это что, как у CRISPR?!
Через пару строк агент сам себя одернул:
Хотя стоп, надо подумать еще раз.
Агент подозревал простое – вдруг такое уже описано? Агенты посчитали повторы, сверили находку с CRISPR и другими известными системами, прошлись по литературе и только потом отправили отчет людям.
Сам фермент ученые нашли еще в 2021 году, когда расшифровывали геном одного из таких вирусов. Они даже предположили, что перед ним записана РНК, но ни о повторах, ни о белке-партнере не написали.
Повторить этот путь агенты не смогли. Anthropic запустила ту же работу еще десять раз – с той же задачей и в той же системе. Почти в каждом прогоне эти ферменты попадали агентам в выборку, а в двух прогонах агенты даже брались их изучать. Но в ДНК перед ферментом так никто и не заглянул, и повторы остались незамеченными во всех десяти попытках.
Авторы объясняют это огромным объемом информации и тем, что система агентов каждый раз ведет себя по-разному – ИИ-агенты выбирают один маршрут из множества. Получается, что Claude Mythos 5 в этот раз… просто повезло?
Чтобы не зависеть от везения, в Anthropic разбирают, какие гипотезы агентов стоят проверки, и учат Claude этому научному чутью. Ну а ART предстоит проверить в лаборатории, чтобы понять – стоит ли за этой находкой нечто большее.
Биология начинает проходить тот же путь, что код, а затем математика. Только там решение проверяет программа, а здесь – лаборатория. Цена находки падает, но прежней остается цена проверки – то есть ученых с пробирками. Когда-нибудь ИИ ускорит и проверку.
P.S. Ролик в начале текста собран Claude Opus 5.5 специально под этот пост. В подписке я скоро опубликую лонгрид, как управлять этой замечательной моделью, в том числе – делать подобные видео и другие классные штуки. Так что самое время присоединиться:
— Читать на “Бусти”
— Читать на Sponsr