Когда нужно или можно внедрять такой системный подход в работе с диссертацией?

Встречный вопрос: а когда для достижения цели нужна правильная тактика? Да всегда!

Поэтому система нужна в диссертации на любом этапе работы ✔️

На раннем этапе — сразу соберете матрицу работы нужным образом. Скорректируете стратегию, под нее проработаете тактику.

На поздних этапах работы, когда объемы текста есть, но либо надо многое поменять либо не нравится куда все пришло, — филигранно работу откорректируете, заставив по-другому и нужным образом заиграть уже сделанные наработки, приведя работу к искомому.