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单细胞基础知识补充1-R数据格式（RData、RDA、RDS）

写在前面：开始做单细胞之前，报班或者看视频之后：好像也不是那么难，做的时候发现无数的坑。因为没什么生信基础知识。这些写教程的老六们，不会去写基础知识，导致感觉我学的单细胞测序和别人的不一样。今天开个单细胞基础知识补充系，给生信初入门的小伙伴填个那些生信老六留下的坑。

rds是R语言中利用二进制保存的源文件，加载readr包以后，使用write_rds(x,file='x.rds')保存文件，read_rds('x.rds')读取文件，比csv的好处是加载rds文件时不需要花时间再进行列项匹配，速度更快。

读写RDS格式文件

# 1、导出RDS文件
saveRDS(iris,file="iris.RDS")

# 2、读取RDS文件
#2.1 直接双击已有的RDS文件，用Rstudio打开即可,会自动出现这样的代码
iris <- readRDS("C:/Users/Administrator/Desktop/R/Rdata/iris.RDS")

#2.2用readRDS函数：还是同理，若是工作路径下文件，则直接输入文件名；否则，得输入文件的绝对路径；再者可以使用file.choose()参数。
x<-readRDS("iris.RDS")

读写RData格式文件

RData格式文件类似于项目文件，上一次操作后，加载的包，保存的对象都还在，再次打开后可以接着进行编码。

# 1、导出RData文件
save(iris,iris3,file="iris.RData")

# 2、读取RData文件 : 直接双击已有的RData文件，用Rstudio打开即可,会自动出现这样的代码
load("C:/Users/Administrator/Desktop/R/Rdata/iris.RData")

# 3、导出RData文件保存当前工作空间中的所有对象:保存在默认工作路径，写一下文件名即可
save.image(file="allobject.RData")

参考链接：
R语言读写R格式文件2021.2.24
R数据格式：RData、RDA、RDS？
单细胞-傻瓜式Seurat的rds文件转Scanpy的h5ad文件

via 简书