Число иммунных генов у Clupea harengus (сельди атлантической) значительно превышает их число у человека, а также у любых позвоночных животных, утверждает международная группа ученых под руководством Texas A&M University.
🧬Они изучали гены сельди, относящиеся к главному комплексу гистосовместимости - большой области генома, играющему важную роль в иммунной системе и развитии иммунитета. С помощью комплекса гистосовместимости организм распознает чужеродные белки – вирусы, бактерии, паразиты, что мобилизует его на защиту от патогенов. Большее генетическое разнообразие комплекса гистосовместимости обеспечивает более надежную защиту от болезней.
Впервые в истории исследователи провели методом PacBio long-read секвенирование геномов 14 особей сельди: 6 из Кельтского моря, 6 – из Балтийского, 2 - из Норвежского. Этот вид мигрирует по Северной Атлантике стаями, численность рыб в которых может достигать 1 млрд. В ходе секвенирования получили детальную информацию о последовательностях ДНК в ядре и митохондриях. Для анализа использовали 29 гаплоидных (с одинарным набором хромосом) геномных наборов.
Оказалось, что участки молекул главного комплекса гистосовместимости у разных особей сильно различаются. К тому же число генов этого комплекса варьирует от особи к особи: разные сельди имеют разные комбинации иммунных генов, поэтому иммунный профиль каждой – уникален.
✅По мнению ученых, это удивительное разнообразие - результат миллионов лет естественного отбора, в ходе которого атлантическая сельдь адаптировалась к защите от постоянно меняющегося набора патогенов. Ранее ученым удалось обнаружить у сельди множество генов, способствующих экологической адаптации к различиям в солености воды, времени нереста, температуре и освещенности. Теперь выявлена широкая способность к защите от болезней.
Профессор Leif Andersson из Uppsala University (Швеция):
«Важно применить этот подход (PacBio long-read sequencing) к другим видам, чтобы выяснить, характерен ли экстремальный уровень генетического разнообразия только для таких многочисленных видов, как сельдь, или он встречается чаще, чем считалось ранее».
фото: B. Ueberschär, www.fishbase.de