9 сентября 1922 года институт получил наименование Академия Воздушного Флота имени Н. Е. Жуковского.
17 апреля 1925 года академия была переименована в Военно-воздушную академию РККА имени профессора Н. Е. Жуковского.
6 августа 1946 года академия получила название Военно-воздушная инженерная академия имени профессора Н. Е. Жуковского.
В 1998 году при реорганизации военного образования академия была переименована в Военный авиационный технический университет (ВАТУ), но в 2002 году ей вновь вернули название Военно-воздушная инженерная академия и имя профессора Н. Е. Жуковского.
В настоящее время учебное заведение известно как Военный учебно-научный центр Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени профессора Н. Е. Жуковского и Ю. А. Гагарина».