TGViewer
Zmall Pharma Zmall Pharma @smallpharm · 3.32K subscribers
Post #5940 569

Forwarded from Сфероиды и ствижженое

Кольцоид из клеток HEK-293t, z-контраст (разные цвета по высоте). Изначальный диаметр около 800 мкм. Сделан методом агарозных микроячеек с кольцоидным молдом.

Чтобы получить эту картинку пришлось использовать множество магических практик.

Во первых изначально он, как и сфероиды, слишком толстый, чтобы его просветить моим конфокальником, поэтому я использовал экспансионную микроскопию как способ просветления.

Во вторых после экспансии он стал слишком большой (порядка 3 мм в диаметре), поэтому снимал я его 9 кусочками, которые потом склеивал при помощи BigStitcher в ImageJ.

А в третьих он ещё и в геле лежал под углом, поэтому в том же ImageJ его пришлось поворачивать.

Муторно, но результат мне нравится, когда разберусь с текущими делами поколдую с тем, чтобы из этих картинок поизвлекать какие-нибудь умные данные: расстояние между клетками, зернистость хроматина, все такое.

В комментах ещё картинки и сравнение с непросветленным сфероидом.
More from @smallpharm
  1. Oct 1, 2026photo post
  2. Sep 30, 2026photo post
  3. Sep 30, 2026#зоопарк_одобряет В ФИАН придумали спектральный метод, позволяющий быстро отличить донорск…
  4. Sep 30, 2026Где-то в альтернативной вселенной, где случился Евросоюз от Лиссабона до Владивостока и ма…
  5. Sep 30, 2026Использование ИИшек стало вызывать у меня подозрительно знакомое, но давным-давно забытое…
  6. Sep 30, 2026video post
Threads Profile ViewerView any public Threads profile without an account.Open ThreadLook →Writing with AI? Make it sound human.Metric37 rewrites AI drafts so they read naturally. Free AI detector, 1,500 words free.Try Metric37 →