Кольцоид из клеток HEK-293t, z-контраст (разные цвета по высоте). Изначальный диаметр около 800 мкм. Сделан методом агарозных микроячеек с кольцоидным молдом.
Чтобы получить эту картинку пришлось использовать множество магических практик.
Во первых изначально он, как и сфероиды, слишком толстый, чтобы его просветить моим конфокальником, поэтому я использовал экспансионную микроскопию как способ просветления.
Во вторых после экспансии он стал слишком большой (порядка 3 мм в диаметре), поэтому снимал я его 9 кусочками, которые потом склеивал при помощи BigStitcher в ImageJ.
А в третьих он ещё и в геле лежал под углом, поэтому в том же ImageJ его пришлось поворачивать.
Муторно, но результат мне нравится, когда разберусь с текущими делами поколдую с тем, чтобы из этих картинок поизвлекать какие-нибудь умные данные: расстояние между клетками, зернистость хроматина, все такое.
В комментах ещё картинки и сравнение с непросветленным сфероидом.
Post #5940
569
Forwarded from Сфероиды и ствижженое