Вышло! Работа ~50 человек (а если учитывать сбор всех-всех образцов, то сильно больше), годы в ревью и вот оно на бумаге.
Лично для меня это был сайд-квест в длинные ковидные вечера и, скорее всего, мое последнее соприкосновение с популяционной генетикой.
Коротко:
В работе представлено 1537 (из них 799 прежде не опубликованных) образцов из 139 этнических групп Азии и Южной Америки и с помощью их анализа пытаемся восстановить историю миграций из восточной Сибири в Америку.
Но начнем с Сибири: северные европейцы и популяции центральной Азии и нынешней Сибири имеют общее происхождение с Кетами и Ненцами. Популяции около Берингова пролива (Чукотка и Камчатка), а именно, Коряки, Инуиты и Луораветланы (более известные как Чукчи) значительно отличаются от остальной Сибири с генетическими вариантами, связанными с жировым метаболизмом, термогенезом и регуляцией репродуктивных и иммунных функций.
Наиболее раннее известное присутствие людей около Берингова пролива оценивается как 31 600 лет назад, но когда же точная дата его перехода неизвестна. Есть археологические находки, датированные возрастом 12 700 лет (восточная Монтана) и 23 000 лет. Разделение между популяциями северной Евразии и коренными Американцами по оценке произошло 19-27 000 лет назад, что согласуется с археологическим находками. Определить конкретную популяцию Сибири в роли прямого предка коренных Американцев, впрочем, не удалось. Коряки и Инуиты имеют наибольшее сходство с образцами коренных Американцев из-за локальных обратных миграций, происходивших 700 -- 5000 лет назад.
Разделение коренных американцев на Северных и Южных произошло 14 500 - 17 500 тысяч лет назад. Новоприбывшие в Южную Америку поделились на 4 группы по локации: Amazonians, Andeans, Chaco, Patagonians (10-14 000 лет назад). Из-за изолированности групп по в силу сложного ландшафта и изначально узкого перехода через Центральную Америку, генетическое разнообразие уменьшено. Это, например, видно по уменьшенной гетерозиготности генов HLA, что влияет на способность сопротивляться новым патогенам.
Post #4963
1.44K
Forwarded from Strong baseline
Science From North Asia to South America: Tracing the longest human migration through genomic sequencing Genome sequencing of 1537 individuals from 139 ethnic groups reveals the genetic characteristics of understudied populations in North Asia and South America. Our analysis demonstrates that West Siberian ancestry, represented by the Kets and Nenets, ...- 🔥 12
- 👍 3