TGViewer
Channel Public Channel
کانال تک سلول scRNA-SEQ

کانال تک سلول scRNA-SEQ

@singlecel

💐 شرکت زی ژن فناوری 💐
🔴در این کانال اطلاعات مربوط به آنالیز بیان تک سلول یا Single cell گفته می شود.
🖥️ برگزاری کارگاه آموزشی حضوری و آنلاین
ارتباط و سوالات👇
@ahmad_mousavi
09101662586
💐شرکت زی ژن
@zigene_tech
Subscribers
249
Photos
20
Videos
5
Links
6

Showing posts older than #12 · Back to latest

Older Posts 7 shown
Post #9 104
👨‍🏫 #آموزش

🔴 از کجا میتونم 📶 آنالیز single cell rnaseq رو یاد بگیرم؟ چه برنامه نویسی رو باید یاد بگیرم؟

⏮️ جواب سریع: پکیج Seurat


🔴 برنامه نویسی R
۱. مقدمات R
۲. پکیج Seurat
۳. پکیج Moncle
۴. پکیج Slingshot

🟢 برنامه نویسی پایتون
۱. پکیج Scanpy


کانال تک سلول👇
@singlecel
  • 👌 1
Post #5 104
🔴🖥️ در مقاله "Single cell transcriptomics comes of age"، کاربردهای روش ترنسکریپتومیکس تک‌سلولی به طور جامع توضیح داده شده‌اند. این روش به عنوان یک ابزار قدرتمند برای تحلیل دقیق سلول‌ها و درک بهتر بیولوژی و بیماری‌ها معرفی شده است.

🔴 شناسایی انواع سلول‌ها در بافت‌های مختلف است. با استفاده از این روش، محققان می‌توانند انواع مختلف سلول‌ها را شناسایی کرده و تفاوت‌های آن‌ها را بررسی کنند. این امر به ویژه در بافت‌های پیچیده مانند مغز و سیستم ایمنی بسیار مفید است.

🟢 درک شبکه‌های تنظیمی یکی دیگر از کاربردهای مهم این تکنولوژی است. ترنسکریپتومیکس تک‌سلولی به محققان امکان می‌دهد تا شبکه‌های پیچیده تنظیمی و ارتباطات سلولی را بهتر درک کنند. این اطلاعات می‌تواند به شناسایی مسیرهای سیگنال‌دهی و تنظیم ژن‌ها کمک کند.

🌸 در زمینه پزشکی، این تکنولوژی برای تشخیص بیماری‌ها بسیار مفید است. با تحلیل سلول‌های بیمار، محققان می‌توانند تغییرات ژنتیکی و مولکولی را شناسایی کرده و به درک بهتری از مکانیسم‌های بیماری‌ها برسند. این اطلاعات می‌تواند به توسعه درمان‌های جدید و شخصی‌سازی شده کمک کند.

#مقاله
دانلود مقاله 👇👇

کانال تک سلول
Post #4 244
🤓🖥️ #آموزش
#مهم

🔴🟢 ⏮️ مراحل آنالیز داده های Single cell rnaseq:

🆕 برای آنالیز داده‌های سینگل سل بیان ژن با استفاده از نرم‌افزار R و بسته Seurat، مراحل کلی به شرح زیر است:

1. وارد کردن داده‌ها: داده‌های خام را به نرم‌افزار R وارد می‌کنید.
2. پیش‌پردازش داده‌ها: شامل فیلتر کردن سلول‌ها و ژن‌ها، نرمال‌سازی داده‌ها و شناسایی ژن‌های متغیر است. (Seurat)
3. کاهش ابعاد داده‌ها: با استفاده از روش‌هایی مانند PCA، ابعاد داده‌ها را کاهش می‌دهید.(Seurat)
4. کلاسترینگ سلول‌ها: سلول‌ها را بر اساس ویژگی‌هایشان به گروه‌های مختلف تقسیم می‌کنید.(Seurat)
5. بصری‌سازی داده‌ها: با استفاده از روش‌هایی مانند UMAP یا t-SNE، داده‌ها را به صورت گرافیکی نمایش می‌دهید.(Seurat)

🤓 این مراحل به شما کمک می‌کنند تا داده‌های سینگل سل را تحلیل و تفسیر کنید. 😊💐



🤓🖥️ آموزش پکیج سورات Seurat 👇

🟢 https://satijalab.org/seurat/


😍🌸 کانال تک سلول 👇👇
@singlecel
Post #3 570
🟢🆕 معرفی تکنیک سینگل سل
( RNASEQ Single-Cell)


🔴 تعریف سینگل سل:
سینگل سل (Single-Cell) به مجموعه‌ای از تکنیک‌ها و روش‌ها اطلاق می‌شود که به پژوهشگران این امکان را می‌دهد تا سلول‌ها را به صورت فردی مطالعه کنند. این تکنیک‌ها به ویژه در زمینه‌های زیست‌شناسی سلولی، ژنتیک و پزشکی حائز اهمیت هستند، زیرا عملکرد و رفتار سلولی در سطح تک‌سلولی می‌تواند با رفتارهای جمعی متفاوت باشد.

🔴 اهمیت سینگل سل:
1. تنوع سلولی: تکنیک سینگل سل به پژوهشگران کمک می‌کند تا تنوع سلولی موجود در بافت‌ها و اندام‌های مختلف را شناسایی و تحلیل کنند. با مطالعه سلول‌ها به صورت فردی، می‌توان به درک بهتری از ویژگی‌ها و عملکردهای منحصر به فرد هر سلول دست یافت.

2. پاسخ به درمان: در تحقیقات پزشکی، این تکنیک می‌تواند به درک بهتر پاسخ سلول‌ها به درمان‌های مختلف، به ویژه در سرطان و بیماری‌های ژنتیکی کمک کند. با تحلیل‌های سینگل سل، می‌توان استراتژی‌های درمانی را بهینه‌سازی کرد.

3. تشخیص و درمان بیماری: سینگل سل می‌تواند در شناسایی و تشخیص زودهنگام بیماری‌های مختلف، از جمله سرطان، و همچنین در شناسایی زیربنیادهای مولکولی بیماری‌ها مفید باشد.

🔴 روش‌ها:
تکنیک‌های متعددی برای مطالعه سینگل سل وجود دارد، از جمله:
- سیکوئنسینگ تک‌سلول (Single-Cell RNA Sequencing): این روش به مطالعه بیان ژن‌ها در سطح تک‌سلولی می‌پردازد.
- فلوئورسانس-ایمیونوسیتوشیمی (Flow Cytometry): این روش به شمارش و تحلیل سلول‌ها بر اساس ویژگی‌های سطحی و داخلی آن‌ها کمک می‌کند.
- میکروسکوپ فلورسانس و تصویربرداری تک‌سلول (Single-Cell Imaging): به تصویربرداری و تحلیل رفتار سلولی در زمان واقعی و در محیط‌های مختلف کمک می‌کند.

🟢 چالش‌ها:
توسعه تکنیک‌های سینگل سل با چالش‌هایی نظیر کمبود دقت در تشخیص و تحلیل داده‌های پیچیده همراه است. همچنین، پردازش و تجزیه و تحلیل داده‌های به‌دست‌آمده نیازمند مهارت‌های تخصصی و محاسباتی می‌باشد.

⚫ 🆕 نتیجه‌گیری
سینگل سل به عنوان یک ابزار قدرتمند در زیست‌شناسی مدرن، امکان درک عمیق‌تری از فیزیولوژی سلولی و پاسخ‌های بیولوژیک را فراهم می‌کند. این تکنیک با پتانسیل‌های بالای خود، می‌تواند به تدوین راهکارهایی نوین در علوم پایه و بالینی منجر شود.
__
⚪🌸🔴 کانا
ل تک سلول 👇👇
@singlecel
Post #2 100
بسم الله الرحمن الرحیم
Post #1
Channel created
Threads Profile ViewerView any public Threads profile without an account.Open ThreadLook →Writing with AI? Make it sound human.Metric37 rewrites AI drafts so they read naturally. Free AI detector, 1,500 words free.Try Metric37 →