🤓🖥️ #آموزش
#مهم
🔴🟢 ⏮️ مراحل آنالیز داده های Single cell rnaseq:
🆕 برای آنالیز دادههای سینگل سل بیان ژن با استفاده از نرمافزار R و بسته Seurat، مراحل کلی به شرح زیر است:
1. وارد کردن دادهها: دادههای خام را به نرمافزار R وارد میکنید.
2. پیشپردازش دادهها: شامل فیلتر کردن سلولها و ژنها، نرمالسازی دادهها و شناسایی ژنهای متغیر است. (Seurat)
3. کاهش ابعاد دادهها: با استفاده از روشهایی مانند PCA، ابعاد دادهها را کاهش میدهید.(Seurat)
4. کلاسترینگ سلولها: سلولها را بر اساس ویژگیهایشان به گروههای مختلف تقسیم میکنید.(Seurat)
5. بصریسازی دادهها: با استفاده از روشهایی مانند UMAP یا t-SNE، دادهها را به صورت گرافیکی نمایش میدهید.(Seurat)
🤓 این مراحل به شما کمک میکنند تا دادههای سینگل سل را تحلیل و تفسیر کنید. 😊💐
🤓🖥️ آموزش پکیج سورات Seurat 👇
🟢 https://satijalab.org/seurat/
😍🌸 کانال تک سلول 👇👇
@singlecel
Post #4
244
