Post #1044
1.15K
Forwarded from Liza Loves Biology
Пару лет назад я написала для Биомолекулы @biomolecula статью о курьезном случае использования системы CRISPR-Cas фагами для выяснения отношений друг с другом. Но, похоже, фаги, тем или иным образом получившие системы CRISPR-Cas и использующие их для борьбы с "коллегами по цеху", точно не единичны, хотя и редки. Недавно группа нобелевского лауреата Дженнифер Даудны опубликовала в Cell результаты метагеномного анализа фаговых геномов из разных сред. Нашли много интересного, в частности, оказалось, что фаги смогли разжиться системами CRISPR-Cas всех шести типов, которые на данный момент выделяют, хотя часто в фаговых системах оказываются утраченными какие-то компоненты. Тем не менее, похоже, демо-версии CRISPR-системы многим фагам вполне хватает. Впрочем, всего лишь 0,4% известных на данный момент фагов имеют CRISPR-систему; для сравнения, CRISPR-Cas есть в геномах 40% бактерий и 85% архей. В той же работе у одной группы фагов был найден очень крутой эффекторный белок Casλ, который имеет все предпосылки для того, чтобы найти применение в редактировании генома: по своим рабочим характеристикам он не уступает Cas12a, зато гораздо мельче размером. По аминокислотной последовательности этот белок ни на что не похож, а РНК, с которой он взаимодействует, имеет совершенно уникальную вторичную структуру.
Биомолекула Как вирусы воюют друг с другом при помощи систем CRISPR/Cas Сейчас сложно найти молекулярного биолога, который бы не знал про систему CRISPR/Cas, обеспечивающую адаптивный иммунитет бактерий и архей против виру