Если вы всё‑таки соглашаетесь на какие‑то работы, которые в скоуп не входили, обязательно нужно зафиксировать это письмом. И обязательно ответным письмом Заказчик должен это согласовать. Люди увольняются, нюансы за давностью событий забываются, и вспомнить потом, почему вы это сделали, кто вас просил и на каких условиях вы это согласовали, без такой фактуры будет очень проблематично. Доказано горьким опытом.