آزمایشگاه نوروسینتکس - فصل 2 - قسمت 5 - Two-photon calcium imaging of neuronal activity

در مجموعه جلسات آزمایشگاه علوم اعصاب، تلاش می‌کنیم خود را جای پژوهشگران مقالات علمی قرار داده و پرسش‌ها و رویکردهای آن‌ها را نقد کنیم. با استفاده از داده‌های به اشتراک‌گذاشته‌شده، به روش‌های متنوع تحلیل داده‌ها آشنا می‌شویم.

محتوای این جلسه:

Why optical imaging?
The principles of fluorescence calcium imaging
Pipeline of two-photon calcium imaging
Types of calcium indicators
Expressing GECIs in the brain
Considerations for choosing calcium indicators
Common window preparations for in vivo imaging
Components of a 2P microscope
2PCI analysis pipeline with Suite2p
Image Registration
Source localization and activity extraction
Neuropil
Spike inference
Convolution due to kinetics of GECI fluorescence
Limitations of 2p calcium imaging



کانال تلگرام:
https://t.me/Neuro_Syntax