Mehr | مهرداد عامری

اگر با هر دوره ای پیش میرین یا حتی به صورت خودآموز اندک تجربه‌ای در برنامه نویسی R دارین، مطالعه این کتاب رو بهتون توصیه میکنم.



کمک میکنه توی R برای آنالیز داده‌های مختلف، خیلی قوی‌تر پیش برین



⭕️ اگر هیچ تجربه برنامه نویسی ندارین این کتاب و کتب دیگه ممکنه روند آموزشی رو براتون سخت و فرسایشی کنن (نه الزاما، ولی این احتمال هست و موارد مشابهی رو دیدم)




✅ بهترین مورد برای شروع برنامه نویسی و تسریع فرآیند یادگیری R و هر زبان دیگه‌ای، پیش رفتن با یک دوره یا کلاس آموزشیه و به موازات اون خوبه که کتاب و منابع توی اینترنت رو برای تقویت سطح دنبال کنید.



@mehr_ameri

بهترین ابزار برای آنالیز داده های RNA-Seq


@mehr_ameri

موفق باشید آخرش کامل نیوفتاد 😂

اگه دوست دارید وارد فیلد آنالیز داده‌های RNA-Seq بشید و شرکت توی دوره‌های آموزشی براتون مقدور نیست، این مقاله یک راهنمای خوب هست که ذهنتون رو برای آنالیزهای پایه‌ای باز می‌کنه. توی ژورنال معتبری هم به چاپ رسیده.



#RNASeq



@mehr_ameri

داده های امیکس که برای مطالعات سیستمز بیولوژی استفاده میشن مثل:

- ژنومیکس
- ترنسکریپتومیکس
- پروتئومیکس
-متابولومیکس
- اپی‌ژنومیکس
- هر مدل امیکس دیگه


✅ معمولا از ترنسکریپتوم استفاده میشه، اونم به چند دلیل:

- راحت تر میشه به دست آوردش و تکنولوژی های مربوط به ترنسکریپتوم در دسترس تر هستن
- سال‌هاست که تکنولوژی های مربوط به الگوی بیان ژن باعث تولید حجم انبوهی اطلاعات از این دست شدن و دیتای زیادی توی دیتابیس ها به شکل رایگان وجود دارن
- اطلاعات نسبتا مفیدی رو در اختیار قرار میده چون ژن قبلا ازش محصولی تولید شده
- مسیرهای کاری متعددی برای آنالیز و کار با این مدل دیتا در دسترس هست



❌ باگ اصلی ترنسکریپتوم:

اگه با RNA های کدشونده کار داشته باشیم، چون در سطح RNA داریم مانور میدیم، تایید ژن هایی که به عنوان نتیجه نهایی بهشون میرسیم امر مهمیه، چون در سطح پروتئین هنوز تایید نشدن



مثلا اگر از روی داده ترنسکریپتوم ژنی رو به عنوان مارکر توی یک بیماری معرفی کردیم، Validation این مارکر خیلی مهم میشه



⭕️ درسته که رونویسی صورت گرفته، اما تضمینی نیست که پروتئین نهایی هم عملکردی تولید شده باشه





#سیستمز_بیولوژی



@mehr_ameri

رویکرد مطالعات سیستمز بیولوژی


@mehr_ameri

یه وبینار خوب:

https://www.linkedin.com/events/single-cellrna-seqintegration-m7150021563377958912/

اگه به بخش‌های ماشین لرنینگیش علاقه داشتین این مقاله رو بخونین حتما

مطالعات Multi-Omics Data Integration



@mehr_ameri

ما توی سیستمز بیولوژی معمولا با یک سطح از داده‌های امیکس کار می‌کنیم، مثل Transcriptomics، اما خب سطوح دیگه داده در این شرایط نادیده گرفته میشن. برای حل این مشکل، رویکردهای مبتنی بر Multi-Omics Data Integration معرفی شدن و این اواخر هم شدیدا دارن رشد چشم‌گیری رو تجربه می‌کنن. توی یه ویدئو الان براتون بیشتر توضیح میدم...

دوستان خوبم، شبتون بخیر باشه


روز بیوتک رو به همه دانشجویان و فعالین این حوزه تبریک میگم، براتون بهترین ها رو آرزو می‌کنم و امیدوارم به هر هدفی که دارید دست پیدا کنید 🌺


همچنین امیدوارم اونطور که شایسته هست قدرتون دونسته بشه و با قدرت و انگیزه، این مسیر و علم جذاب رو دنبال کنید 🙏❤️



@mehr_ameri

📣 ثبت نام مجدد در چالش ۵ روزه شفاف سازی هدف علمی به شیوه آفلاین آغاز شد


✅ در صورتی که به هر دلیل نتوانستید در این چالش به شکل آنلاین شرکت کنید، تمامی درسنامه‌های این چالش به شکل آفلاین از طریق وبسایت دایا زیست فناوران قابل ثبت نام و دریافت می‌باشند.


🎁 تخفیف به مدت محدود برای ثبت نام در این چالش فعال است.

لینک ثبت نام

@mehr_ameri

روز برنامه نویس مبارک 😍🌺


اگه مشتاق یادگیری زبان‌های پایتون و R هستید، تخفیف بسیار ویژه‌ای به مناسبت این روز برای این دو دوره درنظر گرفته شده، برای دریافت هدیه لطفا بهم پیام بدین تا تقدیم‌تون بشه 🙏🌺

⭕️ عزیزان ظرفیت چالش دیروز تکمیل شد، چون تعدادی از دوستان دیر با خبر شده بودن، فقط ۵ نفر ظرفیت جدید به برنامه اضافه شد‌، این ظرفیت فقط تا ساعت ۵ عصر فعاله



لینک ثبت نام:
https://dayazf.ir/challenge/

دوستان لینک گروه تلگرام برای همه شرکت کنندگان ارسال شده، هم از طریق ایمیل و هم پیامک

اگر دریافت نکردین ممنون میشم بهم اطلاع بدین، به این آیدی


@mehrdadameri

سلام و صبح بخیر


لینک گروه تلگرامی برای دوستانی که در چالش ثبت نام کردن از طریق ایمیل و پیامک ارسال شد.

⭕️ چند نکته مهم در مورد چالش ۵ روزه شفاف سازی هدف علمی:



1️⃣ این چالش دارای بازپخش برای شرکت کنندگان هست.

با توجه به وضعیت سرعت اینترنت که ممکنه در بعضی ساعات همراه با مشکلاتی باشه، جلسات آفلاین به شکل مجزا هم ضبط میشن و در اختیار شرکت کنندگان قرار می‌گیرن.





2️⃣ در کنار تمارین و تکنیک‌ها، نکات تکمیلی بیشتری به منظور درک بهتر بعضی مفاهیم مرتبط، آموزش داده میشن (مثلا اگر بر اساس یک شاخص خاص قرار هست ارزیابی هایی رو انجام بدیم، آموزش مفهوم اون شاخص رو هم دریافت می‌کنید و تنها به ارائه و انجام تمرین خالی بسنده نخواهد شد)





3️⃣ امکان پرسش و پاسخ در گروه تلگرامی مخصوص چالش طی این ۵ روز وجود داره و اگر ابهامی براتون وجود داشته باشه، من کنارتون هستم که اون مورد رو رفع کنید و طبق برنامه پیش بیاید.





4️⃣ این چالش در آینده به شکل آفلاین قابل ثبت نام خواهد بود، اما تخفیف فعلی به هیچ عنوان براش فعال نمیشه و تنها در صورت شرکت در مدل آنلاین این چالش، از تخفیف ۸۰ درصدی برخوردار خواهید شد.