داده های امیکس که برای مطالعات سیستمز بیولوژی استفاده میشن مثل:

- ژنومیکس
- ترنسکریپتومیکس
- پروتئومیکس
-متابولومیکس
- اپی‌ژنومیکس
- هر مدل امیکس دیگه


✅ معمولا از ترنسکریپتوم استفاده میشه، اونم به چند دلیل:

- راحت تر میشه به دست آوردش و تکنولوژی های مربوط به ترنسکریپتوم در دسترس تر هستن
- سال‌هاست که تکنولوژی های مربوط به الگوی بیان ژن باعث تولید حجم انبوهی اطلاعات از این دست شدن و دیتای زیادی توی دیتابیس ها به شکل رایگان وجود دارن
- اطلاعات نسبتا مفیدی رو در اختیار قرار میده چون ژن قبلا ازش محصولی تولید شده
- مسیرهای کاری متعددی برای آنالیز و کار با این مدل دیتا در دسترس هست



❌ باگ اصلی ترنسکریپتوم:

اگه با RNA های کدشونده کار داشته باشیم، چون در سطح RNA داریم مانور میدیم، تایید ژن هایی که به عنوان نتیجه نهایی بهشون میرسیم امر مهمیه، چون در سطح پروتئین هنوز تایید نشدن



مثلا اگر از روی داده ترنسکریپتوم ژنی رو به عنوان مارکر توی یک بیماری معرفی کردیم، Validation این مارکر خیلی مهم میشه



⭕️ درسته که رونویسی صورت گرفته، اما تضمینی نیست که پروتئین نهایی هم عملکردی تولید شده باشه





#سیستمز_بیولوژی



@mehr_ameri