ФБМФ МФТИ

Лекцию проведет Павел Мелентьев — главный научный сотрудник Института спектроскопии РАН, заведующий лабораторией оптических методов секвенирования молекул ДНК и
кафедрой нанооптики и спектроскопии МФТИ.

🔬 Идентификация группоспецифичных неканонических неоантигенов опухолевого происхождения, кодируемых Upstream Open Reading Frames, как потенциальных мишеней для иммунотерапии рака

🔬 Влияние концентрации фибробластов и частоты импульсов возбуждения на свойства проведения сердечной ткани

🔬 Биоинформатические методы для анализа NGS-данных в диагностике инфекций и геномном эпиднадзоре

🔬 Анализ митохондриального генома у пациенток с преэклампсией на основе данных неинвазивного пренатального тестирования (НИПТ)

🔬 Репертуары аллелей HLA и разнообразие T-клеточных рецепторов в различных злокачественных опухолях

🔬 Анализ ландшафта посттрансляционных модификаций в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера

🔬 Анализ данных транскриптома одиночных клеток нейроэндокринных опухолей гипофиза

🔹 Что такое эпигенетика и почему она не менее важна, чем генетика?
🔹 Как эпигенетические факторы влияют на отдельный организм и на целую популяцию?
🔹 Можно ли управлять этими факторами?

💬 Почему вы выбрали нашу кафедру?

Я выбрала эту магистратуру, так как хотела сменить свой профиль на биоинформатику, больше заниматься обработкой и анализом данных в своей лаборатории. Раньше я занималась больше "мокрой" частью, но захотелось глубже изучить и другую сторону.

💬 Какие дисциплины оказались самыми полезными и почему?

Мне понравились курсы по омиксным данным и системной биологии, так как в них было много практических заданий и мы изучали методы, которые потом могут пригодиться непосредственно в практике.

💬 Над чем вы сейчас работаете в рамках НИР?

Моя работа заключается в исследовании ассоциаций между генетическими вариациями вируса гепатита Б, профилем генов HLA хозяина и особенностями заболевания — такими, как цирроз печени и гепатоцеллюлярная карцинома —, которые могут приводить к летальным исходам. Используя полученные генетические маркеры, мы можем прогнозировать риски исходов. Для пациентов в высокой группе риска врачи смогут проводить более частые скрининги, что позволит ставить диагноз на ранних стадиях.

💬 Удаётся ли совмещать магистратуру и работу?

Да, в магистратуре предоставляется достаточно часов для работы в рамках НИР.

💬 Как магистратура изменила ваше понимание профессии?

За эти два года я открыла для себя, как много в этой области направлений, областей для изучения, интересных научных работ и умных, увлечённых людей.

💬 Почему вы выбрали нашу кафедру?

После получения базового образования в бакалавриате я начал искать магистратуру на стыке биологии и технологий — меня привлекала именно междисциплинарная область. Я увлёкся идеей соединения цифровых технологий и науки о живом, что в итоге привело меня на кафедру биотехнологии и инженерии биосистем. Мне интересно исследовать живые системы с опорой на современные методы и цифровые инструменты — в стремительно меняющемся мире это кажется мне особенно актуальным направлением.

💬 Какие дисциплины оказались самыми полезными и почему?

Лично для меня самыми полезными и интересными оказались «Изучение живых систем: от идей к научному знанию и технологиям» и «Прикладной искусственный интеллект и управление стрессом живых систем». Эти дисциплины позволили углубить понимание научных идей, путей, которыми шли знаменитые учёные, с какими трудностями сталкивались и как их преодолевали. Это дало более глубокое и целостное понимание науки. Так как ИИ непосредственно связан с моей работой, то дополнительное углубление в понимание его работы и применение к изучению живых систем стало крайне полезно с практической точки зрения.

💬 Над чем вы сейчас работаете в рамках НИР?

Сейчас я работаю над созданием "живых графов", инструмента на основе графовых клеточных автоматов с подключением нейронных сетей для моделирования процессов эволюции, более подробного их понимания и воспроизведения в компьютерном эксперименте. Данная технология так же может применяться как вычислительный резервуар для обработки данных, позволяя «выращивать» структуры под конкретные задачи, повышая их эффективность.

💬 Удаётся ли совмещать магистратуру и работу?

Да, вполне. Я трудоустроен инженером группы прикладного ИИ в моделировании биологических систем в ФИЦ Биотехнологии РАН, что позволяет не только в теории, но и на практике освоить необходимые в работе навыки и заниматься исследованиями по интересующей меня тематике.

💬 Как магистратура изменила ваше понимание профессии?

Думаю, что сделала его более целостным и осознанным. Если раньше наука воспринималась как нечто недостижимое, то теперь, больше погружаясь во внутренние перипетии и знакомясь с сопутствующими процессами, стала более понятной и человечной. Стало больше простора для высказывания и обсуждения идей, потому что к тебе уже относятся, как к специалисту, из-за чего ты становишься увереннее в себе.

В центре обсуждения — ингибирование фермента гиалуронансинтазы 2-го типа (HAS2) с помощью малых молекул и RNAi для лечения метаболических заболеваний печени. HAS2 — основной фермент, продуцирующий гиалуроновую кислоту (ГК), которая является ключевым компонентом внеклеточного матрикса. Помимо формирования водного геля, ГК выступает в роли сигнальной молекулы, взаимодействуя с рецепторами CD44, RHAMM, LYVE-1 и TLR-4. Повышенная выработка ГК ассоциирована с воспалением, аутоиммунными заболеваниями, онкогенезом и фиброзом печени.