Продолжаем знакомиться с проектами магистратуры ФБМФ! С чем предстоит столкнуться поступающим на кафедре системной и синтетической биологии 👇

😊 Разработка методов детекции эпидемических вспышек на основе больших данных биохимических анализов крови

Методы: агентное моделирование, бутстрэп, статистические тесты для обнаружения структурных сдвигов, сравнение статистических моделей информационным критерием Акаике, алгоритм динамической трансформации временной шкалы.

😊 Исследование применения нейронных сетей на основе модуля коррекции ошибок, имитирующих архитектуру мозжечка для сегментации медицинских изображений

В работе исследуется применение биологически инспирированной архитектуры нейронной сети, имитирующей мозжечок, для повышения робастности сегментации медицинских изображений. Предложена гибридная модель, объединяющая свёрточный энкодер-декодер с рекуррентной корой и модулем мозжечка для коррекции ошибок предсказания. Эксперименты проводились на МРТ-срезах левого предсердия в условиях стандартных данных, а также при наличии шума и прореживания последовательностей.

😊 Исследование зависимостей биохимических параметров крови в популяции Российской Федерации

Работа посвящена оценке структуры взаимосвязей рутинно сдаваемых параметров крови и влияния на нее возрастных факторов в популяции Российской Федерации. Методы: описательная статистика, когортная стратификация, графы для построяния структур взаимосвязей параметров.

😊 Автоматизация этапов пайплайна синтеза ДНК с использованием роботизированных станций дозирования

Работа посвящена автоматизации ключевых этапов пайплайна сборки ДНК с использованием лабораторных жидкостных роботов. В ней реализуются и оптимизируются процессы пулирования олигонуклеотидов, постановки ПЦР и выделения плазмид после клонирования. Основная цель — повысить воспроизводимость, снизить количество ручного труда в рутинных экспериментах и упростить масштабирование экспериментов.

😊 Применение сетевого анализа для идентификации генов-кандидатов, ассоциированных с ишемическим инсультом

Цель исследования — разработать методологию идентификации генов, ассоциированных с многофакторными заболеваниями путем обучения представлений генных сетей и решения задачи поиска новых генов-кандидатов методами машинного обучения. Используемые методы — обучение графовых нейронных сетей, алгоритмы классификации, кросс-видовой и кросс-тканевый анализ.

😊 Разработка метода генерации ансамбля конформаций для вычисления энергии сольватации молекулы

Цель работы — пределить допустимость предположения о конформационной близости двух биоизостеров с заменой H/F путём построения полного конформационного ансамбля методами молекулярной динамики. Количественно оценить степень ошибки, вносимой пренебрежение полного конформационного ансамбля при вычислении энергии сольватации свободных лигандов.