فرض کنید در یک مطالعه ترنسکریپتومیکس، صدها ژن با تغییر در میزان بیان شناسایی شدهاند. صرفاً داشتن یک فهرست طولانی از ژنها، اطلاعات کاملی درباره مکانیسمهای زیستی به ما نمیدهد.
در مرحله بعد، باید بررسی کنیم این ژنها چه نقشی دارند و در چه فرآیندها و مسیرهایی مشارکت میکنند.
برای مثال، تحلیل Gene Ontology (GO) میتواند اطلاعات ژنها را از سه جنبه بررسی کند:
▫️ Biological Process؛ این ژنها در چه فرآیندهای زیستی نقش دارند؟
▫️ Molecular Function؛ چه عملکردهای مولکولی دارند؟
▫️ Cellular Component؛ پروتئینهای مرتبط با آنها در کدام بخش سلول قرار دارند؟
همچنین با استفاده از تحلیل KEGG میتوان مسیرهای مولکولی مرتبط با ژنهای تغییریافته را شناسایی کرد.
در نتیجه، یک مسیر کلی میتواند به شکل زیر باشد:
Transcriptomic Data → Differential Expression → DEGs → GO/KEGG → Biological Interpretation
این تحلیلها کمک میکنند از یک مجموعه بزرگ از تغییرات بیان ژن، به سؤالهای زیستی مشخصتری برسیم:
🧬 کدام فرآیندهای زیستی در بیماری تغییر کردهاند؟
💊 سلول در پاسخ به یک درمان چه مسیرهایی را تغییر داده است؟
🔬 کدام مسیرهای مولکولی در یک شرایط خاص فعال یا سرکوب شدهاند؟
اگزوبایوژن همراه همیشگی شما🌱
Bot:@QuickExo_bot
Web:http://Exobiogene.ir
TEL & Ble: @exobiogene